连作土壤微生物区系分析、调控及高通量研究方法

土壤连作后导致土壤微生物生态失衡、病原微生物富集、有益微生物减少,土壤微生物从细菌主导型向真菌主导型转化,使病原菌更容易侵染植物而引发植物的各种土传病害。施用微生物有机肥可以将失衡的微生物区系恢复到健康的状态,从而可以起到防治土传病害的作用。本文围绕连作引起的土壤中各大类微生物数量和种类的变化以及连作土壤施用微生物有机肥修复后其微生物数量和种类的变化进行了综述,并通过与传统技术比较,介绍了454高通量测序研究方法的优越性,指出了其在土壤微生物区系研究中的重要性。     

香芹酚和百里香酚对断奶仔猪结肠微生物的影响研究

试验旨在研究日粮添加香芹酚和百里香酚对断奶仔猪结肠微生物群落结构和代谢通路的影响。选取28日龄、体重8.5 kg±1.0 kg断奶仔猪64头,随机分为4组,每组16个重复,每个重复1头猪。A组（对照组）饲喂基础日粮＋抗生素,B组饲喂基础日粮＋20 g/t香芹酚,C组饲喂基础日粮＋20 g/t百里香酚,D组饲喂基础日粮＋20 g/t香芹酚-百里香酚混合物（质量比2：1）。试验期30 d。基于Illumina HiSeq测序平台,利用双末端测序（Paired-End）的方法进行测序。通过对OTUs聚类,进行物种注释及丰度分析;进一步进行α多样性、β多样性分析及显著物种差异分析和功能基因预测分析。结果显示：①各试验组结肠微生物多样性均显著高于对照组（P<0.05）;②D组结肠中厚壁菌门（Firmicutes）相对丰度极显著高于对照组（P<0.01）,显著高于B和C组（P<0.05）,拟杆菌门（Bacteroidetes）相对丰度显著高于对照组和C组（P<0.05）,Epsilonbacteraeota、螺旋体门（Spirochaetes）、变形菌门（Proteobacteria）相对丰度极显著低于对照组（P<0.01）。D组结肠中弯曲杆菌属（Campylobacter）相对丰度极显著低于对照组（P<0.01）,D组理研菌科RC9肠道群（Rikenellaceae_RC9_gut_group）相对丰度显著高于B组（P<0.05）,D组罗斯氏菌属（Roseburia）相对丰度极显著高于对照组（P<0.01）,D组螺杆菌属（Helicobacter）相对丰度极显著低于对照组（P<0.01）;③D组结肠微生物脂质代谢水平极显著高于对照组（P<0.01）,结肠微生物碳水化合物代谢、其他次生代谢物的生物合成和其他氨基酸代谢水平显著高于对照组（P<0.05）,结肠微生物能量代谢水平极显著低于对照组（P<0.01）。综上,在本试验条件下,断奶仔猪日粮中添加20 g/t的香芹酚-百里香酚混合物,改善了断奶仔猪结肠微生物群落结构,结肠中有益菌的相对丰度提高,有害菌的相对丰度降低,促进了结肠微生物的代谢功能。     

小刺猴头菌发酵浸膏多糖对肉仔鸡肠道菌群的影响

为研究饲粮中添加不同水平小刺猴头菌发酵浸膏多糖对肉仔鸡肠道pH和肠 道菌 群的影响。试验选用1日龄健康且生产性能相近的艾维茵肉仔鸡240只,随机分为4组,每组3个 重复,每个重复20只。选用无任何抗生素的玉米—豆粕型饲粮作为基础饲粮,各试验组分别在 基础饲粮中添加0,0.1％,0.3％,0.5％小刺猴头菌发酵浸膏多糖,试验期42 d。分别于1 4,21,28,42日龄无菌取回肠、盲肠食糜以检测肠道pH和菌群数量。结果表 明 :0.1％,0.3％,0.5％组显著提高了肉仔鸡的回肠、盲肠乳酸杆菌和双歧杆菌的数量(P <0 .05),降低了肠道内大肠杆菌、沙门氏菌和肠球菌的数量,尤以0.5％添加组的效果最好。0 1％,0.3％,0.5％组降低了肉仔鸡回肠、盲肠的pH,且效果明显。     

Effects of bamboo charcoal and bamboo vinegar as antibiotic alternatives on growth performance,immune responses and fecal microflora population in fattening pigs

This study was carried out to investigate the effects of bamboo charcoal and bamboo vinegar as alternatives of antibiotics in the diet of fattening pigs and their influence on growth performance, immune responses and fecal microflora populations. Crossed pigs (n = 144, 79 kg body weight) were divided into 12 heads per pen, four diets and three replications. The basal diet (negative control: NC) was supplemented with 0.3% antibiotics (positive control: PC), 0.3% bamboo charcoal (BC) and 0.3% bamboo vinegar (BV). Average daily weight gain and feed efficiency were higher (P < 0.05) in PC, BC and BV. The concentration of lactate dehydrogenase and cortisol were lower (P < 0.05), but the concentration of immunoglobulin G (IgG) and IgA were higher (P < 0.05) in PC, BC and BV. Counts of coliform bacteria and Salmonella spp. were lower (P < 0.05), while the counts of fecal anaerobic total bacteria and lactic acid bacteria were higher (P < 0.05) in PC, BC and BV. A reasonable inclusion of bamboo charcoal or bamboo vinegar as antibiotics in the diet of fattening pigs leads to a better growth performance, immune responses and fecal microflora populations. The results of the present study suggest that bamboo charcoal or bamboo vinegar could be a potential additives in animal production as an alternative to antibiotics.     

复合乳酸杆菌制剂对蛋种鸡产蛋性能、免疫机能和盲肠微生物的影响

为研究复合乳酸杆菌制剂对蛋种鸡产蛋性能、免疫机能和盲肠微生物区系的影响,试验选用170日龄蛋种鸡288只,随机分为4组,每组6个重复,每个重复12只鸡.对照组饲喂基础饲粮,试验组饲喂在基础饲粮中分别添加0.05％、0.10％和0.20％复合乳酸杆菌制剂的试验饲粮.试验期30 d.结果表明:1)各组蛋种鸡平均日采食量、平均蛋重和料蛋比均差异不显著(P＞0.05);饲粮添加复合乳酸杆菌制剂可显著影响蛋种鸡的产蛋率(P＜0.05),其中0.05％乳酸杆菌添加组显著高于对照组(P＜0.05).2)饲粮添加复合乳酸杆菌制剂显著提高了蛋种鸡对粗蛋白质的表观消化率(P＜0.05),但对钙和磷的表观消化率无显著影响(P＞0.05).3)饲粮添加0.05％复合乳酸杆菌制剂显著提高了蛋种鸡的禽流感抗体效价(P＜0.05),添加0.05％、0.10％和0.20％复合乳酸杆菌制剂均显著降低了盲肠大肠杆菌和产气荚膜梭菌的数量(P＜0.05),显著提高了盲肠双歧杆菌和乳酸菌数量(P＜0.05).综上所述,饲粮中添加复合乳酸杆菌制剂对蛋种鸡的产蛋性能、营养物质消化率、免疫机能都有一定提高作用,并改善了肠道微生物区系,其适宜添加水平为0.05％.     

胆汁酸代谢与肠道微生物互作的研究进展

胆汁酸(bile acid,BA)是胆汁的主要成分,主要在肝脏中合成,可以清理机体类固醇物质,对肠道脂类物质的吸收发挥重要的作用.肠道微生物是伴随人类进化形成的极为复杂的微生态系统,而BAs的代谢与肠道微生态系统之间有着密不可分的联系.文章依据现有的国内外相关研究对BAs代谢和肠道微生物对畜禽健康的影响进行综述.     

鄂尔多斯沙地土壤微生物区系的研究

以内蒙古鄂尔多斯市流动、半固定、和固定3种不同沙丘类型为研究对象,系统地研究了土壤中三大微生物数量组成、季节动态变化以及垂直分布特征。结果表明不同固定程度的沙丘在微生物总数量上存在较大的差异,即固定沙丘>半固定沙丘>流动沙丘,固定沙丘微生物总数是半固定沙丘的2.8倍,流动沙丘的12.5倍;3种沙地中土壤微生物数量,细菌占绝对优势(70%以上),放线菌次之,真菌最少(低于1%),并且有明显的季节分布和垂直变化规律。细菌和放线菌在春季有生长高峰,真菌则在秋季,半固定和固定沙丘中细菌在表层分布最多,真菌和放线菌在1~10 cm处分布最多。     

低聚木糖、益生菌及抗生素对肉鸡肠道菌群和生产性能的影响

选用1日龄健康AA肉雏鸡1200羽,随机分成6个处理,每个处理8个重复,分别饲喂添加抗生素(杆菌肽锌16.7mg·kg-1和硫酸粘杆菌3.3mg·kg-1,对照组)、低聚木糖(0.02%)、合生素(0.005%益生菌+0.005%及0.01%低聚木糖)、抗生素与低聚木糖(对照组抗生素+0.005%及0.01%低聚木糖)6种不同日粮,研究不同处理对肉鸡肠道微生物菌群和生产性能的影响。结果表明:与对照组相比,各试验组肉鸡空肠的乳酸菌数分别提高了19.89%(P<0.05)、9.17%、20.21%(P<0.05)、13.98%(P<0.05)和16.75%(P<0.05),除0.005%低聚木糖+抗生素组,其它各组大肠杆菌数量均较高。各试验组前期(0～21日)、后期(22～42日)和全期(0～42日)的肉鸡体增重分别提高了0.8%～15.1%、2.9%～29.0%和2.2%～24.0%,后期和全期饲料转化率分别改善了2.5%、4.3%、10.4%、16.9%、12.5%和1.0%、3.3%、6.2%、7.1%、6.2%,以添加0.005%低聚木糖+抗生素组的肉鸡增重、饲料转化率与成活率为最佳。     

木醋液对蛋鸡生产性能、肠道菌群及舍内氨气浓度的影响

试验旨在探讨基础日粮中添加不同比例木醋液对蛋鸡高峰期生产性能、肠道菌群和在粪便上喷洒木醋液对舍内氨气浓度的影响。试验选用体重相近的产蛋高峰期180日龄海兰灰240只,分4个处理组,每组3个重复,每个重复20只。对照组饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中分别添加0.5%、1.0%、1.5%的木醋液。试验期45 d。结果表明,与对照组相比,1.0%木醋液组显著提高平均蛋重、平均采食量和产蛋率(P<0.05)。0.5%、1.0%木醋液组的平均产蛋重显著高于对照组(P<0.05)。1.0%木醋液组、1.5%木醋液组的大肠杆菌数量和沙门氏菌数量均显著低于对照组(P<0.05),乳酸杆菌数量显著高于对照组(P<0.05)。与喷洒前相比,木醋液在喷洒后的第7~14 d的7:00和16:00舍内的氨气浓度显著降低(P<0.05),16:00舍内氨气浓度整体上高于7:00的舍内氨气浓度。试验表明,日粮中添加适量的木醋液可以显著提高蛋鸡生产性能和降低舍内氨气浓度,缓解蛋鸡夏季应激反应,维持肠道健康,提高免疫力。     

环境变化对中国野生蜜蜂多样性的影响

目的研究自主分离的罗伊氏乳杆菌LP4的益生特性及其对东方蜜蜂成年工蜂存活率、肠道菌群结构和抗菌肽mRNA表达量的影响。方法采用MRS培养基从东方蜜蜂肠道中分离乳酸菌,并进行分子生物学鉴定,使用琼脂打孔扩散法和滤纸片扩散法检测菌株的抑菌活性和抗生素敏感性,得到具有良好益生特性的罗伊氏乳杆菌LP4;选择300只东方蜜蜂成年健康工蜂,随机分为对照组和试验组,对照组饲喂蔗糖溶液,试验组饲喂含LP4的蔗糖溶液,在第3、6和9天检测蜜蜂死亡率、肠道菌群数量和抗菌肽mRNA的表达量。结果分离得到5株乳酸菌均为罗伊氏乳杆菌,其中LP4对大肠杆菌、鼠伤寒沙门氏菌和福氏志贺氏菌的抗菌活性最强,且对7种抗生素敏感;与对照组相比,第3、6和9天试验组的存活率分别提高8.32%、22.46%和39.5%,乳酸菌数量显著增加(P<0.05),肠球菌数量显著降低(P<0.05),抗菌肽Abaecin和Defensin mRNA相对表达量显著或极显著增加(P<0.05或P<0.01);第9天PPO mRNA相对表达量显著增加(P<0.05)。结论罗伊氏乳杆菌LP4具有良好的益生特性,饲喂东方蜜蜂成年工蜂后可通过改善肠道菌群结构和增强肠道免疫功能,提高存活率。