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狂犬病病毒糖蛋白基因的克隆及其二级结构和B细胞抗原表位预测 总被引:1,自引:0,他引:1
对狂犬病病毒CVS株糖蛋白基因进行克隆与测序,推导出相应的氨基酸序列。然后采用Gam-ier-Robson法和Chou-Fasman法预测糖蛋白的二级结构,用Kyte-Doolittle法、Emini法和Jameson-Wolf法分别预测蛋白质的疏水性、表面可能性和抗原指数,并综合分析预测糖蛋白的B细胞抗原表位。结果表明,该蛋白结构中含有少量的α螺旋、较多的β折叠以及较为丰富的转角区域,在序列的121~126、133~137、161~165、191~193、201~204、214~216、221~225、264~267区域或其附近最有可能是B细胞抗原表位的优势区域。 相似文献
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泛素-26s蛋白酶体途径(ubiquitin-26s proteosome pathway,UPP)是真核生物体内一种高度选择性的蛋白降解途径。U—box蛋白是该途径中决定底物特异性的一种泛素连接酶E3。U—box结构域大约由70个氨基酸残基构成,在酵母、植物和动物等真核生物中高度保守。植物U-box蛋白(plant U—box protein,PUB)的数目远多于其他生物,在植物的生长发育过程中起着重要作用。目前在拟南芥中已发现60多个PUB蛋白(Arabidopsis plant U-box protein,AtPUB),成为近年来受到较多关注的一类蛋白。本文根据蛋白的结构特征和系统进化树比较,将61种AtPUB蛋白分为7大类。同时,对已报道AtPUB蛋白的功能进行了综述并提出了研究展望。 相似文献
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本文利用Signa1P3.0两种算法NN(neural network)和HMM(hidden markov model)对水稻基因组中59712个ORF进行了初步的筛选,其中有4433个ORF编码的蛋白具有分泌特性,占整个基因组的7.3%。4433个具有分泌特性的蛋白,在染色体的分布是不均一的。在1号染色体的所占的比例最多,为8.8%;而12号染色体上所占的比例最少,为5.0%。其中在具有分泌特性的蛋白中,酶类、非酶类和推测蛋白分别占具有分泌型信号肽蛋白的24.9%、45.7%和29.5%。 相似文献
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ANDRIJ Z. HORODYSKY DAVID W. KERSTETTER ROBERT J. LATOUR JOHN E. GRAVES 《Fisheries Oceanography》2007,16(3):240-256
Researchers have applied numerous techniques to improve billfish stock assessments, including habitat‐based models that incorporate behavioral and oceanographic parameters to standardize historical catch‐per‐unit‐effort time‐series data. These methods have allowed researchers to account for significant changes in the depths of pelagic longline (PLL) gear deployments over time. This study presents habitat‐use data recovered from high‐resolution 5‐ and 10‐day pop‐up satellite archival tags (PSATs) attached to 47 surviving white marlin released from commercial and recreational fishing gears offshore of the U.S. East Coast, the northern Caribbean, and Venezuela between 2002 and 2004. Data recovered from transmitting tags indicated that white marlin spent nearly half of their time associated with warm, near‐surface waters (<10 m). All fish displayed frequent short duration (mean: 39.8 min) vertical excursions from surface waters to depths averaging 51 m. Qualitative and multivariate classifications of data from completely transmitted movements of surviving white marlin revealed two major types of descents: one pattern was characterized by deep ‘V’‐shaped excursions of relatively short duration (mean: 23.4 min) while the other featured descents that were more broadly ‘U’‐shaped and confined to a specific depth range for an extended period of time (mean: 75.8 min). Based on the frequency, persistence, and patterns of these vertical movements, white marlin appear to direct a considerable proportion of foraging effort well below surface waters, a behavior that may account for relatively high catch rates of white marlin on some deep‐set PLL deployments. 相似文献
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大菱鲆致病性溶藻弧菌SR1的外膜蛋白及其抗原性分析 总被引:3,自引:0,他引:3
用十二烷基肌氨酸钠(Sarkosyl)抽提结合超速离心的方法提取了一株大菱鲆致病性溶藻弧菌(Vibrio alginolyticus)SR1和其他7株弧菌的外膜蛋白。通过SDS-PAGE图谱分析比较了这8株弧菌外膜蛋白的组成,结果表明,8株弧菌的外膜蛋白电泳一般可得到6-12条条带,其分子量多集中在65-106 kD和28-48 kD,其中36 kD的蛋白带为8株弧菌所共有。用兔抗SR1全菌血清进行Western-blot印迹显示,菌株SR1的外膜蛋白条带中有6条发生了阳性反应,其分子量分别为73 kD、48 kD4、5 kD3、9 kD、36 kD和32 kD。而其他7株弧菌的外膜蛋白与兔抗SR1血清也发生程度不等的阳性反应,这些阳性反应条带的分子量集中在65-73 kD、45-48 kD和36-41 kD之间,其中36 kD的外膜蛋白在8株弧菌中均出现明显的阳性反应,说明36 kD的外膜蛋白是这8株弧菌共有的特异性抗原。 相似文献
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人工神经网络NIR定量分析方法及其软件实现 总被引:3,自引:3,他引:0
在Visual C++环境中采用面向对象技术,开发了PCA-MBP-NIR定量分析模型软件。通过40份小麦样品的原始光谱、加噪光谱(信噪比为14dB)与含水率所建立的PLS-NIR与PCA-MBP-NIR模型,对10份未知小麦样品的原始光谱、加噪光谱分别进行含水率的PLS-NIR与PCA-MBP-NIR预测分析。分析表明,对于含噪声的光谱,与PLS建模相比,使用PCA-MBP-NIR对未知样品预测结果具有更高的相关系数,更低的预测误差标准差。 相似文献