荧光原位杂交技术在鱼类基因定位研究中的应用

荧光原位杂交fluorescence in situ hybridization,FISH）技术是一种简单而有效的染色体上物理定位DNA序列的技术。本文介绍了荧光原位杂交技术的基本原理以及实验流程,综述了近年来FISH技术在鱼类基因定位方面的应用,如来源于细菌人工染色体（bacterial artificial chromosome,BAC）文库的单拷贝基因的定位、核糖体基因和组蛋白基因等中度重复序列的定位、着丝粒特异序列和性别特异序列等高度重复序列的定位以及其他重复序列的定位等,用于研究特定基因定位、性染色体鉴定及种间杂交等遗传学问题,并展望了此技术在定位鱼类经济性状相关标记或基因、性别相关标记或基因及种特异染色体标记中的应用前景。     

DNA分子原位杂交在植物分子细胞遗传学研究中的应用

DNA分子原位杂交(in situ hybridization,ISH)是植物分子细胞遗传学研究的重要工具.简要回顾了DNA分子原位杂交的起源和发展,详细综述了基因组原位杂交(genomic in situ hybridization, GISH)在植物细胞遗传学研究中的应用以及荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization, FISH)在植物物理作图和染色体识别中的应用.还介绍了Fiber-FISH、BAC-FISH以及Immuno-FISH等新兴技术,最后对FISH技术进行了展望.     

硬粒小麦染色体的FISH核型分析

采用FISH(荧光原位杂交)技术,分析硬粒小麦(Sauwne 20)染色体的FISH核型特点,为该种质在小麦新品种选育上的应用提供参考。结果表明,Sauwne 20包括14对染色体,Oligo-pTa 535-2红色探针信号主要分布在A组染色体上,而B组染色体上主要分布着明亮丰富Oligo-pSc 119.2-1绿色探针信号;根据这2种探针在Sauwne 20染色体上的分布特点,可以将其不同染色体进行准确地一一鉴别。Sauwne 20与中国春普通小麦的A组和B组染色体的FISH核型基本相似,但又有一定的差别,不同小麦材料间DNA重复序列表现出遗传多样性。     

木薯中性/碱性转化酶基因家族11个成员在染色体上的定位

中性/碱性转化酶(Alkaline or neutral invertase,N/A-lnv)是木薯淀粉合成过程中的一种关键酶。笔者以木薯华南6号古铜期嫩叶为材料制备染色体标本,利用荧光原位杂交和原位PCR技术对N/A-lnv基因家族的11个成员进行了物理定位。结果表明,基因MeNINV5,MeNINV9和MeNINV10均位于第4号染色体上,其中基因MeNINV9和MeNINV10位于短臂上,到信号点的百分距离分别为68.52和95.35,基因MeNINV5位于长臂上,到着丝粒的百分距离为22.71;基因MeNINV4和nINV1均位于第6号染色体长臂上,到着丝粒的百分距离分别为43.16和80.71;基因MeNINV6和MeNINV7分别位于第7号和第17号染色体的长臂上,信号点到着丝粒的百分距离分别是15.38和57.97;基因MeNINV1,MeNIN,V2,MeNINV3和MeNINV8分别位于第11号、第9号、第5号和第16号染色体的短臂上,信号位点到着丝粒的百分距离分别是40.10,51.88,91.75和76.33。中性/碱性转化酶基因家族内部部分成员之间存在连锁关系。研究结果可为木薯淀粉的高效积累机制及木薯种质遗传改良提供分子细胞遗传学依据。     

Molecular characterisation of the gut microflora of healthy and inflammatory bowel disease cats using fluorescence in situ hybridisation with special reference to Desulfovibrio spp

Inflammatory bowel disease (IBD) is a common cause of chronic large bowel diarrhoea in cats. Although the aetiology of IBD is unknown, an immune-mediated response to a luminal antigen is thought to be involved. As knowledge concerning the colonic microflora of cats is limited and requires further investigation, the purpose of this study was to determine the presence of specific bacterial groups in normal and IBD cats, and the potential role they play in the health of the host. Total bacterial populations, Bacteroides spp., Bifidobacterium spp., Clostridium histolyticum subgp., Lactobacillus-Enterococcus subgp. and Desulfovibrio spp. were enumerated in 34 healthy cats and 11 IBD cats using fluorescence in situ hybridisation. The study is one of the first to show the presence of Desulfovibrio in cats. Total bacteria, Bifidobacterium spp. and Bacteroides spp. counts were all significantly higher in healthy cats when compared with IBD cats, whereas Desulfovibrio spp. (producers of toxic sulphides) numbers were found to be significantly higher in colitic cats. The information obtained from this study suggests that modulation of bacterial flora by increasing bifidobacteria and decreasing Desulfovibrio spp. may be beneficial to cats with IBD. Dietary intervention may be an important aspect of their treatment.     

Δ’吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS)基因在水稻上的荧光原位杂交

脯氨酸的积累与植物对干旱和盐胁迫的抗性有关。P5CS基因编码一个双功能酶 ,具有谷氨酸激酶和谷氨酸 -γ -半醛脱氨酶活性 ,催化脯氨酸合成过程中的前 2步反应。它是脯氨酸合成的限制因子。用生物素标记的荧光原位杂交技术 ,以蛾豆 (Vignaaconitifolia)中克隆到的P5CS基因作探针对水稻进行物理作图。该探针定位于水稻第 9染色体的短臂近端点处 ,信号点距着丝粒的相对距离为 ( 5 1 .79± 1 .2 4 ) %。P5CS基因广泛存在于单子叶和双子叶植物中     

荧光原位杂交在作物遗传育种研究中的应用

荧光原位杂交是一种原位杂交新技术，具有快速，灵敏，准确和有效等特点，它采用生物示记探针，能够将特定的ＤＮＡ或ＲＮＡ序列直接定位于染色体上，该文就荧光原位杂交技术在作物遗传育种研究中的应用进行综述，主要包括以下方面：１）检测重复ＤＮＡ序列及多拷贝基因家族；２）鉴定异源多倍体物种中的异源染色体或染色体片段；（３）检测和定位低拷贝或单拷贝ＤＮＡ序列。随着一些新技术的发展，ＦＩＳＨ技术将会在作物育种的更多     

串联重复序列在籼粳亚种间的差异及其与栽培稻遗传分化关系的研究

以中籼稻南京11号(N11)和粳稻巴利拉(Balilla)杂交F1代的DH群体为材料，利用荧光原位杂交技术(FISH)结合程氏指数分类，分析2个串联重复序列Os48、45S rDNA在DH群体中的分布，探讨串联重复序列在栽培稻籼、粳亚种间的差异及其与栽培稻遗传分化的关系。结果表明：串联重复序列45S rDNA在DH群体中的分布具有明显的籼、粳特异性；Os48在DH群体中的分布趋势与程氏指数的分类结果一致，而杂交信号为2对的6个DH株系都表现为粳型，利用减数分裂的粗线期染色体进行分析，这6个株系的Os48所在染色体均为第5、6号。从本研究结果可知，串联重复序列Os48、45S rDNA与栽培稻遗传分化有较密切的关系，可作为研究籼、粳分化的标记。     

蔷薇属 3 个野生种中45S rDNA 和5S rDNA 的物理定位

 采用双色荧光原位杂交（FISH）技术对3 个二倍体蔷薇野生种：多苞蔷薇（Rosa multibracteata Helm. et Wils.）、川滇蔷薇（R. soulieana Crép.）和金樱子（R. laevigata Michx.）的体细胞中期染色体进行 了45S rDNA 和5S rDNA 物理定位。结果表明：45S rDNA 在这3 种蔷薇的染色体上的数量和分布模式较 一致,都有1 对位点,均位于一对亚中部着丝点异形同源染色体的短臂上。5S rDNA 在多苞蔷薇上有1 对位点,在川滇蔷薇和金樱子上各有2 对位点,都分布于染色体长臂的近着丝点处。这3 种蔷薇各自的 rDNA 位点数量、所在染色体和信号强弱有明显差异。研究结果为识别3 种蔷薇各自的染色体提供了明确 有效的分子细胞遗传学标记。     

Sequential combinations of C-banding and in situ hybridization and their use in the detection of interspecific introgressions into wheat

Summary The sequential combination of C-banding and in situ hybridization techniques applied in this or in a reverse order, are used to recognize targeted chromosomal regions in cereals. Both methods are described whereby standard chromosome squash preparations are followed by: i) C-banding technique using Leishman stain and a slightly modified in situ hybridization technique using biotin-labeled DNA probes, or ii) fluorescence in situ hybridization technique and C-banding. Both approaches have been successfully used onto mitotic chromosomes of rye and wheat resulting suitable for both their identification and detection of targeted sites.