An insight into population structure and gene flow within pure‐bred cats

Investigation of genetic structure on the basis of pedigree information requires indicators adapted to the specific context of the populations studied. On the basis of pedigree‐based estimates of diversity, we analysed genetic diversity, mating practices and gene flow among eight cat populations raised in France, five of them being single breeds and three consisting of breed groups with varieties that may interbreed. When computed on the basis of coancestry rate, effective population sizes ranged from 127 to 1406, while the contribution of founders from other breeds ranged from 0.7 to 16.4%. In the five breeds, F_IS ranged between 0.96 and 1.83%, with this result being related to mating practices such as close inbreeding (on average 5% of individuals being inbred within two generations). Within the three groups of varieties studied, F_IT ranged from 1.59 to 3%, while values were estimated between 0.04 and 0.91%, which was linked to various amounts of gene exchanges between subpopulations at the parental level. The results indicate that cat breeds constitute populations submitted to low selection intensity, contrasting with relatively high individual inbreeding level caused by close inbreeding practices.     

检测水貂出血性肺炎绿脓杆菌的比色LAMP法的建立与应用

为了快速有效检测水貂出血性肺炎病原绿脓杆菌,本研究结合金属指示剂HNB特性建立了快速检测绿脓杆菌比色LAMP法。根据绿脓杆菌外毒素A基因设计引物,建立了检测LAMP法;并且对该方法进行了特异性、灵敏性分析;同时进行了初步应用。结果显示,该方法特异性强,灵敏性好,可检测167CFU/mL的菌体,对病貂肺脏检出率高。结果表明,该比色LAMP法可以有效地检测水貂出血性肺炎绿脓杆菌。     

大菱鲆源鳗弧菌毒力基因的检测及序列分析

采用PCR方法,对分离于大菱鲆的30株致病性鳗弧菌进行了溶血素vah1基因、鞭毛蛋白flaA基因、金属蛋白酶empA基因及外膜蛋白ompU基因的检测,选取3个代表菌株的相应基因序列通过Blast与GenBank中公布的参考菌株进行核苷酸同源性比较分析。结果表明,所检测的30株鳗弧菌均携带vah1、flaA、empA、ompU基因,携带率为100%;所测代表菌株的vah1、flaA、empA基因同参考菌株间均具有较高的同源性（93.9%～99.9%）,而外膜蛋白ompU基因,3株代表菌间存在较大差异（86.0%～95.9%）,其中的S010610-1株与其他2株代表菌及参考菌株均存在较大差异,在进化树中单独聚为一支。3株代表菌的其他基因（vah1、flaA、empA）均具有较高的同源性（94.2%～99.5%）,但均存在一定的差异性。     

霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法的建立与应用

采用一种新型的引物设计方法——双启动寡核苷酸引物（dual-priming oligonucleotide,DPO）,以霍乱弧菌mdh基因为靶序列,建立了霍乱弧菌DPO-PCR特异性检测方法,分析了DPO引物退火温度不敏感性、检测灵敏度及特异性,并对检测方法进行了初步应用。灵敏度结果显示,DPO-PCR方法对霍乱弧菌的最低检出限为1.07×10^2 CFU/mL。退火温度不敏感性试验中,与常规PCR引物相比,DPO引物在45～65℃退火温度均能够高效扩增出靶基因片段。特异性结果显示,DPO-PCR方法的特异性比常规PCR方法强,不产生任何非特异性扩增。利用建立的霍乱弧菌DPO-PCR检测方法对采集的550份样本进行检测,检出43份霍乱弧菌阳性样本,经行业标准法（SN/T2425-2010）复检,检测结果相同,表明所建立的DPO-PCR检测方法具有良好的实用性,为霍乱弧菌的快速准确检测提供了新途径。     

水通道蛋白9的研究进展

水通道蛋白9在机体内许多器官组织中表达,它对水、尿素、甘油等分子均有通透性,其基因结构、染色体定位、蛋白质结构、组织分布和生理功能也已得到了较为深入的研究。本文对水通道蛋白9基因的结构特点、分子结构、分布和生理功能作一综述,以期为相关疾病诊治和生产实践提供理论依据。     

国内商品化猪圆环病毒疫苗的现状及展望

截至2013年12月份,已有16家企业6种不同的猪圆环病毒2型灭活疫苗获得了农业部的注册,其中有批签发的企业14家。整理了猪圆环病毒疫苗在我国的商品化情况,分类总结了该类疫苗工艺核心等基本情况,同时分析了猪圆环疫苗的优缺点,并对猪圆环病毒疫苗的发展前景进行了展望。     

对虾病原菌2—5B菌株16SrRNA基因片段的克隆和序列测定

用引物ＰＬ１－ＰＬ２ＰＣＲ扩增对虾病原菌－坎普氏弧菌２－５Ｂ菌株１６ＳｒＲＮＡ基因－１２２３ｂｐ的片段，采用ｐＵＣ１９质粒构建ｄＴ载体法完成该片段的克隆。部分序列测定及分析结果表明，该菌株与ＧｅｎＢａｎｋ中坎普氏弧菌标准株序列之间同源性为９６．９４％。     

刚毛柽柳 FeSOD 基因的克隆及耐盐应答分析磁

植物响应盐胁迫逆境,涉及一系列的保护酶类基因的表达和调控, SOD酶是其中重要的一类。本研究通过对盐胁迫后7个柽柳转录组分析和进一步测序验证,获得了2个柽柳FeSOD基因全长cDNA序列,它们编码蛋白的氨基酸残基数分别为256、308,分子量为63.8、75.4 kDa,理论等电点为5.0和5.1。实时荧光定量PCR结果显示这2个FeSOD基因在盐胁迫后柽柳根和叶中呈现不同的表达模式。在根中,第9天时, ThFeSOD1和ThFeSOD2基因的表达均明显上调。在叶中, ThFeSOD1和ThFeSOD2在胁迫3天受明显的诱导,而5天表达受明显的抑制。     

广西德保猪抵抗素基因的克隆与分析

[目的]克隆广西德保猪抵抗素（Resistin,RENT）基因并进行系统生物信息学分析,阐明德保猪脂肪细胞分化与脂肪生成的分子机制.[方法]根据NCBI已公布的猪RENT基因序列（NM 213783.2）设计特异性引物,以从德保猪血液中提取的总RNA为模板,PCR扩增RENT基因序列,T-A克隆至pEASY-T1载体后进行测序分析,并将所得测序结果用BLAST程序、MEGA 5.0软件、EXPASY服务器、SMART程序、SignIP程序、Softberry服务器和DNASTAR软件进行生物信息学分析.[结果]扩增获得468 bp的RENT基因序列片段,包含全长的德保猪RENT基因编码区和部分非编码区序列.多重序列比较分析结果显示,德保猪RENT基因编码区核酸序列与猪、牛、山羊、绵羊、人、兔、猕猴和豚鼠的同源性分别为100.0％、85.5％、85.5％、84.5％、81.2％、80.3％、80.0％和77.3％.德保猪RENT蛋白结构预测结果显示,其理论分子质量11.69 ku,等电点7.82,为弱碱性蛋白;N-末端存在信号肽,定位于胞质外,仅具有1个低复杂度结构域,包含1个α-螺旋、8个β-折叠、7个T-转角及两个无规则卷曲.[结论]RENT基因在德保猪中呈高度保守特征,是其脂肪细胞分化中的重要调控基因.     

农杆菌介导美味猕猴桃基因转化影响因素研究

[目的]建立美味猕猴桃叶片外植体转化体系,为猕猴桃遗传转化研究奠定良好基础.[方法]以美味猕猴桃组培苗叶片为材料,研究不同浓度乙酰香酮（AS）对外植体β-葡萄糖苷酸酶基因（GUS）瞬时表达阳性率的影响,及暗培养时间与抗褐化剂二硫苏糖醇（DTT）、聚乙烯呲咯烷酮（PVP）对外植体褐化、抗性芽诱导的影响.[结果]仅在侵染菌液中添加AS时,100、150、200 μmol/L AS 3个处理的外植体GUS阳性率均极显著高于对照,分别为14.6％、16.7％、10.7％;而当农杆菌侵染液与共培养基中同时添加100～150μmol/L AS,可使GUS瞬时表达阳性率提高至37.9％.选择培养初期经过2～12 d暗培养后,外植体褐化率不断下降,抗性芽诱导率不同程度提高,其中以暗培养6、8d处理的褐化率相对较低,分别为33.2％和30.6％,且相应的抗性芽诱导率最高,分别为14.2％和13.1％,极显著高于其他处理与对照.在分化培养基中添加1.0～2.0 g/L的DTT并暗培养6d的效果优于对应浓度的PVP;其中1.5 g/L DTT并暗培养6d,可使外植体褐化率降至13.4％,卡那霉素抗性芽诱导率提高至24.3％.卡那霉素抗性植株叶片GUS染色与PCR扩增结果显示,ShivaA基因已转化至美味猕猴桃秦美.[结论]AS不同使用方式及其浓度对叶片GUS瞬时阳性表达率的提高具有明显影响;选择培养初期进行暗培养6～8 d或暗培养结合添加1.0～2.0 g/L DTT抗褐化剂,均可降低美味猕猴桃叶片转化芽再生过程中的褐化,提高转化效率.