Recent progress in molecular biology of Crimean-Congo hemorrhagic fever

Crimean–Congo hemorrhagic fever (CCHF) is a severe hemorrhagic fever in humans with a case fatality rate of up to 50%. A causative agent of CCHF is CCHF virus, which is a tick-borne virus in the family Bunyaviridae, genus Nairovirus. The virus is transmitted to humans through infected tick bites, squashed ticks or from direct contact with viremic animals or humans. Outbreaks of CCHF have been documented in Africa, the Middle East, Eastern Europe and Western Asia where the vector and/or reservoir ticks of Hyalomma spp. are distributed. Recent advances in molecular and biochemical analyses of CCHF virus revealed that the virus encodes larger proteins compared to other genus of Bunyavirus and the processing of viral proteins are complicated. Recent studies also showed that the CCHF viruses are relatively divergent in its genome sequence and the viruses are grouped in seven different clades. In general, these phylogenetic analyses based on sequences of S-RNA and L-RNA segment of CCHF viruses indicate that the seven clades correlate with their geographical location. The phylogenetic topology based on M-RNA segment sequences of CCHF viruses is different from those based on S-RNA and L-RNA segments. These analyses indicate that M-RNA segment reassortment events occur more frequently than those in S- and L-RNA segments.     

Use of remote sensing tools to predict focal areas for sea turtle conservation in the south-western Atlantic

1. Fisheries bycatch of non-target species in the commercial fleet is a major source of anthropogenic injury and mortality for sea turtles and marine megafauna.
2. The Río de la Plata maritime front (RLPMF) and its adjacent international waters – comprising part of the Argentine and Uruguayan exclusive economic zones, is a highly important fishing ground in the south-western Atlantic Ocean as well as feeding and development grounds for sea turtles.
3. This paper analyses the distribution of the bottom and pelagic trawling fishery within the RLPMF using information from Vessel Satellite Monitoring System. With this information, areas of highest trawling intensity were defined and further evaluated their overlap with sea turtle habitat-use areas from available sea turtle satellite tracking information.
4. Results besides identifying high-susceptibility areas for sea turtle bycatch by the commercial trawler fleet along the RLPMF, provide predictive tools to identify vulnerable areas to interaction of sea turtles and the commercial fishing fleet.
5. Implementation of bycatch mitigation measures, such as reduced fishing effort areas by the Argentine and Uruguayan fisheries management agencies has the potential to benefit the fisheries as well as marine megafauna. Furthermore, there is a need for additional research on the impact that this fleet can have on sea turtles present in the area.

     

History, origin and extent of soil erosion on Easter Island (Rapa Nui)

The isolated Easter Island (Rapa Nui) is an outstanding example of land degradation caused by land use in a sensitive ecosystem. The focus of the investigation was placed on Poike peninsula, the most eastern part of Rapa Nui. While Poike peninsula was once supplied with fertile soils, in large areas desertification takes place today. Detailed analysis of soil profiles allowed the reconstruction of the history and of causes and effects of soil erosion and gullying in the context of land use history and cultural evolution. The results of the stratigraphic analysis prove that from the beginning of human settlement around AD 300/600 until AD 1280 the agriculture on Poike peninsula was characterised by sustainable land use and a traditional type of agro-forestry. Soil erosion was not significant. At around AD 1280 the woodland on Poike, dominated by the endemic palm Jubaea sp., was cleared by slashing and burning. Intensive farming on the upper slopes of the volcanic peninsula resulted in sheet erosion lasting until the 20th century. Settlements and ceremonial places which were built around AD 1300 on downslope areas were buried soon by sediments. Agriculture ceased around AD 1400 on downslope areas as the fertile soils were completely eroded. From AD 1400 until the late 19th century sheet erosion and the accumulation of fine-layered sediments migrated upslope. On average 8.6 Mg of soil per hectare and per year were reworked by erosion (eroded and accumulated within the catchment). Gullying began on Rapa Nui with the sudden increase in the number of sheep during the early 20th century. Gullies are still developing on the island and their ongoing enlargement created extended badlands on Poike which pose a significant problem for ecological and archaeological conservation strategies. Gullying rates exceed 190 Mg ha^{− 1} y^{− 1}.     

Comparaison des aptitudes parasitaires de clones de Trichoderma vis-a-vis de quelques champignons a sclerotes

Nineteen monoconidial isolates (referred to as clones) of Trichoderma from different species aggregates, one isolate of Gliocladium virens, and one isolate of an Acrostalagmus sp. (that was naturally associated with sclerotia of Sclerotinia spp and Macrophomina phaseolina) were tested. They were incubated in controlled conditions, in sterile soil, with sclerotia of Corticium rolfsii, Sclerotinia minor, or S. sclerotiorum. At the end of appropriate periods of incubation (respectively 26, 20 and 8 days), the sclerotia were retrieved from soil and checked for invasion by the antagonist. Important differences between the parasitic ability of Trichoderma clones were noted. Clones from at least three different species (T. aureoviride, T. hamatum, T. harzianum) exhibited a high antagonistic activity. Activity of the G. virens isolate was at the same level as the best clones of Trichoderma, whereas no parasitic tendencies were found in the isolate of Acrostalagmus sp., thus confirming previous results.A rather good correlation was found between the capacity of the clones for attacking C. rolfsii sclerotia and their ability to parasitize both Sclerotinia.In conclusion, it is proposed that a screening with only one of the sclerotial species would give clones efficient against all three, and possibly against related sclerotial types.     

3种自根无性系砧木对接穗PR107产量的影响初报

比较了3种由巴西橡胶树花药离体组织培养的无性系组成的嫁接组合材料(热研8813、海垦2和大丰99为砧木,PR107为接穗)接穗胶乳在不同季节的干含(DRC)和干胶产量,分析不同砧木对它们的影响。结果表明:①砧木对接穗产量有显著影响,优良的可大幅提高橡胶产量,对接穗干含影响显著。砧木对接穗干含和干胶产量的影响因砧木材料不同而有较大变化。比较3种芽接树年平均产量,PR107/大丰99比PR107/热研88-13高6.22%、比PR107/海垦2高31.83%,PR107/热研88-13比PR107/海垦2高24.15%。②同一芽接树接穗胶乳干含和干胶产量随季节发生波动,在不同季节胶乳干含和干胶产量存在显著差异,表明它们受季节影响明显。不同的芽接树接穗胶乳干含和产量受季节的影响程度有较大差异,这种差异来源于砧木对接穗的影响。     

Mise au point sur l'incidence du virus Yo et méthodes de lutte mises en oeuvre en France pour la production de semences de pommes de terre

Summary Potato seed health status is currently at a high level in the three main seed growing regions in France (Table 1). PVY is the most common virus and a recent survey showed that 80% of infected samples were with the Y⁰ type whereas only 12% were with the Yⁿ type. However, the health status had not always been as good: from 1973 to 1976, an epidemic by PVY affected all crops with the maximum infection incidence occurring in 1976 (Table 2, Fig. 1) while at the same time leafroll infection became less common. Since 1977 the situation has been improving (Table 3) and the lowest level of infection was recorded in 1981. However, since 1971 PVY has remained the predominant virus (Table 4). The 1974–1976 epidemic could have been caused by the transmission of PVY by aphid species other than those of potatoes, for exampleRhopalosiphum padi which developed large populations in May and June in 1974, 1975 and 1976 following particularly mild winters (Fig. 1) favourable to their survival. This high level of infection by PVY occurred in Europe in general and it has been shown that previous control strategies based on the monitoring of only the potato aphids should be modified to take into account these new findings. The basic rules for producing healthy seed have been for a long time clonal production of healthy nuclear material, early roguing of infected plants and early haulm kill within a traditional lineal selection system. The more recent micropropagation technique has been used since 1977 in Brittany and ELISA testing is now routine. Since about 10 years, systematic use of mineral oils has helped to reduce greatly the spread of PVY and a forecast method against virus spread and advice to growers have been developed. At the same time, breeding for resistance has been carried out and highly resistant cultivars should soon be on the approved list of French cultivars. Selection for resistance to infection which can manifest itself at more or less high levels after one or more growing seasons in regions favourable to infection (Table 5) has also been the object of important time-consuming research. In conclusion, rapid progress in the under-standing of PVY epidemiology has been made during the last 10 years and has allowed the development of forecasting models which will be evaluated in the future.

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Zusammenfassung Der Gesundheitszustand der Saatkartoffeln in den drei Hauptanbaugebieten Frankreichs ist gegenw?rtig sehr gut (Tab. 1). Das PVY ist das meist verbreitete Virus. Eine jüngere Untersuchung hat ergeben, dass PVY^o in ungef?hr 80% der Proben vorkommt gegen nur 12% für PVYⁿ. Dieser Gesundheitszustand war jedoch nicht immer so gut: von 1973 bis 1976, hat sich eine PVY-Epidemie über alle Kulturen ausgebreitet, mit einem Maximum an Befall in 1976 (Tab. 2, Abb. 1), in der gleichen Zeit wurde das Blattrollvirus eher seltener. Seit 1977 hat sich die Lage bedeutend verbessert mit einem Minimum an Befall in 1981 (Tab. 3). Seit 1976 hat PVY immer dominiert (Tab. 4). Die Epidemie der Jahren 1974–76 konnte erkl?rt werden mit der PVY-übertragung durch nicht Kartoffelblattl?use, wie zum BeispielRhopalosiphum padi welcher in den Jahren 1974, 1975 und 1976 nach den milden Winter auftrat (Abb. 1), was die überlebensrate der Populationen erh?hte und massive Flüge in Mai und Juni erreichte. Dieser hohe PVY-Befallsgrad war generell in Europa und erbrachte somit den Beweis, dass die überwachungsstrategie welche nur die Kartoffelblattl?use in Betracht nahm verbessert werden musste, mit der Berücksichtigung dieser neuen Erkenntnissen. Seit langer Zeit bezieht sich das Grundprinzip der Saatgutproduktion auf den Freilandtest, Anbau von gesundem Material, frühe S?uberung der kranken Pflanzen, sowie das frühe Krautabt?ten im Rahmen einer klassischen Erhaltungszucht. Die jüngere Technik der Mikrovermehrung wird seit 1977 in der Bretagne angewendet und das ELISA-Verfahren gilt jetzt als Routine Test. Die seit zehn Jahren betriebene systematische Mineral?lbehandlung hat wirksam dazu beigetragen die Verbreitung des PVY zu bek?mpfen und es wurde ein Prognosesystem der Virusinfektionrisiken und eine Entscheidungsberatung der Produzenten ausgearbeitet. Parallel dazu wird geforscht um PVY-resistente Sorten zu züchten. Sorten mit sehr hoher Resistenz sollten n?chstens in die franz?sische Sortenliste eingetragen werden. Die Resistenz-Züchtung, welche sich durch einen mehr oder weniger hohen Prozentsatz Virusbefall nach einem oder mehrj?hrigen Anbau in einer günstigen Lage für die Virusübertragung ergibt, ist auch ein wichtiges langzeitiges Forschungsobjekt (Tab. 5). So haben unsere Erkenntnisse über die PVY^o-Epidemiologie sehr rasche Fortschritte w?hrend den 10 letzten Jahren gemacht. Es wurde uns auch m?glich Prognose-Modelle aufzustellen, deren Wirksamkeit in der n?chsten Jahren geprüft werden muss.

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Cette contribution a été présentée lors de la réunion de la Section Virologie tenue à Cambridge du 15 au 19 Septembre 1986.     

五种杀菌剂对马铃薯晚疫病菌孢子萌发的抑制作用

测定河北双吉75%代森锰锌水分散粒剂、河北双吉80%代森锰锌可湿性粉剂、美国陶氏80%代森锰锌可湿性粉剂、25%双炔酰菌胺悬浮剂和68.75%氟菌·霜霉威悬浮剂5种杀菌剂对马铃薯晚疫病菌[Phytophthora infestans(Mont.)de Bary]孢子囊直接萌发、间接萌发(释放游动孢子)及游动孢子萌发的抑制作用。结果表明,5种杀菌剂对孢子囊直接萌发的抑制效果均比较好,而对孢子囊间接萌发和游动孢子萌发的抑制效果各不相同。其中,河北双吉75%代森锰锌水分散粒剂和河北双吉80%代森锰锌可湿性粉剂对孢子囊直接和间接萌发的抑制效果最显著,浓度在5μg/m L以上时抑制率均为100%。美国陶氏80%代森锰锌可湿性粉剂和25%双炔酰菌胺悬浮剂,浓度在20μg/m L时几乎能完全抑制孢子囊的直接萌发或间接萌发,68.75%氟菌·霜霉威悬浮剂对孢子囊间接萌发的抑制作用相对较差。游动孢子的萌发对5种药剂较为敏感,1μg/m L的药剂浓度就能使游动孢子萌发得到显著抑制。     

Testing the resistance of potato genotypes to tuber late blight

Summary The method hitherto used in Norway for testing for tuber resistance to late blight, inoculating newly harvested unwounded tubers, is described. Superficial wounding of the tubers prior to inoculation increased the level of infection. Tests on wounded and unwounded tubers ranged the cultivars in the same order, but the significance level was higher for wounded tubers. When the tubers were harvested 16 days before inoculation instead of the same day, unwounded tubers of susceptible genotypes were less infected, but using the mean for wounded and unwounded tubers, the distinction between susceptible and resistant genotypes was still clear. Tubers inoculated 7 days after harvest were most infected when wounded shortly before inoculation, but tubers wounded two days before inoculation were infected more than unwounded tubers, and the separation between susceptible and resistant genotypes was more distinct than for unwounded tubers.

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Zusammenfassung Die derzeit in Norwegen verwendete Methode zur Prüfung der Knollenresistenz gegen Braunf?ule wird beschrieben. Die Knollen werden vorsichtig geerntet und auf feuchten Filterpapier in Styropor-Boxen (‘Fischboxen’) gelegt. Am gleichen Tag werden die Knollen mit einer Zoosporen/Sporangien-Suspension vonPhytophthora infestans besprüht. Nach Inokulation werden die Boxen bei 15°C gelagert und dabei 20 Stunden lang zwecks Erhaltung hoher Feuchtigkeit gestapelt. Danach k?nnen die Knollen abtrocknen. In Untersuchungen erh?hte sich die Zahl der Infektionen nach Rollen der Knollen über 10 Nagelspitzen, 2 mm hoch und von einer h?lzernen Basis aufw?rts weisend (Tabellen 2 und 3). Bei verwundeten und nichtverwundeten Knollen waren die Rangfolgen der Sorten nicht signifikant unterschiedlich. Für die getesteten Sorten jedoch war die Unterscheidung zwischen resistent und anf?llig, wie derF-Test aus der Varianzanalyse zeigte, bei verwundeten Knollen besser (Tabelle 3). Das Vorkommen von Braunf?ule in unverwundeten Knollen anf?lliger Sorten wurde reduziert, wenn die Knollen 16 Stunden vor der Inokulation anstatt am gleichen Tag geerntet wurden (Tabellen 1 und 2). Bei Verwendung des Durchschnitts bei verwundeten und nichtverwundeten Knollen war die Unterscheidung resistenter Sorten von anf?lligen Sorten noch klar m?glich (Tabelle 1). 7 Tage nach der Ernte inokulierte Knollen wurden am st?rksten infiziert, wenn sie kurz vor Inokulation verwundet wurden (Tabelle 4). Zwei Tage vor Inokulation verwundete Knollen zeigten zudem noch st?rkere Infektion als unverwundete Knollen. Für die in dieser Studie verwendeten Knollen war die Unterscheidung der Sorten etwas besser bei einem Tag vor Inokulation verwundete Knollen m?glich als bei Knollen, die am gleichen Tag oder zwei Tage vor Inokulation verwundet worden waren. Nichtverwundete Knollen von. Pflanzen aus 3 verschiedenen Pflanzterminen waren nahezu gleich anf?llig (Tabelle 5). Es liess sich kein signifikanter Effekt der Knollenreife auf die Resistenz feststellen.

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Résumé La méthode utilisée jusqu'ici en Norvège pour apprécier la résistance des tubercules au mildiou est décrite. Les tubercules sont récoltés soigneusement et placés sur papier filtre dans des bacs à poisson en polystyrène. Le jour même, les tubercules sont soumis à la pulvérisation d'une suspension de zoospores et de sporanges dePhytophthora infestans. Après l'inoculation, les bo?tes sont placées à 15°C et empilées pendant 20 heures afin de conserver un niveau élevé d'humidité. Après ce temps, les tubercules peuvent sécher. Lors d'expériences de blessures superficielles des tubercules en les faisant rouler sur 10 pointes (de 2 mm de haut) de clous fixés sur un support de bois, on augmente le niveau de l'infection (tableaux 2 et 3). Le classement des cultivars n'est pas significativement différent entre les tubercules blessés et non blessés mais chez les cultivars éprouvés, la distinction entre les résistants et les sensibles est meilleure chez les tubercules blessés, comme le montre la valeur duF des analyses de variance (tableau 3). L'incidence de la maladie chez les tubercules non blessés de cultivars sensibles est réduite quand les tubercules sont récoltés 16 jours avant l'inoculation, comparée à une récolte réalisée le jour même (tableaux 1 et 2). En utilisant la moyenne des valeurs obtenues avec des tubercules blessés et non blessés, la distinction entre cultivars sensibles et résistants est encore claire (tableau 1). Les tubercules inoculés 7 jours après la récolte sont plus infectés quand ils sont blessés peu de temps avant l'inoculation (tableau 4). De plus, les tubercules blessés deux jours avant l'inoculation sont encore plus infectés que les tubercules non blessés. Avec les cultivars utilisés dans l'étude, la distinction entre cultivars est nettement meilleure chez les tubercules blessés un jour avant l'inoculation que chez ceux blessés le jour même ou deux jours avant. Les tubercules non blessés de récoltes issues de plantations différées toutes les 6 semaines possèdent quasiment la même sensibilité (tableau 5). Aucun effet de la maturité des tubercules sur la résistance ne peut être déterminé.

     

枯草芽孢杆菌G8抗菌蛋白的理化性质和抑菌作用

分离得到一株对黄瓜菌核病菌Sclerotinia sclerotiorum(Lib.)de Bary有拮抗作用的枯草芽孢杆菌G8,其无菌发酵液经硫酸铵沉淀得广谱抗菌粗蛋白。为明确枯草芽孢杆菌G8的理化性质,研究了温度、pH变化、UV照射、有机溶剂、蛋白酶和保存时间对抗菌蛋白稳定性的影响。结果表明:此粗蛋白耐酸,在pH值1~10范围内均有抑菌活性,将其pH值调为1.0作用16h后保持原有活性的69.2%;对温度有较高的稳定性,抗菌蛋白经100℃处理60min保持原有活性的80.8%;对蛋白酶K和有机溶剂不敏感;抗菌粗蛋白抑菌活性持久,在常温下120天保持原有活性的71.54%。初步研究了抗菌粗蛋白对黄瓜菌核病菌的抑制作用。结果显示,病菌菌丝消融、原生质渗漏、菌丝细胞泡囊化,并抑制病菌菌核萌发。