Genetic diversity and antimicrobial resistance of Flavobacterium psychrophilum isolated from cultured rainbow trout,Onchorynchus mykiss (Walbaum), in Spain

Flavobacterium psychrophilum is the causative agent of bacterial cold‐water disease (CWD) and rainbow trout fry syndrome (RTFS) in salmonids. These diseases are a major problem in the aquaculture industry in Spain, and a better understanding of the epidemiology of F. psychrophilum isolates is necessary to improve management strategies. In this study, to investigate genetic variability of this bacterium, pulsed‐field gel electrophoresis after DNA digestion with endonuclease StuI, plasmid profiling analysis and antimicrobial susceptibility testing were undertaken with 25 isolates of F. psychrophilum from Spain. These isolates were classified into 17 patterns by PFGE analysis, which were grouped into four clusters and seven independent branches. Twenty isolates (80%) possessed plasmids of 3.5 kb (n = 13) or 5.5 kb (n = 7). No plasmids were associated with antibiotic resistance to oxytetracycline (OTC) or florfenicol (FLO). Twenty isolates (80%) had minimum inhibitory concentrations (MICs) to OTC of between 2.4 and 9.7 μg mL^?1, and all isolates were susceptible to FLO. A relationship between the origin of the isolates and PFGE genotypes was found. Plasmid profile typing correlated with PFGE profile typing, whereas no correlation was found between antimicrobial susceptibility testing and PFGE profiles. These results suggest that the population of F. psychrophilum with pathogenic potential in northern Spain is quite heterogeneous.     

稻瘟菌MoHYR1蛋白的原核表达与纯化

正稻瘟菌(Magnaporthe oryzae)是高等丝状子囊真菌,由其侵染水稻引发的稻瘟病是水稻第一大病害,生产上造成了巨大的经济损失。在植物与病原菌的互作过程中,植物会产生防御应答反应,其中包括活性氧自由基(reactive oxygen species,ROS)。ROS在植物抵御病原菌的侵入以及病原     

微波辅助提取桔皮果胶的理化及凝胶特性比较

为了增加桔皮利用率,提高桔皮中果胶得率和品质,以5种新鲜桔皮(丑橘、砂糖橘、芦柑、金橘、贡桔)为原料,采用微波辅助法提取桔皮中果胶,对果胶理化特性和凝胶特性进行研究。分析果胶理化及凝胶特性的相关性,并采用主成分分析法确定影响果胶凝胶特性的主要因素,优化微波辅助法提取工艺参数。结果表明:5种桔皮果胶都是高酯果胶,5种果胶理化及凝胶特性存在显著差异(P0.05),其中芦柑果胶得率和半乳糖醛酸质量分数最高,分别为12.36%、78.61%;且5种果胶理化及凝胶特性呈显著相关性(P0.05),主成分分析法确定甲氧基质量分数和果胶得率分别为主成分1和2中主要影响因子,甲氧基质量分数决定果胶种类,因此果胶种类和得率是桔皮果胶提取的主要因素。微波提取优化参数:以芦柑桔皮为原料,料液比为1:26 g/g,p H值1.30,微波功率440 W,微波时间62 s,果胶得率为16.00%。研究结果为桔皮果胶加工和应用提供理论指导。     

枯草芽胞杆菌胞外抗菌蛋白的初步分离及性质的研究

土壤中分离的枯草芽胞杆菌,其发酵液对苹果炭疽病菌具有很强的抑制作用。为了确定其抑菌物质的主要成分,本试验采用硫酸铵分级沉淀获得无菌滤液中的抗菌蛋白粗提物,超滤后经过聚丙烯酰胺凝胶电泳,胶带回收进行分离鉴定,得到1种具有抑菌活性的蛋白条带。该蛋白对供试的6种植物病原真菌具有抑制作用,该蛋白的活性表现在80℃,30min仍有抑菌作用,对pH(4~7)具有一定的适应范围、另外对紫外照射(0~12h)、抑制剂、有机溶剂均不敏感。质谱鉴定该条带含有两种蛋白,分别为假定蛋白BSU35980gi|16080651,相对分子量11 079Da,等电点4.78,匹配率为68%;丝氨酸羟甲基转移酶gi|16080743,相对分子量为45 575Da,等电点为5.56,匹配率为67%。显微观察发现抑菌蛋白可以使菌丝发生断裂、扭曲、畸形、肿大。     

泡桐叶片RNA提取方法的研究

以豫杂1号泡桐为试验材料,采用Trlzol,改良Trizol Ⅰ,改良Trizol Ⅱ,CTAB和Plant RNAtrip等方法提取其叶片总RNA,并用A260/A280值和琼脂糖凝胶电泳检测RNA的得率、纯度和完整程度.结果表明,不同方法提取的RNA在得率、纯度和完整度方面存在一定的差异.改良Trizol Ⅱ法提取RNA的A260/A280值为1.989,得率为171.0μg·g-1,电泳琼脂糖凝胶上有28,18,5 S rRNA 3条清晰的谱带,是泡桐叶片RNA提取的最佳方法.     

弱凝胶驱油效果的室内研究

根据油田高含水期的生产情况,并针对油田非均质性的地质特点,确定了适用于大庆油田弱凝胶驱的最佳方案:HPAM的质量浓度是1500mg/L,弱凝胶的注入量为0.4孔隙体积,注入弱凝胶后后续水驱压力为0.6MPa.     

适用于竹林土壤PCR-DGGE分析用的微生物总DNA提取及纯化方法

为了获得完整、高纯度的竹林土壤微生物总DNA,采用改良的十二烷基硫酸钠-高盐抽提法对5种竹林土壤进行DNA提取,通过DNA凝胶回收试剂盒纯化粗提的DNA,利用细菌16 SrDNA基因的V3区引物对纯化的DNA进行了聚合酶链式反应一变性梯度凝胶电泳（PCR-DGGE）验证。结果表明,该方法所需土壤样品少,抽提的DNA片段均在23kb以上,完整性好;采用DNA凝胶回收试剂盒纯化能够有效去除粗提DNA中大部分杂质,获得高质量的DNA;以此DNA为模板进行DGGE检测所反映的微生物信息量丰富。图3表1参15     

甘蓝型黄籽油菜种子酸性磷酸酯酶同工酶分析

本文利用聚丙烯酰胺凝胶电泳对黄籽油菜种子发育过程中籽粒的酸性磷酸酯酶同工酶进行分析。研究结果表明：种子发育过程中,不同黄籽油菜品系的酸性磷酸酯酶同工酶酶谱间存在明显差异,同一品系不同时期的酸性磷酸酯酶的活性有随着油菜的发育先增长再下降的趋势。     

植物组织双向电泳样品制备方法研究进展

摘要：双向电泳是目前应用最广泛的蛋白分离技术,该技术的核心是蛋白样品的制备。植物组织中通常含有大量蛋白酶和次生代谢物,这严重干扰蛋白提取、分离和鉴定。从植物组织中提取高质量的蛋白样品用于蛋白组分析充满挑战,本文简要阐述了植物组织蛋白提取的关键点,特别是植物组织中的次生代谢物及去除方案。此外,本文还对三种植物蛋白提取方法、三种方法的优缺点及适用植物组织作了概述。     

活性污泥驯化过程中芘降解菌的群落多样性分析

将采自炼油厂污水处理生化反应池的活性污泥以芘为唯一碳源进行富集培养与驯化,通过对6个不同时期混合菌群总DNA的提取,采用降落式PCR和变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对细菌16S rDNA 基因V3区进行扩增和产物分离,对活性污泥驯化过程中芘降解菌的群落多样性进行了研究.结果表明,在驯化过程中,芘降解菌的群落结构和种群数量存在明显的演替过程,芘浓度的大小是影响芘降解菌的群落结构和种群数量的重要因素.