Comparison of the Value of Pulsed-field Gel Electrophoresis,Random Amplified Polymorphic DNA and Amplified rDNA Restriction Analysis for Subtyping Taylorella equigenitalis

Eight strains of Taylorella equigenitalis were identified by a polymerase chain reaction using a primer pair specific to the 16S rDNA of T equigenitalis. These eight strains were chosen because they had previously been shown to represent eight distinct genotypes by pulsed-field gel electrophoresis analysis after separate digestion of the genomic DNA with ApaI or NotI. The eight strains could be classified into six or seven types by random amplified polymorphic DNA analysis using different kinds of primers. Amplified rDNA restriction analysis after separate digestion with five restriction enzymes, including AluI and MboI, of the 1,500 bp fragments of rDNA amplified by polymerase chain reaction did not discriminate the genomic variations among the eight strains of T equigenitalis. Thus, pulsed-field gel electrophoresis was shown to discriminate these eight organisms better than random amplified polymorphic DNA analysis, while amplified rDNA restriction analysis was found to be unsuitable for subtyping T equigenitalis.     

家蚕表皮蛋白基因的生物信息学分析

家蚕的表皮蛋白(cuticular protein)是家蚕重要的结构蛋白,与几丁质一同作为家蚕表皮的重要组成部分。运用生物信息学的方法对家蚕表皮蛋白进行了广泛分析。通过保守的基序检索家蚕基因组,得到163条候选的表皮蛋白序列,包括RR、Tweedle、CPF&CPFL等家族,并且发现具有确定的保守基序的表皮蛋白基因在染色体上都是以串联集群形式分布。氨基酸组成分析表明,这些表皮蛋白富含甘氨酸、丙氨酸、亮氨酸、组氨酸等。运用Sig-nalP server预测这部分蛋白质有85%都具有信号肽。进化分析显示,负选择是家蚕表皮蛋白基因进化的主要驱动力。采用TFSEARCH等在线服务软件分析发现,在70%含有RR基序的家蚕表皮蛋白基因的核心启动子区具有通用的TATAAA序列。     

苗期紫花苜蓿品种抗旱性初步研究

运用多元统计分析方法,以来自、美国、澳大利亚、加拿大及中国的22个紫花苜蓿Medicago sativa品种（种群）为试验材料,对紫花苜蓿在苗期进行短期干旱胁迫,依据试验测定的15个形态指标和生理指标,应用主成分分析、聚类分析法,对22个紫花苜蓿品种试验材料的抗旱能力进行综合评价。通过运用主成分分析法将15项相关的抗旱性指标简化为5个独立且功能明确的主成分,并以5个主成分的得分系数运用聚类分析法把22份材料聚为三大类,从而将22份材料分为强抗旱性品种、中抗旱性品种、弱抗旱性品种,为下一步抗旱机制的研究提供参考。     

杜鹃模拟鹰及杜鹃外形多态性的进化(英文)

很早人们就已发现一些寄生性繁殖的杜鹃,其外形与Accipiter属的鹰类非常相似。最近的实验表明,大杜鹃(Cuculus canorus)模拟鹰类有助于其接近宿主大苇莺(Acrocephalus scirpaceus)的巢。不过,大苇莺却能够通过公众信息传递来识别大杜鹃的这一计谋。反过来,这也导致了杜鹃外形多态性的进化,以避免宿主对杜鹃的识别。通过比较研究,我们发现在寄生性的杜鹃中,模拟鹰类外形(如虹膜黄色,胸腹部具斑纹,脚黄)的杜鹃种类具有明显的外形多态性(29%的种类),远高于不模拟鹰类外形的杜鹃(仅8%的种类具有多态性)。系统发生分析进一步证实了模拟鹰类外形与杜鹃多态性进化之间的相关性。我们认为,杜鹃对鹰类的动态模拟很可能促进了杜鹃外形多态性的进化,以避免宿主对杜鹃的识别。     

12份苜蓿种质材料的氨基酸分析

以新疆大叶苜蓿品种为对照,对通过田间综合农艺特性评价筛选出的12份优良苜蓿种质材料分别进行了其盛花期第一茬草和再生草茎、叶及植株(全株)的氨基酸分析.结果表明盛花期刈割供试种质材料(包括对照)植株总氨基酸平均含量为11.83%,叶总氨基酸平均含量为17.99%,茎总氨基酸平均含量为6.10%;再生草植株总氨基酸平均含量为13.78%,叶总氨基酸平均含量为20.17%,茎总氨基酸平均含量为7.19%;供试的12号、9号、3号、5号、2号和8号种质材料含有相对于新疆大叶苜蓿品种较高的总氨基酸, 来自前苏联的12号种质材料还含有较高的必需氨基酸.     

猪瘟病毒广西流行毒株E0基因的克隆与分析

应用RT-PCR方法对猪瘟病毒E0基因进行扩增、克隆及测序,用DNA Star分析软件对6株毒株与猪瘟兔化弱毒苗(HCLV)、石门(Shimen)株、Paderborn株、GXWZ02株的相应片段进行比较分析,构建了CSFV遗传进化树。序列分析表明,广西流行株与HCLV株、Shimen株、Paderborn株、GXWZ02株之间核苷酸的同源性分别为80.8%~81.5%、82.8%~83.3%、93.1%~94.2%、93.7%~94.2%,推导的氨基酸同源性分别为88.3%~89.7%、89.7%~91.1%、96.2%~97.7%、97.7%~99.1%;6株广西CSFV流行毒株与国内外已发表的14株病毒相应序列进行比较,构建遗传进化树,结果表明所比较的20株毒株分为2个基因群,广西流行毒株均属于基因群Ⅱ。本研究成功地对广西流行猪瘟病毒株的E0基因进行了测序分析,表明近年来广西流行毒株未发生较大的变异,但病毒株有远离疫苗株发展的趋势。     

113份饲草型六倍体小黑麦种质饲草产量与品质性状的评价

种质资源是遗传研究与作物改良的基础。饲草产量与品质是决定饲草型小黑麦品种利用价值的重要指标。本研究以113份国内外小黑麦种质为材料,通过2年田间种植,对其饲草产量与品质性状进行了分析与评价。结果表明参试小黑麦种质的饲草产量及其品质性状存在极显著差异,其单株鲜草产量分别为36.000～111.560 g与36.310～159.780 g,单株干草产量分别为12.000～27.000 g与9.150～30.150 g,鲜干比分别为2.380～4.370与2.610～6.210,饲草粗蛋白含量分别为6.894%～13.259%与6.680%～14.304%,饲草中性洗涤纤维含量分别为48.480%～74.850%与53.850%～67.980%,酸性洗涤纤维含量分别为26.600%～42.780%与29.000%～39.280%,饲草的相对饲用价值分别为69.650～128.150与79.840～113.170。饲草产量与品质性状的多样性指数范围为1.974～2.075。主成分分析表明,饲草纤维品质因子、饲草产量因子与综合品质因子为前3个主成分,其累计贡献率为82.198%。依据单株干草产量...     

新型鸭呼肠孤病毒DH13株结构蛋白σB的原核表达及免疫原性分析

本研究旨在利用原核表达系统表达新型鸭呼肠孤病毒（NDRV） DH13株重组σB蛋白,并检测其免疫原性,为NDRV基因工程疫苗研制等提供物质材料。采用RT-PCR方法扩增获得NDRV σB基因,构建原核表达重组质粒pET-30a-σB和pET-32a-σB,将2个重组质粒转化大肠杆菌BL21（DE3）感受态细胞,利用IPTG诱导获得相应的重组蛋白,通过SDS-PAGE分析重组蛋白的表达形式。纯化无His的σB蛋白,并以此蛋白作为免疫原免疫新西兰白兔,制备兔源多克隆抗体。利用Ni²⁺柱亲和层析法纯化含His的σB蛋白,以此蛋白作为检测原,通过间接ELISA方法测定兔源多克隆抗体效价;Western blotting鉴定多克隆抗体与重组蛋白的特异性识别能力。结果显示,PCR扩增获得大小约为1 100 bp的σB基因片段。SDS-PAGE结果显示,高效表达出了2种重组σB蛋白,大小分别约为41和46 ku,均以包涵体形式存在。间接ELISA结果显示,制备的多克隆抗体效价达1∶204 800,能特异性地识别原核表达的重组蛋白,表明重组无His的σB蛋白具有良好的免疫原性。Western blotting特异性鉴定结果显示,含His的σB蛋白和无His的σB蛋白均与制备的兔源多克隆抗体发生特异性反应,表明原核表达得到的重组σB蛋白具备良好的反应原性。本试验利用原核表达系统成功地表达出了重组σB蛋白,并证实了重组NDRV σB蛋白具有良好的免疫原性及反应原性,该结果将有助于后续对NDRV σB蛋白生物学功能的鉴定、NDRV诊断用抗原的制备及NDRV新型疫苗的研制。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒感染的诊断及其分子特点

采用流行病学调查、临床症状观察、病理学检查、病毒分离、分离毒株测序以及遗传演化分析的方法,对北京及其周边地区4个猪场剖检的4头猪进行分析。结果:流行病学和临床症状表现为急性高热性传染病;病理学观察为非化脓性脑炎和间质性肺炎等多器官严重的病理变化;RT-PCR和病毒分离确定该疫情的主要病原是猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)。与典型PRRSV感染不同的是:成年猪感染率达50%以上,病死率达80%以上;PRRSV分离株全基因序列分析表明属于PRRSV北美洲型,特别是PRRSV NSP2不连续缺失30个氨基酸,说明此次流行的PRRSV毒株可能为高致病性毒株。     

山东PRRSV流行株ORF5、ORF6、ORF7基因序列的分子特征

采用RT-PCR技术对2001~2007年分离自山东地区10株(ShanDong-3、SD-JN、SD-ZQ、SD1、SD2、SD3、SD4、SD5、SD6和SD7)猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)进行ORF5、ORF6和ORF7基因的扩增、克隆和测序,与已知序列的毒株的相应片段进行同源性分析比较,并对其分子特征进行分析。结果表明:该10株病毒仍属北美洲型,其中2001~2002年分离的SD1株、SD2株和2006年分离的SD6株核苷酸序列之间的ORF5、ORF6、ORF7同源性分别为99.2%,99.8%,100%,均与北美洲原型代表株(VR-2332株)和疫苗毒MLVRe-spPRRS Repro USA遗传距离较近,同属一大分支;2006~2007年分离的PRRSV ShanDong-3、SD-JN、SD-ZQ、SD3,SD4,SD5,SD7分离株ORF5、ORF6、ORF7同源性分别为97.8%~100%,99.4%~99.8%,99.2%~99.7%,均与国内96年Ch-1a和2002年HB-1株及2006年分离鉴定的国内高致病性分离株(JXA1、Shanghai、HEB1)同属一个大的分支。首...