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101.
Virus recovery and full-length sequence analysis of atypical bovine pestivirus Th/04_KhonKaen 总被引:1,自引:0,他引:1
Phylogenetic analysis of recently identified “atypical” bovine pestiviruses, performed based on different gene regions, has revealed unclear relationships with other established species, therefore, their phylogenetic position could not be determined so far. In this study, the atypical pestivirus Th/04_KhonKaen was recovered from serum of a naturally infected calf and the complete genome sequence was determined and analysed, as means to define its position. The viral genome is 12,337 nucleotides (nt) long, and comprises a 5′-UTR of 383 nt, a 3′-UTR of 254 nt and an open reading frame of 11,700 nt, without duplication of viral sequences or insertions of cellular sequences. The phylogenetic analyses of the full-length sequence, performed by Neighbor-joining, Maximum likelihood, and the Bayesian approach, unanimously placed Th/04_KhonKaen in a single lineage, distinct from the established pestivirus species, and close to bovine viral diarrhea virus types 1 and 2. Furthermore, Th/04_KhonKaen and two previously reported atypical pestiviruses D32/00_‘HoBi’ and CH-KaHo/cont formed a well-supported monophyletic clade in trees based on the complete Npro and E2 gene regions. The finding provides conclusive classification of the Th/04_KhonKaen virus and confirms the standing of the “atypical” bovine pestiviruses as a novel pestivirus species. 相似文献
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牛病毒性腹泻病毒一步法RT-PCR检测方法的建立与应用 总被引:1,自引:1,他引:1
为建立一种快速检测牛病毒性腹泻病毒病原的方法,本研究根据GenBank上登录的牛病毒性腹泻病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)基因组序列,设计1对引物,建立了检测BVDV的一步法RT-PCR方法。该方法对牛传染性鼻气管炎病毒、猪瘟病毒、牛副流感病毒3型的扩增结果均为阴性,检测的敏感性达1 ng RNA。该一步法RT-PCR方法具有良好的特异性、敏感性、重复性,可以准确快速检测出极低含量的BVDV,将为BVDV的病原检测及分子流行病学调查等提供一种快速、灵敏、特异、准确的分子生物学检测方法。 相似文献
107.
检测猪源牛病毒性腹泻病毒荧光RT-PCR方法的建立与监测分析 总被引:1,自引:0,他引:1
根据牛病毒性腹泻病毒(BVDV)5′-UTR保守序列建立的特异性荧光RT-PCR,对采自福州市周边屠宰场的359份屠宰猪血清进行BVDV感染的病原学检测。结果待检的359份血清样品BVDV阳性52份,阳性率为14.5%(52/359)。对其中13份BVDV阳性样品5′端UTR片段进行序列测定分析,发现所测13份BVDV阳性样品5′端UTR片段均与VEDEVAC进化谱系较为密切,均为基因Ⅰ型。以上结果表明以牛源BVDV建立的特异性荧光RT-PCR方法适用于猪源BVDV感染的监测,并揭示福州市屠宰猪存在BVDV感染。 相似文献
108.
根据GenBank上已发表的猪瘟病毒(CSFV)和牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的全基因序列,进行对比分析,分别设计合成两对能特异性扩增CSFV、BVDV的引物。经过条件优化后,建立了检测CSFV和BVDV的双重RT-PCR方法,扩增两种病毒的片段,大小分别为938、650 bp。应用该方法对11批牛睾丸细胞、7批胎牛血清、60个批次的猪瘟细胞苗、10份全血样及10份组织样进行检测。通过试验证明,所建立的方法具有良好的特异性和敏感性,为防止猪瘟细胞苗的污染及进行CSFV和BVDV鉴别诊断提供了有效方法。 相似文献
109.
牛病毒性腹泻—粘膜病病毒(BVDV)的分子生物学研究进展 总被引:5,自引:0,他引:5
牛病毒性腹泻—粘膜病病毒(Bovine viral diarrhea—mucosal disease virus,BVDV)是引起牛病毒性腹泻—粘膜病的病原,欧美牛体中普遍存在轻性或隐性感染,与猪瘟病毒(HCV)、羊边界病病毒(BDV)具有1种共同抗原,有交叉反应,牛体中的抗体检出率高。本文通过对BVDV的分子生物学的概述,总结BVDV最新的分子生物学研究进展,为进一步预防和控制BVDV提供理论依据。 相似文献
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