Variation in the wheat AP2 homoeologs,the genes underlying lodicule development

The bread wheat genome harbors three homoeologs of the barley gene HvAP2, which determines the cleistogamous/non-cleistogamous flowering. The three homoeologs, TaAP2-A, TaAP2-B and TaAP2-D, are derived from the A, B and D genomes. The importance of lodicule swelling in assuring non-cleistogamous flowering in a range of wild and domesticated wheat accessions of varying ploidy level was established. Re-sequencing of wheat AP2 homoeologous genes was carried out to identify natural variation at both the nucleotide and polypeptide level. The sequences of wheat AP2 homoeologs are highly conserved even across different ploidy levels and no functional variants at the key miR172 targeting site were detected. These results indicate that engineering of cleistogamous wheat will require the presence of a functional TaAP2 modification at each of the three homoeologs.     

拟南芥At-pri-miR828 基因的克隆及其对番茄的遗传转化

 MicroRNA828（miRNA828）是一种新近发现的生物学功能还未全面研究的miRNA。为从 不同角度阐明miRNA828 的生物学功能,从拟南芥中克隆到At-pri-miR828 基因并构建了该基因过量表达 的植物表达载体pC2300-pOT2-At-pri-miR828,通过农杆菌介导的叶盘法将pC2300-pOT2-At-pri-miR828 导入异源植物番茄品种‘Ailsa Craig’中。PCR 鉴定结果显示,外源基因At-pri-miR828 已成功整合到转 基因番茄基因组中,共获得9 个转基因株系,67 株转基因植株。定量PCR 检测结果显示,与野生型番茄 植株相比,转基因植株中miR828 的表达量显著增加,而生物信息学所预测的miR828 靶基因Sly-myb-like1 的表达水平则相应降低。花青素含量测定结果显示,miR828 过量表达的转基因番茄植株花青素含量明显 低于野生型植株,表明miR828 参与了番茄花青素的生物合成调控。     

miR‐26a suppresses autophagy in swine Sertoli cells by targeting ULK2

A large number of microRNAs (miRNAs) have been detected from porcine testicular tissues thanks to the development of high‐throughput sequencing technology. However, the regulatory roles of most identified miRNAs in swine testicular development or spermatogenesis are poorly understood. In our previous study, ULK2 (uncoordinated‐51‐like kinase 2) was predicted as a target gene of miR‐26a. In this study, we aimed to investigate the role of miR‐26a in swine Sertoli cell autophagy. The relative expression of miR‐26a and ULK2 levels has a significant negative correlation (R² = .5964, p ≤ .01) in nine developmental stages of swine testicular tissue. Dual‐luciferase reporter assay results show that miR‐26a directly targets the 3′UTR of the ULK2 gene (position 618–624). In addition, both the mRNA and protein expression of ULK2 were downregulated by miR‐26a in swine Sertoli cells. These results indicate that miR‐26a targets the ULK2 gene and downregulates its expression in swine Sertoli cells. Based on the expression of marker genes (LC3, p62 and Beclin‐1), overexpression of miR‐26a or knock‐down of ULK2 inhibits swine Sertoli cell autophagy. Taken together, these findings demonstrate that miR‐26a suppresses autophagy in swine Sertoli cells by targeting ULK2.     

红花miR397a基因表达及对靶基因LAC2的调控作用

【目的】研究红花miR397a前体基因及成熟基因在红花不同组织中的表达水平,并对miR397a基因序列、靶基因及基因功能进行分析,为深入研究红花抗逆机制提供参考。【方法】提取红花籽粒、花瓣、茎、根、叶片等5个组织材料的总RNA,使用荧光定量PCR鉴定miR397a在不同组织中的表达水平;利用生物信息学方法分析红花miR397a基因序列,用原生质体转化方法验证红花miR397a调控的靶基因LAC2,并利用转基因拟南芥表型研究miR397a基因的功能。【结果】miR397a前体基因和成熟基因均能在红花不同组织中表达,且均以叶片组织中的表达量最高,分别是籽粒组织的2.5与1.9倍,差异达极显著水平;miR397a序列在不同物种间高度保守,序列中仅存在1~2个碱基的错配或缺失;miR397a对LAC2基因有调控作用,miR397a的过表达可引起LAC2表达水平降低,红花miR397a表达引起植物对NaCl的敏感性增加。【结论】红花miR397a在叶片组织中的表达量最高,基因序列保守,且红花miR397a表达可增强植物对NaCl的敏感性。     

冬小麦miR398前体的克隆及其在低温条件下对靶基因CSD1表达的调控

miR398是受逆境胁迫负调控的miRNA,其靶基因CSD编码超氧化物歧化酶(SOD),使植物抵御活性氧(ROS)的毒害。为进一步了解低温胁迫下miR398的调控机制,从东农冬麦1号中克隆小麦miR398前体,构建过表达载体并转化拟南芥,用Real-time PCR检测T0代植株中小麦miR398及其靶基因CSD1在低温胁迫下的表达量。结果表明,随着低温胁迫时间的延长,miR398表达下调、CSD1基因表达上调,认为小麦miR398能响应低温胁迫、负调控CSD1基因表达,间接提高了拟南芥的抗寒性。     

木署中miR393的RT-PCR鉴定及前体的克隆与结构分析

研究木薯中表达的miRNA对深入探明木薯生长发育的调控机制具有十分重要的意义.通过RT-PCR证实木薯中有miR393的表达.采用比较基因组学的方法,从木薯基因组DNA中克隆到miR393的前体,对该miRNA前体的二级结构及与其它物种序列的同源性进行分析,结果表明,miR393前体序列在不同物种间保守性不高,但成熟的...     

油菜miR169基因家族的生物信息学分析及靶基因预测

为了解油菜miR169基因家族,采用生物信息学的方法对油菜miR169基因家族成员的染色体位置、分子进化、前体序列的保守性、启动子和靶基因进行了分析。结果表明:油菜miR169基因家族成员分布在9条染色体上;系统进化分析表明,这些基因共分成2个组;其前体序列在形成成熟miRNA的位置高度保守;油菜miR169基因家族上游启动子主要元件有13个,数量最多的是胚乳表达元件、厌氧胁迫元件、热响应元件和MBS;油菜miR169基因家族的靶基因一共有16个,大部分属于NF-YA基因家族。该结果为进一步研究油菜miR169基因家族的功能奠定了基础。     

茶树miR156a靶基因SPL6和SPL9的克隆及表达分析

MicroRNA156a-SQUAMOSA promoter binding-like protein(miR156a-SPLs)参与植物生长阶段转变、叶片形态建成和逆境胁迫等复杂的生理过程。基于茶树转录组数据,从茶树中克隆出2个SPL家族成员——CsSPL6和CsSPL9。CsSPL6 cDNA全长2 318 bp,ORF框长1 668 bp,编码555个氨基酸;CsSPL9 cDNA全长1 954 bp,ORF框长1 116 bp,编码371个氨基酸;CsSPL6和CsSPL9都有典型SBP结构域和Csn-miR156a识别位点。时空表达特性分析表明,Csn-miR156a在芽中表达量最高,第7叶中最低,与CsSPL6和CsSPL9呈负调控关系;不同品种(系)表达特性分析表明,Csn-miR156a的表达模式与新梢生长量、光合指标结果一致,与CsSPL6和CsSPL9表达模式相反,说明Csn-miR156a、CsSPL6和CsSPL9参与茶树生长过程,Csn-miR156a和CsSPLs可作为初步判断品种生长势强弱的分子手段;高温处理4个品种(系)表达特性表明Csn-miR156a与CsSPL9呈负相关,推断茶树在高温胁迫下Csn-miR156a可能通过负调控CsSPL9来增加耐高温性。Csn-miR156a负调控CsSPLs在茶树生长发育、逆境胁迫中发挥作用,为茶树生长和抗逆机制提供理论依据。     

干旱胁迫对不同品种大豆下胚轴生理生化特性的影响

研究分别以2种大豆WDD00172(WDD-172)和晋豆21(JD-21)为实验材料,探讨干旱胁迫对不同品种大豆下胚轴生理特性及抗氧化酶活性的影响。结果表明,随着9%PEG6000胁迫时间的延长,大豆下胚轴MDA含量和离子渗漏显著增高,且WDD-172增幅较大;干旱胁迫下GSH含量、CAT和POD活性持续下降,APX活性则先上升后下降,而且WDD-172下降更加明显。研究发现JD-21更加抗旱可能与体内高浓度的葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)活性有关;干旱胁迫下JD-21比WDD-172更加耐受干旱胁迫,可能是由于体内抗氧化酶活性(CAT、POD和APX)和抗氧化物质GSH含量较高的原因。