R软件在森林生物多样性动态监测中的应用

森林生物多样性动态监测样地的数据巨大且繁杂,迫切需要一种功能强大且灵活的软件来处理,R软件具有免费、开源、强大的统计分析及其完美的作图功能.基于西双版纳20 hm2热带季节雨林动态监测样地的野外调查数据,采用R软件处理.着重介绍了R软件在地形图的绘制、种面积曲线和种序列曲线的绘制、以及物种空间分布图等方面的应用,希望能起到抛砖引玉的作用.     

瓯江彩鲤体色调控相关因子MC1R的克隆与表达分析

黑素皮质素1受体(melanocortin 1 receptor,MCIR)是动物黑色素合成通路中的关键基因之一,对动物的体色和毛色有重要影响.瓯江彩鲤(Cyprinus carpio var.color)具有5种基本体色类型(“全红”、“粉玉”、“大花”、“粉花”和“麻花”),其中后3种带有黑色斑点或斑块,是研究动物黑色素合成机制的良好材料之一.克隆了瓯江彩鲤的MC1R基因,并进行了“全红”、“大花”、“粉玉”、“粉花”4种体色间的表达差异分析.研究发现,瓯江彩鲤的MC1R基因的全长cDNA序列为1 914 bp,包括637 bp 5’-UTR(非转录区)、311 bp3’-UTR及966 bp ORF(开放阅读框).该基因由一个外显子编码(321个氨基酸),有7个跨膜结构域.瓯江彩鲤与鲫的编码区核苷酸同源性达98％,与斑马鱼达93％;不同体色间的编码区只存在一个核苷酸无义突变(C/G),因而氨基酸序列完全相同.qRT-PCR表明,MC1R基因在眼睛的表达量显著高于皮肤、肌肉、鳃、肾脏、鳔、心、肝等组织(P＜0.05);但在4种体色间不存在显著的表达差异(P＞0.05).研究结果表明:瓯江彩鲤体色类型中的黑色斑块不是由MC1基因直接决定,还有待对其它体色相关基因或调控因子的研究.研究亮点:对在黑色素合成通路中起着类似“开关”作用的MC1R基因进行了克隆、序列分析和瓯江彩鲤体色间的表达差异分析,排除了MC1R基因与瓯江彩鲤黑色斑纹的直接相关性,为鱼类体色变异相关基因研究积累了有益资料.     

水培经济植物净化养殖废水研究现状

对水培经济植物净化养殖废水的研究现状进行了阐述,介绍了湿地植物特别是水生经济植物相关情况,并指出：水培经济植物食用安全性是关键问题;西洋菜是用于处理养殖废水等高浓度有机废水的良好湿地植物。     

溶藻弧菌生物被膜的特性与相关基因的研究

建立溶藻弧菌（gibrioaigino／yticus）的生物被膜（BF）体外形成模型,用银染法观察检测溶藻弧菌HY9901生物被膜的形成;同时研究温度和消毒剂对HY9901的游离（FC）细菌和具有生物被膜（BF）的细菌的影响。实验结果表明,溶藻弧菌HY9901株可以形成BF,而非致病株ZJ017不形成BF。HY9901株的BF细菌经85℃30min、-20℃80d、0．01％新洁尔灭处理后均有存活,而游离（FC）细菌则无存活细菌。根据已发表的哈氏弧菌Lux R基因核酸序列,设计并合成了一对引物,对溶藻弧菌HY9901株的基因组进行PCR扩增和测序分析,扩增出了520bp的核苷酸片段,该片段与已发表的哈氏弧菌Lux L基因的同源性达95％,而非致病性菌株ZJ017株则扩增不出该基因片段。     

连续流Biohydrogenbacterium R3sp. nov.菌株糖蜜废水发酵产氢能力分析

以从连续流搅拌槽式反应器(CSTR)内的活性污泥中分离出的高效厌氧产氢菌Biohydrogenbacterium R3 sp.nov.为发酵产氢微生物,糖蜜废水为发酵底物,试验分析了连续流发酵法R3菌株的产氢效能.结果表明:在温度36℃、水力停留时间6h、进水COD在2 600～4 440 mg/L范围内变化,CSTR...     

血根碱酊剂体外抗真菌初步研究

通过分析博落回(Macleaya cordata (wild)R.Br.)提取物—血根碱(制成血根碱酊剂)、总生物碱对须癣毛癣菌(Trichophyton mentagrophytes)、玫瑰色毛癣菌(Trichophyton rosaceum)、许兰黄癣菌(Trichophyton schoenleini)、红色毛癣...     

The Application of ISSR Markers to Identify the Fertility Restorer Gene Rf6 in T.timopheevii Cytoplasmic Male Sterile Wheat(Triticum aestivum)

Inter-simple sequence repeat (ISSR) analysis was carried out on a F2 population of 147 plants derived from a cross between a wheat male fertility restorer line 2114 and a male sterile line ND44A. Out of 43 primers examined, 18 primers produced distinguishable, polymorphic bands between the two parents. Linkage analysis in the mapping population showed that two markers UBC-808 and UBC-848 were closely linked with the restorer gene R f6 of the Triticum timopheevii CMS system. The distance between the two markers and the restorer gene was 7.9 cM and 4.9 cM, respectively. Also two parents were screened with 181 pairs of SSR primers, of which, 34.3% showed polymorphisms. But no locus was found linked with the restorer gene.Compared with the SSR technique, the ISSR approach used in the experiment provided more information and proved to be a valuable method to identify alien fragments.     

Water Extraction Process of Chinese Herbal Compound Man Gan Ning

[Objectives]To optimize the water extraction process of Chinese Herbal Compound Man Gan Ning and establish a method for its extraction and content determination...     

SRAP标记在五十份新疆人工栽培核桃种质资源的鉴定与应用

以新疆核桃主栽区收集的50份核桃种质资源为试材,采用序列相关扩增多态性(sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记技术分析其遗传多样性,以期为分布于新疆地区的核桃种质资源的保存、鉴定及综合开发利用提供参考依据。结果表明:从100对引物中筛选出16对扩增条带清晰、稳定性好的多态性SRAP引物组合,16对引物组合在50份供试种质中共扩增出178条带,多态性条带135条,多态位点百分率为75.84%。聚类分析及聚类锐度测试显示供试种质可分为10类,热图显示出不同引物对种质的区分情况,多元回归树显示不同引物中的26个扩增条带能够区分50份供试种质,其中M4/E4、M7/E5、M14/E4、M2/E11、M3/E4、M2/E4、M12/E13、M7/E1、M14/E13和M1/E3共10对引物组合是供试种质鉴定中重要的引物组合。同时R语言在统计分析中的应用,为今后核桃植物形态与遗传变异研究提供了新的数据分析方法。     

中国虎纹蛙与泰国虎纹蛙的遗传多样性比较

本文应用RAPD技术,研究了中国虎纹蛙(Rana tigrina rugulosa)和泰国虎纹蛙(R.tigrina cantor)的种内种间遗传多样性及种质特异性分子标记,结果表明:中国虎纹蛙和泰国虎纹蛙多态位点比例(P)分别为53.77%和70.79%;遗传多样性指数(H)分别为0.1345和0.1780;种间的遗传相似系数(S)为0.4238,遗传距离(D)为0.6613。两种虎纹蛙遗传多样性都较丰富,但中国虎纹蛙的遗传变异程度较泰国虎纹蛙低。在OPA、OPF、OPP、OPZ几个系列随机引物的扩增中得到了可用于鉴别两种蛙的12条特异性谱带。