Modelling bird distributions — a combined GIS and bayesian rule-based approach

Models to predict the breeding distribution of three species of birds in north-east England are described. The models use readily available data from the ornithological literature on the habitat preferences and life-history characteristics of the birds, together with satellite (land cover) and physiographic data. These data are linked via Bayesian decision-rules, and model predictions calculated at the landscape scale using a raster-based geographic Information System. Log-linear regressions of the predicted suitability of the landscape for the birds with observed sets of nest records were statistically significant for all three species. The robustness of the models to the effects of nonindependence of predictor (habitat) variables on Bayesian predictions was investigated using a perturbation method, which gave minor improvements to the accuracy of the predictions. The value of this modelling approach as a method of utilising published autoecological data to predict the landscape distribution of birds is discussed.     

基于电子舌系统的鸡蛋新鲜度检测

鸡蛋是营养丰富的食品,也是极易腐败的食品。鸡蛋在储藏过程中,环境温度的不同会导致其新鲜度出现较大的差异;蛋清和蛋黄在风味物质含量上有较明显的差异,其新鲜度变化也应展现出不同的模式。本研究利用实验室自主研发的电子舌系统对不同存储时间和存储条件下的鸡蛋进行检测与分析,讨论了鸡蛋在不同贮藏环境下新鲜度的变化差异,并将蛋黄与蛋清的分析结果进行对比,利用贝叶斯判别分析的方法为鸡蛋新鲜度的质量评价提供依据。结果表明:电子舌系统能够较好地反应出鸡蛋新鲜度随时间的变化情况,而且鸡蛋在常温环境下的新鲜度变化较为显著。     

基于Bayes方法的东海小黄鱼资源评析

利用东海区渔业资源动态监测资料、采用基于Bayes方法的Pella-Tomlinson模型对东海区小黄鱼(Pseudosciaenapolyactis)渔业资源动态进行了科学评析,同时,在不同渔业政策选择下,对2004-2020年的资源量与渔获量进行了预测模拟研究。研究结果显示:东海区小黄鱼渔业资源的环境容纳量K为394 514 t;内禀增长率r为1.146;1991年的资源生物量为338 493 t、尔后持续上升到1994年的370 923 t。1994年以后又持续下降,到2003年下降到最低值111 253 t;最大持续产量(Maximum sustainable yield,MSY)为107 806 t左右;支持MSY所需的渔业资源生物量为197 503 t;支持MSY所需的捕捞努力量为441 097 6网次;当前资源量与环境容纳量K的比值为0.282,即当前资源量已不足原始资源量的30%;若2004年以后使用0.4的捕捞死亡系数,该渔业资源可以实现持续最优利用。     

基于朴素贝叶斯算法的水产类专利文本分类

本文选取公开日从1992年1月1日到2011年12月31日的水产类的9 894条失效专利作为数据挖掘的文本。从中选出56条专利,利用分词器对其摘要进行分词,并通过卡方检验的方法过滤掉与分类相关度比较小的词,形成词组矩阵。然后采用朴素贝叶斯的方法对这些矩阵进行训练并设计程序。使用训练过后的程序对失效专利进行分类测试,合格后再对所有的专利的摘要文本进行分类,并对分类结果进行了分析和验证。验证的结果表明该程序对文本进行分类的准确率达到了85%,达到了比较好的可信度,可以用它对文本分类。如此我们就可以把失效的水产类专利文本按照设定的类别进行归类,了解一个时间段它们的分布情况,为以后做决策提供参考。     

皖鄂地区水稻纹枯病菌致病力分化研究

采用温室苗期接种鉴定法,以抗感反应不同的5个水稻品种为材料,对从安徽省和湖北省采集的水稻纹枯病感病标样上分离的200个菌株进行了致病性鉴定。结果表明,水稻纹枯病菌不同菌株间致病力存在明显差异,在鉴别品种上的病情指数呈正态分布。基于5个鉴别品种的平均病情指数的动态聚类分析,将200个菌株划分为弱、中、强3种致病型,分别占供试菌株的29.5%、60.5%和10.0%,其中中等致病型菌株占优势。各致病型在地区间呈随机分布,表明自然条件下水稻纹枯病菌为混合致病群。Mantel测验表明,菌株致病力差异与菌株地域来源无明显相关。采用Bayes法建立了各致病型的判别函数,判别准确率达95.00%,说明采用聚类判别分析能够对水稻纹枯病菌致病力的分化进行合理的判断。     

Understanding the use of Bayes factor for testing candidate genes

After quantitative trait loci (QTL) detection, one of the main objectives of research is to identify the causal mutation explaining phenotypic differences. Candidate genes are usually selected according to the physiological mechanism of the trait and their location within the same region of the QTL. After detection of any polymorphism at the candidate gene sequence, it is important to determine whether the detected mutation is the one that causes the phenotypic variation. This is not, however, an easy task, because of the linkage disequilibrium between the genes located in the same region. Several methods have been proposed that consider the neutral marker information in validating the involvement of candidate genes. However, some statistical information may be lost because of the presence of both the QTL and candidate gene effects in the model of analysis. Here, the Bayes factor is suggested as an alternative and a procedure for its calculation between candidate gene and QTL models is presented. The procedure is illustrated with a simulation study and with an example consisting of three SNPs detected at the leptin receptor (LEPR) in an experimental intercross between Iberian and Landrace pigs. The results indicate that the Bayes factor procedure is more powerful than the classical approach.     

基于Bayes判别理论的地下水化学分类的分析方法

将Bayes判别分析方法应用于地下水化学类型判别与分类中,建立了地下水化学类型综合评判的Bayes判别分析模型。模型选用Na++K+、Ca2+、Mg2+、HCO-3、Cl-、SO42-等6个指标作为判别因子;将地下水化学类型分为3种,作为Bayes判别分析的3个正态总体;以内蒙古河套灌区地下水实测数据作为训练样本,建立Bayes线性判别函数;以Bayes线性判别函数计算待判样品的Bayes判别函数值,以最大值对应的总体作为样品所归属的总体;最后以刀切法对判别准则进行评价以检验模型的优良性。结果表明,Bayes判别分析模型误判率低,识别正确率达82.5%,输出结果正确率达86.6%。与传统分类方法相比,Bayes判别分析模型提供的判别分类结果,具有更明晰、易懂的水化学类型信息。     

基于朴素贝叶斯的渔业文本分类器研究

通过阐述朴素贝叶斯文本分类器的算法原理及其用于建立渔业文本分类器的优点,给出了基于朴素贝叶斯的渔业文本分类器的基本结构,并用实验验证了该结构的性能。结果表明,基于渔业词库的朴素贝叶斯渔业文本分类器具有比普通文本分类器更好的性能。     

两级套随机效应模型中方差分量的Bayes估计

在加权平方损失下导出了两级套分类随机效应模型中方差分量的Bayes估计,并利用多元密度及其偏导数的核估计方法构造出了方差分量的经验Bayes(EB)估计。     

基于统计的遥感图像分类方法

对遥感图像分类是遥感图像信息获取的重要手段。统计分类方法在遥感图像分类中运用得很普遍,同时统计分类方法还是各种新兴分类方法的基础。文章主要研究了各种统计分类方法在遥感图像分类中的应用,在此基础上运用核密度估计Bayes分类方法、BP神经网络分类法进行分类,并与传统的统计分类方法进行比较。