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【目的】通过分析西门塔尔牛肌内脂肪和皮下脂肪差异表达miRNA,及对重要的候选miRNA-27b进行靶基因预测及相关生物信息学分析,探索miRNA在动物肌内脂肪生长、发育过程中的作用及其调控机制。【方法】利用miRNA微阵列芯片技术对肌内脂肪和皮下脂肪miRNA表达谱进行检测和分析以筛选差异表达miRNA;qRT-PCR方法验证4个在肌内脂肪显著高表达的候选miRNAs;采用Targetscan生物信息学计算方法预测目标miR-27b(对肌内脂肪沉积可能起重要调节作用)的靶基因,并对靶基因进行GO注释描述、富集分析及KEGG富集。【结果】miRNA芯片分析发现肌内脂肪和皮下脂肪共有88个差异表达极显著miRNA(P<0.01)。候选的4个在肌内脂肪高表达miRNAs(miR-140、miR-145、miR-143、miR-27b)的qRT-PCR检测结果与芯片分析结果具有很好的一致性。KEGG富集显示,目标miR-27b的预测靶基因在MAPK、Wnt、Hedgehog、TGF-beta、GnRH等信号通路中显著富集,其中在MAPK信号通路中富集度最高。【结论】牛肌内脂肪和皮下脂肪组织中确实存在一些差异表达的miRNAs,某些重要的在差异高表达miRNA(如miR-27b)可能以独特的通路(如MAPK信号)来调节牛肌内脂肪的形成过程。 相似文献
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G protein signalling involved in host recognition and mycoparasitismrelated chitinase expression in Trichoderma atroviride 下载免费PDF全文
Susanne Zeilinger Barbara Reithner Kurt Brunner Valeria Scala Isabel Peiβl Matteo Lorito Robert L Mach 《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2004,30(4):448-448
Mycoparasitic species of Trichoderma are commercially applied as biological control agents against various fungal pathogens. The mycoparasitic interaction is host specific and includes recognition, attack and subsequent penetration and killing of the host. Investigations on the underlying events revealed that Trichoderma responds to multiple signals from the host (e.g. lectins or other ligands such as low molecular weight components released from the host's cell wall) and host attack is ac… 相似文献
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荔枝霜疫霉(Peronophythora litchii)隶属于茸鞭生物界卵菌门疫霉属,由其引起的荔枝霜疫病是目前荔枝生产上一种最重要的病害,严重影响荔枝产量和鲜果品质。双组分信号途径在微生物中参与多种生命活动,但是在卵菌中尚未有相关研究。本研究通过生物信息学分析在荔枝霜疫霉中鉴定到2个杂合型组氨酸激酶(PlHK1、PlHK2)和1个响应调控蛋白(PlRR1)。其在卵菌中是保守存在的,并且与真菌在进化上相对独立。功能域分析表明,PlHK1和PlHK2的C端额外的融合了1个磷酸转移功能域(Hpt),这与真菌和植物的存在显著差异。转录分析表明3个基因在荔枝霜疫霉侵染阶段上调表达,并且响应渗透胁迫和氧化胁迫。以上结果揭示了双组分信号系统可能在疫霉致病过程中发挥重要作用。 相似文献
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67.
The method to carry out time frequency analysis of engineering signal using wavelets transform is discussed and the formuli of quantitative relationship between the position & width of time frequency window of wavelet transform and the scale & sampling interval is put forward. 相似文献
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近年来大量的研究结果表明,甲型流感病毒的非结构蛋白质1(NS1)是在感染病毒期间具有多个辅助功能的毒力因子,为揭示该人畜共患病毒的致病性机理提供重要参考价值。这篇文章综述了该病毒蛋白质一些最新研究进展,包括NS1的合成、结构、亚细胞定位及在病毒复制机制、宿主天然免疫应答或/和适应性免疫应答、细胞信号传导中发挥各种作用。作者重点阐述了NS1-RNA之间和NS1-蛋白质之间的相互作用,因为它们都是上述功能和过程的基础。同时突出不同毒株NS1蛋白可能特有的特性,鉴于此,也讨论了NS1对人和动物甲型流感病毒致病性的某些作用。最后概述NS1可能应用于流感疫苗的研制、新抗病毒药物的研发等。同时比较了乙、丙型流感病毒NS1研究新进展。 相似文献
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[目的]研究细菌个体间通讯信号N-己酰高丝氨酸内酯(C6-HSL)是否可以影响植物的生长和抗病能力。[方法]以马铃薯脱毒苗为试验材料,C6-HSL为诱导剂研究了经不同浓度C6-HSL处理后,马铃薯生长、抵抗胡萝卜软腐欧文氏菌浸染的情况,特别研究了C6-HSL对植株标志性防御酶活性和H2O2含量的影响。[结果]不同浓度的C6-HSL能明显抑制马铃薯的出根率和生根数。而对株高、茎节数及叶片大小没有影响;植物标志性防御酶类中POD和SOD的活性以及H2O2的产生量经C6-HSL诱导后显著提高,而PAL和PPO的活性则没有明显变化;抗痛试验中,经C6-HSL诱导的马铃薯植株能有效抑制胡萝卜软腐欧文氏菌的侵染,发病率明显低于对照组。[结论]细菌AHL有可能成为一种新的植物抗病激活剂。 相似文献