鱼类中新发现的免疫球蛋白

鱼类是最早产生免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)的脊椎动物之一。鱼类IgM作为鱼类特异性体液免疫应答中最主要的免疫介质,目前已有较详细的研究报道。除此之外,近年来在鱼类还新发现了几个Ig,如IgD、IgW、IgNAR、IgZ和IgT等,笔者对其结构及功能进行简要综述,以期为国内同行提供科学参考。     

Predicting use of habitat patches by spawning horseshoe crabs (Limulus polyphemus) along a complex coastline with field surveys and geospatial analyses

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增氧对池塘沉积物酶活性的影响

比较研究了微孔和机械2种增氧养殖模式下4种沉积物酶活性的动态变化,并分析了所测酶活性与养分因子的相关性。结果表明：（1）4种酶活性随水温的季节性变化较为明显,其中蛋白酶活性与脲酶活性变化呈单峰状曲线,蔗糖酶各月波动较大,过氧化氢酶活性整体呈上升趋势。（2）池塘沉积物中酶活性对不同增氧方式有明显的响应,2种增氧均可提高4...     

农地流转的交易成本困境与村级组织的服务优势

当前的农地流转具有显著的乡土特征。农地自发流转无法降低信息、谈判、履约等交易成本。村级组织是农地集体所有的代理者、农地流转的信息拥有者、农民集体行动的组织者和农地流转的有效监督者,具有服务农地流转的低成本优势。因此,克服农地流转的困境需发挥村级组织的服务优势。     

Associations between morphometric variables and weight and yields carcass in Pirapitinga Piaractus brachypomus

The objective of this work was to evaluate the association between morphometric variables and carcass characteristics in Pirapitinga. We used a thousand specimens of Pirapitinga with an average weight of 1,200 g, which were stunned, slaughtered, weighed, measured, and processed for morphometric and processing yield analysis, to obtain weights, carcass and fillet yields. Initially, the linearity of the variables was verified. Pearson's simple and partial correlation tests were performed between all metrics. Track analysis was performed considering the weights and yields of carcass and filet as dependent variables and the others as independent variables. Ridge regression models were used to eliminate the effects of multicollinearity among the independent variables. Observations showed that the simple correlations between body weights and yields were superior to the partial ones in terms of magnitude. The length and circumference of the specimens were the measures most linearly associated with weight, carcass weight and fillet with rib weight. As for carcass yield and fillet yield, linear correlation coefficients were low and not significant when associated with body weights. With the path analysis, we could observe significant positive correlations between the morphometric measurements for weight, carcass weight and fillet with rib weight. The standard length, body circumference and body circumference/body height ratio are the most correlated. The latter are the most important variables in the evaluation of body weights in Pirapitinga fish. They can serve as criteria for indirect selection in searching for fish with better carcass characteristics. As for fillet and carcass yields, the morphometric variables have not shown to be efficient for indirect selection.     

凡纳滨对虾细胞因子信号转导负调控因子 基因(Lv-SOCS)的克隆及特征分析

为了探讨凡纳滨对虾细胞因子信号转导负调控因子(SOCS)在病毒引发的免疫应答过程中的潜在作用,本实验根据前期的转录组和表达谱结果提示信息,首次克隆了凡纳滨对虾的SOCS基因(Lv-SOCS,GenBank注册号:KJ000426),利用在线软件进行了生物信息学分析,运用半定量的方法进行了组织表达分析,并利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术分析了该基因在白斑杆状病毒(WSSV)侵染过程中的表达变化特征。结果显示,Lv-SOCS的ORF区1 191 bp,编码397个氨基酸,预测分析显示该基因编码的蛋白质含有1个SH2结构域和1个SOCS-box结构域,组织表达分析表明该基因主要在凡纳滨对虾血细胞、肠道和肝胰腺中表达。在WSSV感染后中晚期(6~48 hpi),Lv-SOCS可以被显著诱导,在血细胞中呈明显上调表达趋势,表明该基因在一定程度上参与了凡纳滨对虾体内由WSSV引发的先天免疫应答过程,上述结果为进一步研究Lv-SOCS基因在对虾应答病毒侵染过程中的功能和作用机制奠定了基础。     

饲料VD3水平对黄颡鱼转录组差异基因表达的影响

为研究饲料中添加维生素D_3对黄颡鱼基因表达的影响,实验基于RNA-Seq技术对用添加不同水平维生素D_3[0(VD0),1243(VD2),22700(VD20)IU/kg]的饲料喂养的黄颡鱼肾脏和小肠的转录组数据进行分析。通过对305 568982条原始reads的筛选和排除,得到了83 265条unigenes,平均长845.38 nt,N50为1620 nt。利用Blast等相关软件对数据进行深度分析,得到功能注释基因共29 224个。根据GO富集分析发现,差异表达基因主要集中在细胞过程、代谢通路、生物调控等通路中,KEGGpathway富集分析结果显示,代谢通路涉及基因最多,有1532个。相对于对照组,添加1243和22700 IU/kg的VD_3(VD0 vs VD2/VD0vs VD20)可得到共同上下调基因共380个,其中上调基因266个,下调基因114个;3种水平下共同上下调的基因共2 1个,其中上调基因4个,下调基因1 7个。研究表明,在饲料中添加不同浓度维生素D_3会对黄颡鱼的生长代谢和生物调控等相关基因表达产生影响,且不同浓度实验组,相关基因的表达存在差异。本实验通过对差异表达基因的后续分析及预测,为黄颡鱼的生长代谢及疾病预防等方面的研究提供了丰富的数据来源。     

Country‐wide analysis of large wood as a driver of fish abundance in Swedish streams: Which species benefit and where?

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黑斑狗鱼形态性状对体重的影响效果分析

选取0^＋龄～4^＋龄黑斑狗鱼332尾,对其体长、体高、体宽、尾柄长、尾柄高、头长、头高、头宽、吻长、眼间距、口裂宽、口裂长和体重等13个性状进行测量。采用多元分析法分析体重和形态形状的关系。结果表明,黑斑狗鱼除0^＋龄头长与体重之间的相关系数未达到显著水平（P〉0．05）外,其它各形态性状与体重的相关系数均达到显著水平（P〈0．05）或极显著水平（P〈0．01）;经通径分析,不同年龄阶段各形态性状对体重的通径系数存在一定的差异,但体长和头高对体重的通径系数均达到显著水平,而且体长对体重的直接作用均最大,其余各性状均是通过体长间接的影响体重;决定系数分析结果表明,体长对体重的决定系数最大,其它性状主要通过体长影响体重;通径分析结果与决定系数分析结果的变化趋势一致;所选形态性状与体重的相关指数R2〉0．85,说明所选性状是影响体重的主要性状。应用逐步多元回归分析,经偏回归系数的显著性检验,建立以体重为因变量（Y）,各形态性状为自变量的多元回归方程,0^＋龄～4^＋龄黑斑狗鱼体重（Y）与形态性状参数的多元叵归方程分别为：LgY=-1．411＋0．395LgX8＋0．576LgX1＋0．092LgX1n＋0．538LgX7＋0．35LgX6;LgY=-4．132＋0．866LgX1＋0．102LgX】2＋0．083LgX7;LgY=一4．186＋0．772LgX1＋0．195LgX7;LgY=-2．542＋0．372LgX1＋0．185LgX3＋0．256LgX8＋0．23LgX7,;LgY=-4．585＋0．816LgX1＋0．178LgX7。经回归预测估计值与实际值间的差异不显著（P〉0．05）,该方程可用于黑斑狗鱼实际生产中,为黑斑狗鱼选种提供了理论依据和理想的测量指标。     

拟穴青蟹Cactus基因的cDNA克隆、序列及生物学功能

为获取拟穴青蟹Cactus基因cDNA全长、分析基本生物学信息,并初步探索其在病原物刺激下的免疫反应,实验采用RACE技术获得了拟穴青蟹Cactus(SpCactus)基因的cDNA全长序列,其cDNA全长为2035 bp,开放阅读框(ORF)1311 bp,编码436个氨基酸,分子量为46.01 ku。对蛋白理化性质进行预测发现,SpCactus为亲水性蛋白,等电点pI为4.91。经预测,SpCactus与其他物种的IκB蛋白具有相似的功能结构域。同源性比对结果显示,SpCactus与凡纳滨对虾和中国明对虾的Cactus蛋白同源性均高达62%,相似度为73%。系统进化树分析显示,SpCactus与甲壳动物聚为一支,与无脊椎动物聚为一大支。实时荧光定量PCR(RT-PCR)检测发现,SpCactus基因在拟穴青蟹不同组织中均有表达,肌肉中的表达量最高,其次为心脏、眼柄、血液和鳃,肝胰腺中的表达量最低。LPS和金黄色葡萄球菌刺激均能显著诱导SpCactus基因的表达。本实验成功扩增了SpCactus基因全长,并进行了生物信息学分析、理化性质预测,初步探讨了其生物学功能,为进一步研究其在免疫反应中的生物学功能提供参考依据。