Segment-based coancestry,additive relationship and genetic variance within and between the Norwegian and the Swedish Fjord horse populations

ABSTRACT

The Fjord horse originates from Norway but forms a global population due to several small populations in foreign countries. There exists no information about the additive relationship and the genetic variance between these subpopulations. By collecting blood samples from Norwegian and Swedish Fjord horses, a sample of 311 Norwegian and 102 Swedish horses gave 485,918 SNPs available for analysis. Their inbreeding coefficients were calculated and compared to the pairwise coancestry and the shared genomic segments. The effective population size was almost similar with the two methods in the Norwegian Fjord horse population (63 and 71), but very different in the Swedish population (269 and 1136) and unprecise due to a much smaller number of observations. The study showed that coancestry from shared genomic segments can be used to estimate additive genetic relationship and genetic variation within and between the global populations of the Fjord horse.     

鸡新城疫病毒地方株的分离鉴定及其遗传变异分析

从河北省保定地区发病鸡群中分离到2个具有血凝性的病毒株分别命名为HBA和HBB,其血凝作用可被NDV阳性血清抑制,而不能被AIV(H9亚型)、EDS76阳性血清抑制,表明2个分离株均为新城疫病毒。通过测定MDT、ICPI和IVPI等方法鉴定分离株的毒力符合强毒标准。利用RT-PCR技术成功扩增了2株分离株的F基因片段(约540bp),通过测序及遗传变异分析表明两毒株之间的核苷酸同源性为87.7%,氨基酸同源性为91.6%,结合系统发育进化树分析表明HBA为基因Ⅵ型,HBB为基因Ⅶ型。     

鸡蛋静态力学特性的研究

通过静态压缩试验研究了不同蛋大小、蛋形指数及鸡蛋横压、竖压、大小端受压情况下鸡蛋的破坏形式和力学特性;探讨了缓冲材料对鸡蛋抗压强度的影响规律;同时进行了冷藏鸡蛋的抗压力学性能试验研究。试验结果表明:蛋形指数、鸡蛋大小、鸡蛋大小端等物理参数对抗压强度均有影响,其中以蛋形指数、缓冲材料的影响显著,鸡蛋大头朝上竖放可减少破损,冷藏提高了鸡蛋的抗变形能力。     

山西铁杆蒿草地群落碳、氮密度区域差异及其驱动因素

为明确山西铁杆蒿（Artemisia sacrorum）群落碳、氮密度的区域差异,以及导致这种空间变化的驱动因素,本试验以山西省铁杆蒿草地群落为研究对象,通过测定晋北半干旱地区和晋南半湿润地区铁杆蒿群落的碳（C）、氮（N）密度,分析了其与年均气温、年降水量、土壤理化性质和地上、地下生物量等生态因子的相关性。结果表明：山西南北铁杆蒿群落碳、氮密度空间分布存在差异,晋南地区铁杆蒿群落的群落碳、氮密度分别为651.83 g C·m^-2和20.63 g N·m^-2,晋北地区铁杆蒿群落的群落碳、氮密度分别为418.89 g C·m^-2和13.90 g N·m^-2。以群落各组分碳、氮密度代表样点进行RDA（Redundancy analysis）冗余分析排序得出造成两地区群落碳、氮密度分异的主要生态因子均为地上生物量、地下生物量、年均气温、年降水量、土壤有机碳含量以及土壤砾石比。可见,山西晋南和晋北地区铁杆蒿群落碳、氮密度空间分布存在差异,不同气候区铁杆蒿群落碳、氮密度空间差异与生物量的积累密切相关,驱动晋南和晋北地区铁杆蒿群落碳氮密度分异的环境因素为年均气温、年降水量、土壤有机碳含量以及土壤砾石比。     

我国家蚕基因组的最新研究——对家蚕基因组精细图和40个蚕类基因组遗传变异图的解读

2008年12月,西南大学家蚕基因组研究团队宣布了世界上第1张家蚕基因组精细图谱的诞生。家蚕基因组精细图和2003年发布的家蚕基因组框架图相比,具有基因覆盖度高、基因组组装更加完整、基因鉴定更加准确等特点。2009年,该研究团队在家蚕基因组精细图的基础上,选取具有代表性的29个家蚕突变品系和11个不同地理来源的中国野桑蚕品系进行了全基因组重测序与序列比较分析,共获得了29个家蚕突变品系和11个中国野桑蚕地理品系的全基因组序列,绘制完成了世界上第1张基因组水平上的蚕类单碱基遗传变异图谱,同时还发现了驯化对家蚕生物学性状影响的基因组印记,从全基因组水平上揭示了家蚕的起源进化。2009年8月,《Science》杂志发表了西南大学的研究论文"40个蚕类基因组的重测序揭示了家蚕的驯化事件及驯化相关基因",标志着家蚕基因组计划进入一个新的历史阶段。     

‘钱德勒’等4个北高丛蓝莓品种在南京地区的引种表现

通过对2015年种植于南京地区的4个北高丛优良蓝莓品种‘钱德勒’、‘甜心’、‘布里吉塔’和‘埃利奥特’的生长量、物候期以及果实外观和品质特征的调查发现,结果发现,布里吉塔和埃利奥特的适应性较强,生长量大,坐果率高,在较好的管理条件下,可以取得较高的产量;钱德勒和甜心的适应性中等,坐果率及产量中等或偏低。甜心属于极早熟品种,5月下旬成熟,钱德勒和布里吉塔属于中熟品种,6月上旬成熟,埃利奥特属于晚熟品种,6月中旬成熟。钱德勒和布里吉塔属于大果,甜心属于中果,3个品种的鲜食品质极佳,感官评分在南京地区种植的近60个品种中名列前茅。埃利奥特属于中果,鲜食品质中等。综合来看,布里吉塔在南京地区适应性好,果实品质佳,具有较大的发展潜力,钱德勒和甜心的果实鲜食品质极佳,但适应性中等,可少量种植,埃利奥特的适应性较好,果实品质中等,可酌情推广。     

草坪恶性杂草蟋蟀草的发生生物学——蟋蟀草发生对播期的反应

在北京地区蟋蟀草从5月开始发生，可以持续到10月底，6月、7月出土速率和出土率强于其它月份，9月后出土率显著下降；5～10月期间生长的蟋蟀草，其种子与植株的生物学产量比率为5～7的值占64%。脱离母株的蟋蟀草种子当月存在萌发力，半年后萌发率达到60%。     

Bipolaris australiensis HD-1胆红素氧化酶纯化、鉴定及其酶学性质

[目的]为了获得B.bipolaris HD-1胆红素氧化酶纯品,确定酶的同源性及其常规酶学性质.[方法]将B.bipolaris HD-1发酵液依次通过硫酸铵盐析、阴离子交换层析和凝胶过滤层析确定蛋白的纯度、浓度和酶活力;通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱（MALDI-TOF）法获得氨基酸序列,并利用Mascot软件在NCBI蛋白库中的比对,以确定同源蛋白来源;用SDS-PAGE方法测其表观分子量;用等电聚焦方法测定等电点;用Linwerver-Burk双倒数作图法测定米氏常数;并对该酶的酶学性质进行了常规的测定.[结果]获得具有胆红素氧化酶酶活性的电泳纯单体蛋白,酶活为46 000 U/L,比活为1.15 U/mg;MALDI-TOF共获得135个氨基酸,该蛋白与来源于Hel-minthosporium tritici-vulgaris的漆酶前体蛋白序列同源性达100％;蛋白的表观分子量为68 kDa;pI为4.1;它对ABTS和胆红素的米氏常数分别为Km（ABTS） =1.8×10-5 mol/L（pH 3.0）和Km（bilirnbin）=2.7×10-5 mol/L（pH 7.5）;对胆红素的最适催化活性为36℃,酶在-40℃下可保持2年,酶活保持在90％以上,在pH 8 ～9.5下可保持相当高的催化胆红素活性,能够耐受高浓度的硝酸钠和尿素,低浓度的叠氮化钠对酶活有促进作用而高浓度则抑制,对氯化钠、溶解氧敏感.[结论]该蛋白具有典型的胆红素氧化酶特性,又存在明显的不同.     

五常市杂种落叶松幼龄期变异分析

以5年生36个杂种落叶松家系为材料,测定其树高、胸径生长性状,估算变异系数、遗传力和遗传增益,筛选出优良家系。结果表明:各家系的树高、胸径存在较丰富变异,树高变异系数小于胸径,树高、胸径极显著相关(P<0.01),家系间树高、胸径差异均达极显著差异水平(P<0.01)。以10%的入选率,初选出家系1317、1324、1318、和1327为优良家系,树高平均增益为15.98%,胸径平均增益为29.46%。