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941.
生物大分子标记物检测在环境监测中的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
生物大分子标记物是指生物体内的一些对外界环境变化敏感并能产生一些可检测变化的大分子物质,这些大分子物质能够反映环境变化对生物体的影响。随着社会对环境保护的日益重视和分子生物学技术的发展,将生物大分子标记物的检测应用到环境监测中已经成为一种趋势。生物大分子标记物检测由于其测定指标全面、准确、系统且具有特异性等优点,近十几年来作为污染物暴露和毒性效应的早期预警工具已被广泛应用于环境评价中。本文对一些主要的生物大分子标记物及其检测技术在环境监测中的应用状况及应用前景进行综述,旨在为生物大分子标记技术在环境检测实际操作中的应用提供参考依据。 相似文献
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[目的]开发银鲳分子标记技术。[方法]通过对银鲳(Pampus argenteus)进行高通量转录组测序(RNA-seq )获得银鲳转录组原始试验数据,经过拼接后,获得3715603条unigene序列。采用生物信息学分析软件MISA对所有unigene进行简单重复序列( simple se-quence repeat,SSR)位点鉴定。同时,利用软件对银鲳转录组SSR的多态性进行评价。[结果]银鲳转录组水平上,共鉴定出107007个SSR位点,分布在97289条unigene中,发生频率为2.62%,SSR平均密度为476个/Mbp。在银鲳转录组SSRs中,单核苷酸与二核苷酸重复序列为主要重复类型,分别占总SSRs的48.14%和34.10%。银鲳转录组数据中SSR序列共包括424种重复基元类型,单核苷酸重复基元A占较高比例,占同一重复类型SSRs的49.57%,二核苷酸重复基元TG/AC和三核苷酸重复基元GAG/AAC是优势重复基元,分别占同一重复类型SSRs的42.43%和9.61%。重复序列长度在12 bp以上的SSR标记位点数占总SSR的76.95%,具有丰富的多态性。[结论]银鲳SSRs位点具有极大的可开发性,可为银鲳遗传多样性研究、遗传图谱构建及分子辅助育种提供有效工具。 相似文献
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944.
阐述了农作物数量性状基因座(QTL)在遗传育种中的地位和意义,介绍了作物QTL的基本原理和方法及在甜菜上的研究进展。 相似文献
945.
通过对9份白菜细胞质雄性不育材料的不育胞质类型进行分子标记鉴定,以期为今后更好的利用分子标记来进行辅助育种奠定基础。通过CTAB法提取白菜的基因组DNA,根据GenBank中orf138基因保守序列设计2对特异引物,对9份白菜基因组DNA进行PCR扩增,将扩增出条带的PCR产物进行测序,在NCBI中进行同源性比对,最终确定其不育胞质类型。结果表明:2对特异引物PI/PII和PIII/PIV只在4份白菜雄性不育基因中均扩增出条带,在另外5份材料中未扩增出条带,与田间育性鉴定相符,获得4份白菜Ogura胞质雄性不育的分子标记;在GenBank中用BLAST进行同源性比对分析,发现L1-CI、L3-CI、L3-F1 3个不育材料的特异片段与已报道的青花菜Ogu CMS所具有的Ogu orf138基因(Genbank登录号:HQ149728)同源度高达100%,L1-F1的同源度达99%,出现了一个变异位点,另外5份材料的胞质不育类型有待进一步研究。通过该方法鉴定出9份材料中有4份材料是萝卜胞质雄性不育的材料,得到了4条分子标记,该结果可为白菜细胞质雄性不育的分子鉴定提供了新的标记,也为今后利用分子标记辅助育种奠定了基础。 相似文献
946.
Identification and marker‐assisted introgression of QTL conferring resistance to bacterial leaf blight in cowpea (Vigna unguiculata (L.) Walp.) 下载免费PDF全文
Hebse Bhojappa Dinesh Hirenallur Chandappa Lohithaswa Kannalli Paramashivaiah Viswanatha Poonam Singh Annabathula Mohan Rao 《Plant Breeding》2016,135(4):506-512
Bacterial leaf blight (BLB), caused by Xanthomonas axonopodis pv. vignicola (Xav), is widespread in major cowpea [Vigna unguiculata (L.) Walp.] growing regions of the world. Considering the resource poor nature of cowpea farmers, development and introduction of cultivars resistant to the disease is the best option. Identification of DNA markers and marker‐assisted selection will increase precision of breeding for resistance to diseases like bacterial leaf blight. Hence, an attempt was made to detect QTL for resistance to BLB using 194 F2 : 3 progeny derived from the cross ‘C‐152’ (susceptible parent) × ‘V‐16’ (resistant parent). These progeny were screened for resistance to bacterial blight by the leaf inoculation method. Platykurtic distribution of per cent disease index scores indicated quantitative inheritance of resistance to bacterial leaf blight. A genetic map with 96 markers (79 SSR and 17 CISP) constructed from the 194 F2 individuals was used to perform QTL analysis. Out of three major QTL identified, one was on LG 8 (qtlblb‐1) and two on LG 11 (qtlblb‐2 and qtlblb‐3). The PCR product generated by the primer VuMt337 encoded for RIN2‐like mRNA that positively regulate RPM1‐ and RPS2‐dependent hypersensitive response. The QTL qtlblb‐1 explained 30.58% phenotypic variation followed by qtlblb‐2 and qtlblb‐3 with 10.77% and 10.63%, respectively. The major QTL region on LG 8 was introgressed from cultivar V‐16 into the bacterial leaf blight susceptible variety C‐152 through marker‐assisted backcrossing (MABC). 相似文献
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948.
以普通小麦重组近交系(recombinant inbred lines,RIL)‘Q9086×陇鉴19’为作图群体,利用SSR标记构建小麦遗传连锁图谱.结果表明:通过选用2 187对SSR引物筛选出RIL群体双亲表现多态性的引物共405对,多态性频率为18.52%.不同类型SSR标记多态性频率从小到大依次为Xpsp(4.4%)相似文献
949.
采用微卫星标记分析技术,用5个多态性的微卫星标记对来自3个不同国家(中国、日本和韩国)的牙鲆养殖群体进行了遗传多样性研究。研究结果表明,3个牙鲆群体平均等位基因在4.8~5.6之间,平均观测杂合度(H0)在0.3917~0.5643之间,平均期望杂合度(HE)在0.5981~0.6264之间。有多个位点在不同的群体中偏离哈代-温伯格平衡。遗传距离分析表明,中国群体与日本群体遗传距离最近,韩国群体与日本群体遗传距离最远。分子方差分析(AMOVA)表明,群体内遗传变异与群体间遗传变异分别占总遗传变异的92.44%和7.56%,固定系数(R)为0.0752(P〈0.001),表明牙鲆3个养殖群体遗传分化显著。 相似文献
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