转座酶TN3体外定向进化研究概况

Tn3是存在于生物体内的一种非常重要的转座酶,其是基因组中具有一段特异的转位特性的独立的DNA序列,从而对目的基因起调控作用。转座酶Tn3具有基因敲除的功能,Gal4能识别DNA启动子上游两端保守的17bp长的一段序列,因此将Tn3与Gal4相组合,实现靶向敲除目的基因的目的。论文综述了转座酶Tn3的结构及其转座机制、Gal4的结构及其机制、Tn3-Gal4系统的简介和酶分子的定向进化,旨在为今后靶向基因的敲除以及靶向基因的修复提供研究思路。     

降解布洛芬克隆菌株转座子插入突变体的构建

【目的】敲除布洛芬福斯质粒文库克隆菌株4F6中的邻苯二酚-2,3-双加氧酶基因(C23O),构建其Tn5插入突变体,为布洛芬降解调节因子的深入研究奠定基础。【方法】以构建好的3G7Tn5突变体菌株为基础,借助pKD46质粒的λ-red同源重组酶,将转座子Tn5从菌株3G7中电击转化至4F6,消除pKD46质粒,敲除4F6菌株中的C23O基因,测定出发菌株3G7、4F6及Tn5插入突变体菌株3G7-G9、3G7-H5、4F6-G9和4F6-H5间位苯环的裂解活性。【结果】42℃条件下消除了Tn5插入突变体受体菌4F6中的pKD46质粒,构建了4F6-G9和4F6-H5突变体。Tn5转座子插入突变株3G7-G9、3G7-H5、4F6-G9和4F6-H5的间位苯环裂解活性无显著差异;菌株4F6的间位苯环裂解活性虽明显高于菌株3G7,但也仅有1个C23O基因,其活性差异可能与布洛芬降解调控因子有关。【结论】提供了一种简便有效定位并敲除C23O基因的方法。     

高油酸新品种花育917在花生主产区的展示试验

为客观评价高油酸花生新品种的特征特性及生产利用价值,本研究对高油酸花生新品种花育917进行了产量鉴定和品质分析。结果表明:在花生主产区参加试验的8个品种中,花育917表现出稳产、高产、适应性好的优势。花育917油酸含量77.5%,油亚比13.5,符合高油酸花生标准。其株型为小匍匐型,连续开花结果,单株结果率高,适合精准的单粒稀播技术。     

Pyoluteorin production byPseudomonas fluorescens strain CHA0 is involved in the suppression ofPythium damping-off of cress but not of cucumber

Pseudomonas fluorescens strain CHA0 is an effective biocontrol agent of various soilborne pathogens. It controls damping-off or root rot caused byPythium ultimum on cucumber, wheat and cress. Strain CHA0 synthesizes several antibiotic metabolites such as hydrogen cyanide, 2,4-diacetylphloroglucinol, and pyoluteorin. The role of pyoluteorin in the suppression of damping-off was investigated. Two Tn5 mutants (CHA660 and CHA661) of strain CHA0 were isolated which had lost the capacity to produce pyoluteorin but still produced 2,4-diacteylphloroglucinol and HCN. These mutants still inhibitedP. ultimum on malt agar (which favours the production of 2,4-diacetylphloroglucinol) but had partially lost the ability to inhibit this pathogen on King's B agar (which favours the production of pyoluteorin). The two pyoluteorin-negative mutants showed a reduced capacity to suppress damping-off of cress caused byP. ultimum but were as effective in the protection of cucumber against this pathogen as the wild-type strain.These results indicate that, depending on the plant, pyoluteorin production plays a role in the suppression of damping-off by strain CHA0 without being a major mechanism in disease suppression. We suggest that the contribution of pyoluteorin to the biocontrol activity of strain CHA0 is determined by the quantity of this antibiotic produced in the rhizosphere, which might depend on the root exudates of the host plant.     

绿针假单胞菌PL9菌株对烟草疫霉的拮抗作用研究

利用离体拮抗试验和烟草幼苗生物测定法研究了棉花根圈细菌绿针假单胞菌（Pseudomonas choloraphis)PL9菌株对烟草黑胫病原菌烟草疫霉（Phytophthora parasitica var.nicotianae)的拮抗作用，该菌株对烟草疫霉菌丝体有很强的抑制作用，并且可以完全抑制烟草疫霉游动孢子对烟草幼苗的侵染，其液体培养物浓缩过滤液也有相同的报制作用，拮抗作用机理研究结果表明，其拮抗作用可能与PL9菌株分泌的抗生素类物质有关。为了解PL9菌株在烟草根圈的定殖情况，采用全套发光酶基因（luxCDABE)标记的菌株PL9L进行跟 踪，结果表明该菌株可以在烟草根圈成功定殖。     

禽源奇异变形杆菌质粒介导AmpC酶基因型检测与质粒分析

【目的】研究禽源奇异变形杆菌携带ampC基因的分型和bla_CMY-2阳性接合质粒pC12的序列结构,为防控多重耐药禽源奇异变形杆菌的传播提供理论基础。【方法】利用头孢西丁三维试验和PCR方法对21株奇异变形杆菌进行AmpC酶的检测和基因分型研究;对bla_CMY-2阳性菌株进行脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型和接合试验;利用高通量测序技术获得pC12的核苷酸序列并进行比较分析。【结果】头孢西丁三维试验表明21株禽源奇异变形杆菌中有6株产AmpC酶。6株产AmpC酶奇异变形杆菌对氨苄西林、头孢西丁、多西环素、氟苯尼考、粘菌素全部耐药,而对头孢他啶、阿米卡星全部敏感。耐药基因PCR扩增和测序结果表明,6株菌均携带bla_CMY-2,检出率为28.6%。接合试验表明,1株奇异变形杆菌C12接合成功并获得接合子,其余5株接合不成功。PFGE分型结果表明,酶切图谱分为3个型别,bla_CMY-2在禽源变形杆菌中存在垂直和水平传播。测序结果表明菌株C12含有一个1b型IncC质粒,其全长161 319 bp,GC含量为52.45%,预测有161个开放阅读框,提交NCBI并获得序列号MT320534。该质粒包含3个耐药区：第一个抗生素耐药区（antibiotic resistance islands,ARI-B）携带floR、tet(A)、strA、strB和sul2;第二个耐药区是一个典型的ISEcp1-bla_CMY-2-blc-sugE结构,其中的ISEcp1被一个插入的IS10R截断;第三个耐药区（ARI-A）是一个杂合的Tn1696tnp-pDUmer转座子,包含一个1类整合子基因盒（aac(6')-Ib-cr|arr3|dfrA27|aadA16）和汞抗性基因簇merEDBAPTR,其插入到质粒骨架产生两个重复序列TTGTA,该耐药区也是1型IncC耐药区变化最大的区域。【结论】6株产AmpC酶禽源奇异变形杆菌均携带bla_CMY-2,其酶切图谱分为3个PFGE型别,其中一株菌携带了一个流行的bla_CMY-2阳性1型IncC可接合质粒。广宿主的IncC质粒是bla_CMY-2、tet(A)、floR等多个耐药基因及整合子的重要载体之一,该质粒在动物源奇异变形杆菌的传播扩散进一步增加了治疗该菌感染的难度,应引起足够的重视。     

筛选用转座子Tn916诱变的具有_省略_疫原性的嗜水气单胞菌蛋白酶缺失株

以携带质粒pAM120(Apr、Tcr/Tn916)的大肠杆菌CG120株为供体菌，与受体菌嗜水气单胞菌J-1株，采用滤膜接合法进行接合转移，在选择平板(含Tc、cfz和脱脂奶)上进行筛选，筛选出6株蛋白酶缺失株(ECPase-)，ECPase-菌株其生长速度，对正常鲫血清的抗性降低，用脱脂奶平板法及底物法检测，蛋白酶产量明显降低。与亲本J-1株相比，突变株致病力降低，对鲫的半数致死量大于108(J-1株对鲫的半数致死量为5×103)。用ECPase-突变株MJ-1株的18h培养物(5×106CFU)接种健康鲫，不产生亲本J-1株引起的病变及死亡。用MJ-I活菌免疫鲫，在第5周产生较高的凝集抗体，且对强毒株J-1的攻击有保护作用。表明蛋白酶是嗜水气单胞菌的一个重要的毒力因子，ECPase-突变株仍具有免疫原性。     

短小芽胞杆菌DX01菌株Tn5转座突变株的抑菌活性筛选体系的建立

为建立短小芽胞杆菌Bacillus pumilus DX01菌株的Tn5转座突变株抑菌活性的高效筛选体系,采用发酵液平板抑菌法研究了各突变株发酵液对稻瘟病菌Magnaporthe grisea生长的影响,并测定了目标突变株的几丁质酶和蛋白酶活性及发酵液对稻瘟病菌分生孢子萌发的抑制率。从2 633个突变株中筛选出6个抑菌活性较对照菌株DX01显著变化的突变株。对照DX01发酵液对真菌孢子萌发的抑制率为36%,而突变株Tn5-901和Tn5-194则分别为96%和3%,抑菌活性与对照的差异达到极显著水平。其余4个突变株的几丁质酶、蛋白酶活性多重比较结果与发酵液平板抑菌结果并不完全一致,但发酵液平板抑菌法简单、高效,适用于短小芽胞杆菌突变株的抑菌活性初筛。