波尔山羊和江苏本地山羊的AFLP和RAPD分析

 实验山羊共 10 5只 ,其中波尔山羊 6 0只 (公母羊各半 ,采血样 2 0个 ,组织样 4 0个 ) ,徐淮山羊 30只 (公母羊各半 ,每羊采血样 1个 ) ,海门山羊 15只 (公羊 7只 ,母羊 8只 ,每羊采血样 1个 )。分别提取DNA ,按品种构建DNA池。应用 36个选择性引物组合对波尔山羊、徐淮山羊和海门山羊品种间AFLP多样性进行研究 ,其中 2 9个引物组合共扩增出 32 5 3个标记 ,包括多态标记 92个 ,平均每个引物组合扩增 3.17个多态标记 ,多态频率达2 .8%。多态标记数较多的引物组合为 :E0 0 +ACG/M 0 0 +CAA(13个 )、E0 0 +ACG/M0 0 +CAG(10个 )、E0 0 +AAC/M0 0 +CAC(8个 )和E0 0 +AAC/M0 0 +ACT(7个 )。从 93个随机引物中筛选出品种间多态性较强、重复性好的引物 2 2个 ,对 3个品种池DNA进行RAPD扩增 ,共扩增出 183个标记 ,其中多态标记 6 0个 ,平均每个引物扩增2 .73个多态标记 ,多态频率为 32 .8%。两种方法得到一致结果 ,即徐淮山羊与海门山羊遗传距离最近 ,徐淮山羊与波尔山羊次之 ,海门山羊与波尔山羊遗传距离最远。按UPGMA法将海门山羊与徐淮山羊聚为一类 ,其次为波尔山羊。两种方法均能较好地反映 3个山羊品种的遗传差异 ,但AFLP方法多态标记数更多。     

Multiple Interval Mapping for Whole Cocoon Weight and Related Economically Important Traits QTL in Silkworm （Bombyx mort）

A backcrossed population （BC1） derived from a cross between C100 and Dazao was obtained. The quantitative trait loci （QTLs） of the economically important traits for whole cocoon weight, cocoon shell weight, ratio of cocoon shell and weight of pupae, etc., were analyzed for the first time using the multiple interval mapping software WinQTLCart2.0. In total 40 QTLs were detected and contributed to 21 groups based on the constructed linkage map. According to the mapping results, 2, 2, 3, and 2 major QTLs explained over 20% of total phenotypic variations, whereas four QTLs, namely qCW-19, qSW-2, qCSR-4, and qPW-23, explained more than 30% of total phenotypic variations for whole cocoon weight, cocoon shell weight, ratio of cocoon shell and weight of pupae, respectively. Correlated traits QTLs often share the same location. Furthermore, most of the detected QTLs were closed to one-side marker. By using the very closed markers, positive QTLs can be aggregated, which can form a basis for molecular marker-assisted selection and breeding.     

小麦新种质YW243抗条锈病新基因的AFLP标记

小麦新种质YW243抗条锈病新基因对条锈菌具有较宽抗谱,对26个不同毒性谱的条锈菌 菌系免疫到近免疫,与已知基因系抗病谱不同,可能为新的基因或基因组合。遗传分析表明,YW243 对条锈菌条中31号小种的抗性由显性单基因YrX控制。通过BSA法对1056对MseI/EcoRI AFLP引 物进行筛选,结果表明7对引物可扩增出多态性片段,通过对F2群体单株遗传连锁分析和作图软件 分析,结果表明,2个AFLP标记M54E63-700、M54E64-699与YrX连锁较紧密、遗传距离为9．27 cM,为该基因的精细作图和分子标记辅助育种打下了一定基础。     

分子标记技术在花生上的应用研究

主要介绍了RFLP、RAPD、SSR、AFLP等四种分子标记技术的原理、方法、特点及其在花生上的应用现状:①RAPD、SSR、AFLP都可以分析花生品种的多样性;②RAPD技术可以对杂交后代进行鉴定;③利用RFLP、RAPD技术绘制花生指纹图谱;④利用分子标记技术研究花生根瘤菌;⑤基于花生的RFLP、RAPD技术的改进。同时,展望了分子标记技术在花生上的应用前景,以期对花生的分子标记育种有所帮助。     

花生AFLP-银染体系的建立与优化

通过对影响花生AFLP-银染技术体系的关键因素作对比研究,建立了一套优化的花生AFLP分子标记体系,该体系在应用于花生AFLP研究时,能够得到清晰的分子标记图谱,实验结果重复性好,稳定可靠.优化的关键因素为①采用细玻璃棒勾取DNA,而非离心的方法,可得到高纯度大分子量的DNA样品;②酶切DNA模板为300rng③酶切体系中,EcoRI和MseI分别加入4U,使用NEBbuffer 2;④连接最适温度为16℃过夜⑤预扩时PCR循环预变性时间为1min;⑥预扩产物最佳稀释倍数为75倍.     

蒙古冰草与航道冰草正、反交F_1及其染色体加倍植株AFLP分析

利用AFLP分子标记技术,对蒙古冰草与航道冰草正、反交F_1及其染色体加倍植株的DNA多态性位点进行了比较分析.结果表明:用筛选出的11对适宜引物对供试材料进行AFLP扩增,共获得430条清晰的条带,其中多态性带396个,多态性比率高达92.1%;供试材料的遗传距离变幅为0.6594～0.8182,蒙古冰草与航道冰草遗传距离较远;以遗传距离0.72为基准可划分为3类,即亲本蒙古冰草与正反交杂种F1为一类、正反交杂种F1染色体加倍植株为一类、亲本航道冰草为一类.     

47个亚、欧、美洲野生、地方和培育猪群的AFLP多态性及群体遗传关系研究

采用双色荧光标记技术,检测21个中国地方猪类群、19个欧美商业猪类群、5个亚欧美野猪类群、1个中国培育猪种、1个杜洛克×中国野猪杂种群体总共47个类群基因组DNA池的AFLP多态性,22种引物组合产生312个AFLP多态标记。根据多态标记信息,计算47个类群间的遗传相似系数,并构建UPMGA聚类关系图。结果表明,中国地方猪、中国野猪与欧美商业猪群、欧美野猪间存在明显的遗传分化,提示中国地方猪起源于亚洲野猪,而欧美商业猪种由欧美野猪驯化而来。杜洛克猪、长白猪和大白猪不同类群间的遗传相似性较高,但也存在一定的遗传分化。南昌白猪与大白猪、PIC L95系与太湖猪有着很近的亲缘关系,真实反映了其育成历史。嘉兴黑猪与梅山猪、冠朝猪、藤田花猪、上犹花猪和万安花猪等地方猪群遗传关系的研究结果与其形态学、地理分布和现行分类情况相一致,认为AFLP技术是遗传多样性和群体遗传学研究的一项有效的技术手段。     

湖南现行家蚕品种AFLP指纹图谱的构建

利用AFLP分子标记技术,对湖南省现行使用的6对家蚕品种（正反交）进行分析,从36对引物中筛选出带型多、分布均匀、清晰可辨且多态性高的引物5对,并构建了其DNA指纹图谱,扩增出各个品种的特异带。通过分析表明：6对家蚕品种的多态性比率达19．52％,在遗传相似系数和UPGMA聚类上的分析与在形态学上的分析相一致。利用此图谱可以对各个家蚕品种进行快速准确的鉴定,且为家蚕品种选育奠定了理论基础。     

A genetic linkage map of the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus

We report the first genetic linkage map of the Japanese flounder (Paralichthys olivaceus) constructed with 111 microsatellite markers and 352 AFLP fragments. The parental male linkage map consisted of 25 linkage groups while the female map consisted of 27 groups, with an average resolution of 8 and 6.6 cM, respectively. We have identified linkage among 96% of the markers and the total map length was estimated to be around 1000–1200 cM. This study reports the first low-density linkage map for the Japanese flounder and describes differences in sex recombination. Recombination rates were higher in male flounder compared to the female (7.4:1), a rare condition among vertebrates. This map is a starting point for the mapping of single loci and quantitative traits in flatfish species.