茶树染色体组型分析

采用去壁、低渗、火焰干燥制样法分析了18个茶树品种的染色体组型,结果表明:茶树染色体以 X=15为基数,一般为二倍体,但也有非整倍体和多倍体细胞。不同品种、同一品种不同细胞的染色体组型不尽相同,其主要核型为2n=2x=30=18m+6sm+2sm~(sat)+4st~(sat)和2n=2x=30=18m+6sm+4sm~(sat)+2st~(sat)。根据组型分析结果,认为茶树起源于我国的西南地区,其品种间具有相近的亲缘关系,乔木型、大叶品种核型的对称性较高,是进化上较原始的品种。     

四川盆地北部须家河组裂缝发育特征与控制因素——以广元和旺苍地区地表露头为例

对四川盆地北部广元和旺苍地区典型露头区须家河组(T3x)裂缝进行了系统观察和测量,该地区普遍发育构造剪切缝,包括高角度剪切缝、斜交缝和低角度剪切缝共3种类型。裂缝多与层面呈高角度相交,工农镇地区裂缝优势走向为近EW向、NW向和近SN向,离妻岩地区裂缝优势走向为近EW向。控制广元和旺苍地区T3x露头区裂缝发育程度主要因素有岩性、层厚及岩性组合。细砂岩和粉砂岩中裂缝密度最高,粗砂岩和砾岩中裂缝密度较低;裂缝密度与力学层厚度之间呈幂函数关系,随着岩层层厚增加,裂缝密度逐渐降低,厚层中裂缝发育程度较差;不同岩性组合中,砂泥岩互层、泥岩层中的薄-中层砾岩段裂缝较发育。     

松辽黑猪染色体组型及显带的研究

采用外周血淋巴细胞培养方法以及C-显带和G-显带技术,对松辽黑猪进行了染色体组型分析及显带研究,并分析了各号染色体的相对长度、着丝点指数及臂比。结果表明,松辽黑猪的染色体数目为2n=38,公猪为3:8,XY;母猪为3:8,XX。松辽黑猪的C-带具有多态性,G-带带型与其他家猪相比没有明显差异。     

稻草替代部分全株玉米青贮对奶牛瘤胃菌群结构的影响及差异表达基因功能分析

本试验旨在研究稻草替代全株玉米青贮对奶牛瘤胃菌群组成、差异表达基因、代谢通路和碳水化合物活性酶的影响。试验选取8头健康、体重接近的泌乳后期中国荷斯坦奶牛,随机分为CS组（粗饲料由苜蓿、苜蓿青贮与全株玉米青贮组成）和RS组（由稻草替代CS组粗饲料中1/3的全株玉米青贮,其他成分不变）,每组4个重复,每个重复1头牛。预试期14 d,正试期7 d。结果显示：1）在门水平上,CS组瘤胃广古菌门（Euryarchaeota）的相对丰度显著低于RS组（P<0.05）。在属水平上,CS组瘤胃球菌属（Ruminococcus）、甲烷短杆菌属（Methanobrevibacter）、丝状杆菌属（Fibrobacter）的相对丰度显著低于RS组（P<0.05）。2）在2组奶牛瘤胃液中共筛选到6 638个差异表达基因,其中2 777个上调表达,3 861个下调表达;通过GO分析,差异表达基因主要富集于生物合成过程、有机物质的生物合成过程、细胞生物合成过程和细胞代谢过程;通过KEGG代谢通路分析,差异表达基因主要富集于柠檬酸代谢、丙酮酸代谢、甲烷代谢和挥发性脂肪酸代谢。3）通过碳水化合物活性酶分析...     

酵母培养物对初产母猪哺乳期血浆生化指标和代谢组的影响

本试验旨在探究饲粮中添加酵母培养物(YC)对初产母猪哺乳期血浆生化指标和代谢组的影响。选取60头健康的初产母猪,随机分为2组,分别为对照组和试验组,每组30个重复,每个重复1头猪。对照组饲喂基础饲粮,试验组在基础饲粮中添加YC(妊娠期添加0.5%,哺乳期添加0.8%)。试验从母猪妊娠第30天开始,至哺乳第28天结束。结果显示：与对照组相比,YC显著降低了初产母猪哺乳期血浆中葡萄糖、总胆固醇、低密度脂蛋白和尿素氮含量(P<0.05);通过代谢组学技术在初产母猪血浆中共检测出12种差异代谢物(P<0.05),这些代谢物主要参与脂肪酸与氨基酸代谢通路。由此可见,饲粮中添加YC可以参与初产母猪哺乳期氨基酸代谢和脂肪酸代谢的调节,L-亮氨酸、D-脯氨酸、肌酸可能是YC参与调控初产母猪哺乳期代谢的重要生物标志物。     

基于代谢组学技术研究枸杞多糖对雏鸡免疫抑制的拮抗机制

本试验旨在通过代谢组学技术研究枸杞多糖干预免疫抑制雏鸡后对脾脏代谢的影响,分析脾脏差异代谢物及筛选生物标志物,为明确枸杞多糖拮抗雏鸡免疫抑制机制提供参考依据。将120羽7日龄海兰褐蛋鸡随机分成3个组,即空白组（NC组）、环磷酰胺组（CY组）及枸杞多糖组（CYLbGp组）,每组40羽,除NC组外,其余2组连续3 d按照80 mg/（kg·d）的剂量胸肌注射环磷酰胺溶液（以生理盐水为溶剂）进行造模,NC组胸肌注射等体积的生理盐水,造模后在CYLbGp组饮水中加入5 mg/（kg·d）枸杞多糖,持续30 d。在CYLbGp组给药结束后第1天,每组选取6只雏鸡采集脾脏,采用基于超高效液相色谱串联三重四级杆飞行时间质谱（UHPLC-Triple-TOF-MS）代谢组学技术对其脾脏进行检测。采用主成分分析（PCA）法、偏最小二乘判别分析（PLS-DA）法和正交偏最小二乘判别分析（OPLS-DA）法对3组脾脏代谢轮廓进行分析,采用MetaboAnalyst 5.0进行单变量ROC曲线分析,筛选生物标志物。结果显示：3组脾脏代谢轮廓发生明显改变,14种差异代谢物被确认为生物标志物[变量投影重要度（VI...     

用宏基因组学方法研究绿肥对水稻根际微生物磷循环功能基因的影响

  【目的】  绿肥对土壤微生物磷循环的影响受到研究者们的广泛关注,但绿肥影响土壤磷循环的微生物机理尚不明确。利用宏基因组学方法剖析长期绿肥还田对土壤磷循环功能微生物的影响,旨在阐明绿肥对土壤磷循环影响的微生物机理,为绿肥的科学利用提供依据。  【方法】  以中国湖南祁阳绿肥及稻草还田定位试验的水稻根际土为材料,利用宏基因组学方法,对土壤微生物DNA进行PE150 (双端读长150 bp) 宏基因组测序,使用MetaWRAP软件中的read_qc模块进行质控,用assembly模块megahit方法进行组装;基于组装的较长序列 (> 1000 bp) 使用Diamond软件的BLASTX和UniProtKB/SWISS-PROT数据库进行序列比对,根据磷活化 (磷酸酯矿化、膦酸酯矿化、无机磷溶解)、磷吸收 (膦酸酯运输、磷酸酯运输和无机磷酸盐运输) 和缺磷诱导响应调控三大类主要磷循环功能相关基因 (重点关注的64个磷循环功能基因) 进行筛选;再利用R语言进一步分析水稻根际土壤中磷循环功能基因相对丰度及其与土壤理化指标之间的关系,阐述绿肥对土壤磷循环功能微生物的影响。  【结果】  土壤pH等9个常规指标在有、无绿肥处理之间均无显著差异。无稻草还田时,绿肥处理对64个磷循环功能基因中的11个相对丰度影响显著,这11个基因广泛分布在除磷酸酯运输及无机磷溶解外的5个功能组中,其中phnA、phnN、phnV等3个基因相对丰度上升,phnI、phnL、glpB、glpO、pitA、phoA、phoP、phoU等8个基因相对丰度下降。而在稻草还田时,绿肥处理仅phnPP基因相对丰度显著降低。相关性分析显示,土壤pH与磷酸酶活性、无机磷溶解基因pqqB、pqqC 、pqqCD、pqq E、pqqF相对丰度呈显著负相关 (P < 0.05);无机磷溶解pqqB、pqqC 、pqqCD、pqq E等4个基因相对丰度分别与有效磷含量、磷酸酶活性以及有机氮含量呈显著正相关 (P < 0.05)。冗余分析 (RDA) 结果表明,绿肥处理通过pH、AP以及磷酸酶活性影响磷循环功能基因。  【结论】  绿肥翻压下水稻根际微生物磷功能基因相对丰度深受稻草还田的影响。与单绿肥或单稻草还田相比,绿肥翻压基础上增加稻草还田对磷循环功能基因影响效果不明显,秸秆甚至减弱了绿肥对磷循环功能基因的影响,其原因可能是绿肥和稻草还田下不同微生物及不同磷循环功能基因之间存在激烈竞争。     

磷酸甘油转移酶基因在水稻白叶枯病菌致病力中的作用研究

稻黄单胞菌稻致病变种(Xanthomonas oryzae pv.oryzae,Xoo)引起的水稻白叶枯病,是水稻上的重要致灾病害之一。前期基因组学分析发现,Xoo菌株PXO99^A的PXO＿04062基因可能编码一个磷酸甘油转移酶,推测与病原菌的致病力有关。本研究采用自杀质粒pK18mobsacB介导的方法,构建了该基因的缺失突变体,并对突变体进行了反式互补。水稻上致病性测定发现,与野生型菌株相比,PXO＿04062基因的缺失突变体DM04062在寄主水稻日本晴上的致病力显著下降,并且其胞外多糖产量、运动性、生物膜形成等均明显降低。进一步采用RNA-seq方法比较突变体转录组的变化,发现突变体中的差异表达基因共有533个,其中包括多个致病相关基因,如胞外多糖合成和细胞运动性等相关基因。与野生型相比,这些基因在突变体中的表达均显著下调。这些结果说明,白叶枯病菌的磷酸甘油转移酶基因是通过影响多种致病力相关因子的合成,来影响病菌在水稻上的致病力。     

基于血浆非靶代谢组学探究急性笼养应激对蛋鸭代谢的影响

随着环保政策改革和养殖业的集约化、规模化发展,蛋鸭叠层式笼养模式的应用越来越广泛,笼养应激对蛋鸭的影响逐渐受到重视。本研究旨在利用非靶向代谢组学分析蛋鸭平养与笼养模式下血浆代谢物的差异。随机挑选平养组(floor-water rearing system, FWR组)和叠层式笼养组(cage-rearing system, CR组)蛋鸭各10只,跖骨静脉采血,通过高效液相色谱-质谱(HPLC-HRMS)非靶向代谢组学技术获得20个在不同饲养模式下的血浆代谢物图谱,经T检验等分析,取差异倍数(Fold-change)ratio≥2或ratio≤1/2、变量重要性(variable importance in projection, VIP)>1、q值<0.05为筛选条件得到显著差异代谢物并作通路富集分析。结果共筛选到差异代谢物30种,其中上调表达的差异代谢物14种(P<0.05),下调表达的差异代谢物16种(P<0.05)。差异代谢物种类主要有甘油磷脂(glycerophospholipids, 16种)、脂肪酰基(fatty acyls, 4种)、羧酸及其衍生物...     

中国观赏芍药表型多样性解析与资源评价

【目的】明确中国观赏芍药品种资源多样性水平,并从切花品种农艺性状角度分析资源特点,为种质收集、利用与创新提供理论依据。【方法】采集来自4个主要栽培地的346个中国观赏芍药品种,从品种资源整体和不同栽培地品种两个方面对采集的表型性状进行频率分布统计、变异系数计算和多样性指数计算,并进行聚类分析。【结果】我国观赏芍药品种多个性状多样性丰富,二元性状、有序多态性状和无序多态性状的多样性指数为0.29—1.90,数值性状的多样性指数为1.90—2.08。二元性状、有序多态性状和无序多态性中,花色和花型多样性指数最高,分别为1.90和1.88,其次是花蕾颜色（1.46）和雄蕊瓣化程度（1.42）。数值性状中,株高和茎长多样性指数最高,分别为2.08和2.07,其次是蕾径（2.04）、花径（2.04）和花高（2.01）,仅茎粗（1.99）和花梗长（1.90）多样性指数小于2。株高和茎长呈正态分布,株高介于38.50—100.50 cm,茎长介于43.19—120.00 cm;蕾径、花径、花高、茎粗和花梗长等5个指标呈非正态分布,蕾径偏大,分布介于1.22—3.99cm;花径变异系数最小,为15.6...