南瓜DNA提取方法比较分析

DNA提取是基因克隆、PCR扩增、分子杂交以及遗传多态性分析等实验的基础。Whatman FTA卡已广泛应用于DNA的保存和提取,具有简便和高效的特点。采用煮沸法和FTA法分别提取南瓜(Cucurbita moschata Duch.)根、茎、叶DNA,以常规CTAB法为对照,以期寻找一种简便快捷的DNA提取方法。结果表明,CTAB法适用于南瓜各组织部位的DNA提取,DNA质量最高,PCR扩增的条带清晰,亮度高,但实验操作也最复杂;用煮沸法从叶片中提取的DNA质量相对较好,从根和茎提取的DNA不宜用于PCR反应,实验操作相对简单;FTA法提取的DNA质量较好,PCR扩增的条带清晰,亮度较高,实验操作最简单,是一种最佳的DNA简化提取方法。     

3种方法提取辣椒根总RNA的效果比较

针对辣椒根中富含多糖多酚的特点,比较了Trizol法、改良Trizol法和改良CTAB法3种方法对辣椒根总RNA提取的效果。结果表明,Trizol法、改良Trizol法能提取到辣椒根总RNA,但效果不理想;改良CTAB法提取到的辣椒根总RNA,28 S rRNA的亮度是18 S rRNA的2倍,OD260/OD280和OD260/OD230值分别为1.88和1.80,RNA质量浓度为254.0 mg·L-1;用提取到的RNA进行RT-PCR后可扩增出acting基因特异片段。因此改良CTAB法提取辣椒根总RNA的效果好、质量高、完整性好,能够满足后续试验要求。     

枫香ISSR-PCR反应体系的优化及引物筛选

为探索最适的枫香叶片DNA提取方法、最优ISSR引物和最佳ISSR-PCR扩增反应体系,本试验采用改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、十二烷基硫酸钠(SDS)法、高盐低pH法和试剂盒法提取枫香叶片DNA;采用三因素五水平(DNA模板用量,2×Taq Master Mix用量引物浓度)正交试验构建并优化枫香的ISSR-PCR反应体系;对100条ISSR引物进行筛选及其退火温度优化。结果表明：改良CTAB方法提取的DNA浓度高,且电泳条带清晰无污染;SDS和试剂盒方法提取DNA的浓度低,电泳条带亮度低;高盐低pH值法提取的DNA的电泳条带模糊且降解拖尾现象严重。DNA模板浓度为20 ng、Taq Master Mix用量为10μL、引物浓度为0.6μmol/L、ddH₂O为7.8μL时扩增程序的条带最清晰、多态性最好。筛选出17条重复性强、条带清晰明亮、多态性高的ISSR引物及其最适退火温度,其中扩增位点数最多的为引物UBC-834、UBC-836和UBC-853,扩增位点均为13个,以UBC-878为ISSR引物时的扩增反应中,当退火温度在46.9℃的时候能够扩...     

甘薯薯块DNA提取方法研究

甘薯薯块富含淀粉、酚类等物质,不利于DNA提取。为了研究甘薯薯块DNA提取的最佳方法,采用经典CTAB法、改良CTAB法一、改良CTAB法二和SDS提取法,对甘薯薯块总DNA提取效果进行比较,以试剂盒法提取结果作对照。结果表明:采用经典CTAB提取法和SDS提取法获得的薯块DNA含有较多杂质,且降解严重,样品质量低;CTAB改良法一能降低DNA样品中多糖等物质的含量,但DNA存在一定程度降解,且耗时较长;CTAB改良法二提取效果最佳,杂质含量低且DNA降解少,与试剂盒提取效果最接近,是一种较为理想的甘薯薯块DNA提取方法。     

堆肥和枯草芽孢杆菌协同调控黄瓜幼苗生长的机制探究

土壤生物学障碍是制约中国设施蔬菜生产可持续发展的主要瓶颈之一,而土壤病原菌是引起土壤生物学障碍的重要因素之一。笔者以土壤生物学障碍问题突出的黄瓜为研究对象,探究了堆肥和枯草芽孢杆菌对黄瓜枯萎病病原菌及植株生长的影响。结果表明：堆肥中的微生物和枯草芽孢杆菌均可显著降低病原菌对黄瓜生长的抑制作用,且二者具有协同效应;堆肥微生物主要影响黄瓜幼苗一级侧根（直径0.3~0.9 mm）的绝对长度和二级侧根（直径0~0.3 mm）的相对量,而枯草芽孢杆菌接种主要影响了黄瓜幼苗一级侧根的绝对长度。综合分析认为,堆肥主要通过其微生物与枯草芽孢杆菌协同抵御黄瓜病原菌,并促进根系生长。     

几种常见方法提取番荔枝基因组DNA的比较

以番荔枝幼嫩叶片为材料,分别采用改良高盐低pH值法、改良的CTAB法、SDS法三种方法提取总DNA,通过紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳法对三种提取方法进行综合比较。结果显示改良的CTAB法所得的DNA纯度和得率较高,SDS法最差。     

一种改良的CTAB法提取马尾松基因组DNA

以马尾松针叶为试验材料,利用改良的CTAB法抽提基因组DNA,其浓度和纯度符合PCR实验的要求,经凝胶电泳检测,DNA纯化效果好。     

适合AFLP分析用的节瓜基因组DNA提取方法的研究

本研究以CTAB法为基础,采用以下5种处理提取节瓜叶片基因组DNA:A、PVPP(3%)+抗坏血酸(100 mmol/L);B、β-巯基乙醇(3%)+抗坏血酸(100 mmol/L):C、PVPP(3%)+半胱氨酸(5%);D、PVPP(3%)+β-巯基乙醇(3%);E、抗坏血酸(100 mmol/L)+半胱氨酸(5%).实验结果表明:在5种处理中,C处理提取的DNA质量最高,其溶液呈无色透明状,经核酸蛋白仪测定其OD260/OD280为1.8～2.0;经0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,节瓜叶片基因组DNA带型清晰、完整、无降解,蛋白、多糖、酚类及RNA等去除比较彻底;经AFLP分析,酶切彻底,PCR扩增后的带型清晰稳定,重复性好,说明C处理提取的节瓜基因组DNA完全满足AFLP分析的要求.     

基于改进CTAB法提取空间诱变柱花草总DNA研究

[目的]用改进CTAB法提取空间诱变柱花草的总DNA。[方法]以柱花草幼苗叶片为材料,采用改良CTAB法提取柱花草总DNA。[结果]所提的DNA凝胶条带清晰,无拖尾现象,浓度在406．6～857．3ng／μl,0D260／DD230检测值在1．96—2．18,OD260／0D280检测值在1．76—1．98。所提DNA适用于ISSR-PCR。[结论]该方法具有简便、快速、高效的特点。     

一种无需DEPC提取高质量棉花总RNA的方法

DEPC做为RNAnase抑制剂常用于RNA的提取,但其本身具有毒性,容易对操作者产生伤害并易造成环境污染。该实验以改良CTAB法为基础,提高β-巯基乙醇的浓度到10%,无需DEPC就能提取高质量的RNA。分别以不同陆地棉为材料提取了棉花的总RNA,测得OD260/OD280在1.7~2.1之间,且大部分样品都能清晰看到3条RNA条带,将此RNA反转录获得的cDNA为模板克隆到了棉花ATP合成酶β亚基基因,说明此方法提取的棉花总RNA既能满足分子生物学实验要求又大大地减少了毒害作用。