中华蜜蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因全长转录本鉴定及分析

【目的】系统鉴定和分析中华蜜蜂(Apis cerana cerana)吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本,为深入开展相关基因和剪接体的功能研究奠定基础。【方法】基于前期已获得的高质量中华蜜蜂纳米孔长读段测序数据,通过Blast工具将全长转录本比对Nr数据库筛选出吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本。利用gffcompare软件将全长转录本与东方蜜蜂(Apis cerana)参考基因组上注释的转录本进行比较,鉴定未注释的新基因和新转录本。利用TAPIS pipeline预测和分析吞噬与包囊作用相关基因的可变多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)位点,并通过TBtools软件鉴定APA位点上游的基序(motif)。使用Astalavista软件鉴定可变剪接(alternative splicing,AS)事件,并通过IGV浏览器进行结构可视化。通过RT-PCR验证AS事件的真实性。【结果】共鉴定到中华蜜蜂吞噬与包囊作用相关的基因66个和全长转录本395条,发掘出东方蜜蜂参考基因组未注释的2个新基因和303条新转录本。对参考基因组已注释的34个基因进行了结构优化,分别延伸了18个基因的5′端和12个基因的3′端,同时延长了4个基因的5′端和3′端。共鉴定到含有1个及以上APA位点的吞噬与包囊作用相关基因47个,其中多于5个APA位点的基因最多,为32个。在APA位点上游鉴定到多个基序,一致性序列为：GRBGCNKSDAACAAYTRBGCBMRNGGBYAYTAYWCNVWNGG。共鉴定到吞噬与包囊作用相关基因的AS事件296次,其中包括131次可变3′端剪接(alternative 3′splice site,A3SS)、85次内含子保留(intron retention,IR)、70次可变5′端剪接(alternative 5′splice site,A5SS)和10次外显子跳跃(exon skipping, ES)。RT-PCR结果显示,扩增的目的片段大小符合预期,证实了随机选择的2次AS事件的真实性。【结论】系统鉴定了中华蜜蜂吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本以及AS事件和APA位点,优化了东方蜜蜂参考基因组注释的吞噬与包囊作用相关基因的结构。     

猪场如何有效控制猪弓形虫病

<正>1病原弓形虫病是由刚第弓形虫引起的一种原虫性疾病,猫及猫科动物是唯一可从粪便排出弓形虫卵囊的动物,猫在弓形虫病传播给猪及其他动物中起着重要作用,弓形虫在宿主体内因寄生的不同发育阶段所表现出来的形态各异。在其整个发育过程中分为5种类型,即滋养体、包囊、裂     

卤虫生物包囊在水产动物疾病防治中的研究现状及展望

在水产养殖中,“生物包囊”就是指以饵料生物作为载体包裹营养物质或药物,鱼虾通过摄食这种饵料生物达到营养强化、防治疾病等目的。本文以卤虫为代表,介绍了国内外利用生物包囊防治水产动物疾病方面的研究现状：包囊的优点、强化研究、药代学分析、防治效果等。并对研究中存在的问题和今后的研究方向进行了分析探讨。     

乐都县羊棘球蚴感染情况的调查

试验抽样调查乐都县屠宰羊棘球蚴感染情况,抽样羊781只,感染羊有231只,感染率为29.58%,包囊感染数686个,平均感染强度为2.97。其中肺脏感染的羊有99只,共检出包囊数321个,平均感染强度为3.24。肝脏感染的羊有103只,共检出包囊数307个,平均感染强度为2.98。     

浅谈肉品中常见寄生虫检疫和处理

生猪在屠宰过程中常见的寄生虫病对猪肉品质有很大的影响,处理不当易造成这些疫病的传播与流行,甚至会传染给人。由于这些寄生虫病的病原有一定的相似之处,在宰后检疫时易混淆,笔者结合实践,对这几种常见寄生虫病在检疫、鉴别、处理等方面进行探讨,力求实践中简单、实用,提高检疫效率。1猪囊尾蚴病俗称囊虫病由寄生在人体内的猪带绦虫的幼虫一猪囊尾蚴寄生于猪的肌肉和其他器官中引起的一种人兽共患的寄生虫病。     

快速检测猪旋毛虫病

旋毛虫病是由毛首目毛形科的旋毛形线虫引起的人畜共患寄生虫病,也是一种自然疫源性疾病。成虫寄生于肠管,幼虫寄生于横纹肌。人旋毛虫病可致人死亡,感染来源于摄入了生的或未煮熟的含旋毛虫包囊的猪肉,所以肉品卫生检验中将旋毛虫列为首要项目。     

浅析生猪屠宰检疫常见的几种病状鉴别

1囊尾蚴1.1寄生部位主要寄生于咬肌、深腹肌、股内侧肌、肩胛外侧肌、膈肌、舌肌。1.2肉眼观察虫体较大,易看到,长径6~10mm,短径约5mm,寄生位置肌纤维间,外观椭圆形。包囊     

梭形住肉孢子虫和巨型住肉孢子虫抗原的免疫特性研究

运用 ＣＩＥ和 ＥＬＩＳＡ对两种住肉孢子虫全包裹抗原及包裹各部分抗原的免疫特性进行了分析研究;结果表明;两种住肉孢子虫与同种或异种住肉孢子虫阳性血清具有强烈的交叉反应,包囊各部分抗原以缓殖子抗原免疫反应最强．     

实验性感染山羊脑内弓形虫包裹检查方法比较

６只实验性感染弓形虫的山羊于感染后４０－４２ｄ扑杀,采用小鼠生物学检查法,直接镜检和免疫酶组织化学法检查脑内弓形虫包囊。结果三种方法均可检到脑内弓形虫包囊,其中免疫酶组织化学法优于其它两种方法。     

一种改进型麦克马斯特虫卵计数板的应用效果研究

为了评价一种改进型麦克马斯特虫卵计数板的性能,利用改进型麦克马斯特虫卵计数板和经典麦克马斯特虫卵计数板对兔粪便样品和球虫卵囊悬液样品进行计数和比较分析。结果显示,用饱和氯化钠溶液作为漂浮液,改进型麦克马斯特虫卵计数板能对卵囊悬液样品和2~5 g固体粪便样品中球虫卵囊进行准确计数,与麦克马斯特虫卵计数板计数结果的符合率为95.59%~99.49%;用自来水作为悬浮液,改进型麦克马斯特虫卵计数板能对卵囊悬液样品和0.3~0.5 g固体粪便样品中球虫卵囊进行准确计数。本研究发现,改进型麦克马斯特虫卵计数板对临床和实验室样品中虫卵能进行准确计数,而且比经典麦克马斯特虫卵计数板具有更强大的检测功能。