广西巴马小型猪近交群体的遗传结构分析

本研究以33头广西巴马小型猪为研究对象,利用19个微卫星标记,通过估算其等位基因数(N)、多态信息含量(PIC )和近交系数(F)等参数,对广西巴马小型猪近交群F10~F15世代进行了遗传学检测。试验结果显示,19个微卫星座位上共检测到31个等位基因,其中F10~F15分别具有27、29、28、27、26和25个等位基因,平均每个位点分别仅有1.42、1.53、1.47、1.42、1.37和1.32个等位基因;6个世代群体平均多态信息含量为0.1044。广西巴马小型猪F10~F15世代的平均近交系数分别为0.8070、0.8263、0.8491、0.8710、0.8904、0.9118。结果表明,广西巴马小型猪近交群体的基因多态性低、近交程度高,是一个遗传性稳定的群体。     

版纳微型猪近交系白细胞介素6基因克隆、生物信息学及组织表达分析

白细胞介素6(IL-6)是机体重要的免疫调节因子,在佐剂的应用方面具有很好的发展前景。本研究以版纳微型猪近交系(BMI)为实验动物,通过PCR法获得IL-6基因编码区序列,提交GenBank数据库,登录号为JQ839263。对BMI IL-6基因和相应的蛋白序列进行了生物信息学分析,结果显示该基因编码212个氨基酸,分子质量为23.88 ku,等电点(pI)为6.66,存在一个保守结构域,一个跨膜结构,N端和C端均疏水,且在N端存在信号肽,有89%的可能性定位于细胞核。将BMI的IL-6基因编码区序列与NCBI下载到的4条猪IL-6基因序列进行比对,结果显示BMI IL-6与GenBank登录号为NM_214399和DQ832259的核苷酸序列完全相同,与GenBank登录号为AF309651和AF518322的核苷酸序列各存在1处碱基差异;多物种氨基酸序列比对及系统进化分析结果表明,BMI与骆驼亲缘关系最近。同时利用半定量PCR法确定了IL-6基因mRNA在BMI 12个组织中的表达量,结果发现在肺脏、皮肤、肌肉中表达量较高。本研究为进一步研究猪IL-6基因的表达调控奠定了理论基础。     

版纳微型猪近交系RNF4基因克隆、多组织qPCR表达及功能生物信息学分析

RNF4基因调节精细胞分化和增殖过程,文章以Gen Bank下载的猪及近缘物种RNF4 mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增版纳微型猪近交系(BMI)RNF4基因。应用qPCR分析15个重要组织mRNA表达谱,并对蛋白质序列作功能生物信息学分析,构建多物种系统进化树。研究获得BMI RNF4 573 bp编码区序列(Gen Bank登录号:KU705638,对应氨基酸登录号:AOC89056),编码190个氨基酸,蛋白质分子质量(Mw)为21.43 ku,等电点(pI)为6.95。多组织荧光定量表达分析表明RNF4基因在尿道球腺、睾丸、肝、肺中高水平表达;在其他11个组织中呈中低水平表达。功能生物信息学分析表明RNF4蛋白质存在1个保守结构域,无跨膜结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端疏水;有4类功能活性位点,位于细胞核概率为94.1%。系统进化分析表明,BMI与狗亲缘关系最近。结果为研究RNF4基因在猪精细胞分化和增殖方面作用奠定基础。     

版纳微型猪近交系AO血型基因外显子7 和外显子8遗传特征分析

猪的UDP-N-乙酰半乳糖胺转移酶(UDP-N-acetylgalactosamine transferase,UDP-Gal NAc)是负责转移一分子的N-乙酰-D-半乳糖胺基(NAc Ga1)到H底物上形成A抗原,从而决定A型血的转移酶,AO血型系统的A基因编码A转移酶。采用PCR技术和直接测序的方法对版纳微型猪近交系UDP-Gal NAc基因外显子7和外显子8进行多态性分析,均仅检测到1种基因型。通过序列比较发现,版纳微型猪近交系UDP-Gal NAc基因外显子7和外显子8与NCBI数据库中14个其他物种的ABO血型基因存在较高的同源性。与人相比,猪外显子7第92~97位缺失编码两个氨基酸的6个碱基。构建的基因进化树分析结果显示版纳微型猪近交系与牛、羊、鲸亲缘关系最近。     

版纳微型猪近交系TSARG7基因克隆及功能生物信息学分析

为获得版纳微型猪近交系（Banna Mini-pig inbred line,BMI）TSATG7基因序列并分析组织表达情况,本研究以GenBank中猪及近缘物种的TSARG7基因mRNA序列为参考序列,设计特异引物扩增BMI TSARG7基因,半定量分析10个重要组织的表达谱,并对蛋白质序列进行功能生物信息学分析。结果显示,获得了BMI TSARG7基因1 371 bp的编码区序列（GenBank登录号：KU950831,对应的氨基酸登录号：AMY60405）,编码456个氨基酸,蛋白质分子质量为52.05 ku,等电点（pI）为9.28。多组织表达分析表明,TSARG7基因在睾丸中高表达,在其他组织中呈中、低表达。功能生物信息学分析表明,TSARG7蛋白质存在1个保守结构域,有3个跨膜螺旋结构,无信号肽序列;N末端疏水,C末端亲水;有5类功能活性位点,位于细胞质的概率是94.1%。本试验结果为进一步研究TSARG7基因在猪精子发生和性成熟方面的作用及功能奠定基础。     

微卫星DNA标记技术及其在猪近交系遗传检测中的应用前景

首先对家畜核基因组中DNA微卫星标记作了简要的介绍 ,包括微卫星标记的定义、结构、分布、组成、保守性、优点及丰富的多态性等。其次主要介绍微卫星DNA标记技术在猪近交系遗传检测方面的应用。微卫星标记出现以前 ,只能通过公式来简单的计算近交系数 ,现在通过微卫星标记技术结合PCR(聚合酶链式反应 )技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,可以计算出近交系猪的等位基因频率 ,进一步得到它的多态信息含量。从而可以从分子水平上真正验证近交系猪的基因纯合度及同基因性 ,在转基因研究、异体器官移植和其实验动物化等方面奠定了坚实的遗传学基础     

SPF级近交系BALB/c小鼠的体重、体长、尾长和脏器系数的测定

本中心于2002年从国家啮齿类种子中心上海分中心引进5公5母近交系BALB/c小鼠进行饲养繁殖,目前本中心已经建立起核心群、血缘扩大群和生产群,至今已达到F5代,已经取得广东省实验动物微生物监测所颁发的SPF级微生物检测合格证(合格证号2005A 013)。为了了解近交系BALB/c小鼠幼龄期3周龄、性成熟期6周龄、体成熟期9周龄和老年期72周龄等不同阶段雌雄小鼠的体重、身长、尾长、脏器重量和脏器系数的情况。我们分别对生产群小鼠不同阶段雌雄小鼠的体重、身长、尾长、脏器重量进行测量,为科研工作者提供基础数据。1材料与方法1.1动物核心群…     

版纳微型猪近交系用于镇痛类经皮吸收药物体外渗透性评价

【目的】通过比较版纳微型猪近交系皮肤(以下简称“猪皮肤”)和人皮肤的组织形态学以及镇痛类经皮吸收药物的体外渗透试验,验证猪皮肤在镇痛类经皮吸收药物评价方面的应用价值。【方法】通过HE染色、Masson染色、弹力纤维染色和透射电镜观察比较2种皮肤组织结构形态;选择水杨酸溶液、双氯酚酸二乙胺乳膏和利多卡因凝胶贴膏3种药物作为模型药物,通过Franz扩散池进行药物渗透试验,采用酶标仪和高效液相色谱仪检测透过皮肤的药物质量浓度。【结果】HE染色、Masson染色以及透射电镜结果显示：猪皮肤与人皮肤的分层和细胞构成相似,但是猪皮肤的表皮层极显著厚于人皮肤表皮层(P<0.01),人皮肤的真皮层极显著厚于猪皮肤真皮层(P<0.01)。版纳微型猪身体各部位皮肤从厚到薄依次是肩胛、臀部、背部和腹部。3种药物渗透的0～24 h内,大部分时间点3种药物透过猪皮肤和人皮肤的药物质量浓度均无显著差异(P>0.05)。【结论】猪皮肤和人皮肤组织结构相似,3种镇痛药物在2种皮肤中的渗透性相似,猪皮肤可用于镇痛类经皮吸收药物的体外渗透性评估。     

室内饲养的蠋蝽种群近交衰退分析

蠋蝽是一种优良的天敌昆虫,可以捕食40余种鳞翅目、鞘翅目、膜翅目害虫。目前蠋蝽的规模扩繁大都采用室内饲养方法,因而种群出现了不可避免的近交衰退现象。本研究立足于分析近交繁殖对蠋蝽种群的影响,测定近交繁殖状态下,蠋蝽种群的一系列生命特征,为蠋蝽的规模扩繁提供依据。在室内饲养条件下,连续饲养6代蠋蝽种群,比较近交第6代种群和杂交种群在卵孵化率、各虫态发育历期、重量和性比等方面的差异。近交繁殖第6代种群与杂交种群相比,卵孵化率具有极显著差异,近交种群卵孵化率（43.66%）比杂交种群（66.28%）低22.62%。孵化历期比杂交种群的延长1.7 d。在各龄期历期比较中发现,近交种群的1、2、4和5龄若虫发育历期比杂交种群分别缩短0.29、0.03、0.08和0.51 d,而3龄则延长0.20 d,近交种群若虫发育历期（25.64 d）比杂交种群（26.34 d）短0.70 d。杂交种群各个虫态重量均比近交种群略有增加。在性比方面,近交种群会表现出显著的偏雄性。综上,近交繁殖第6代与杂交繁殖相比,在孵化率与成虫获得率方面显著下降,而在发育历期与各虫态重量方面并无显著差异。因此,在蠋蝽的室内繁殖过程中,应隔一段时间,采集远源虫源进行种群复壮,避免虫源衰退。