不同刈割强度下羊草转录组研究

刈割是一种重要的草地管理措施,刈割留茬高度直接影响草地生产力及群落结构,在牧草生产中具有重要意义。为研究羊草在不同刈割强度下的转录响应,利用Illumina HiSeq-PE150高通量测序技术,对不同刈割留茬高度(0,2,4,8,12 cm)处理下羊草再生叶片进行了转录组测序。共得到139767803条读长(reads),41.94 Gb原始数据。经过过滤、质控与从头组装后,总共得到转录本270207条,总长度为191.6 Mb。通过与多种数据库比对得到48097条单基因簇(Unigene)注释结果。筛选出了所有刈割强度处理与不刈割对照组显著差异基因共2579条,经过生物信息分析,将其定位到碳水化合物代谢、损伤应答、过氧化氢分解、植物激素信号转导等功能与代谢通路。利用聚类方法得到了随着刈割强度增强,表达量规律变化的基因,分别富集到了过氧化物酶体、光合作用等代谢途径。对羊草在不同刈割高度下的转录组进行了研究,为草本植物分子生物学研究提供了宝贵的数据资源,对于解析羊草响应刈割的分子调控机制及相关基因挖掘具有重要指导意义。     

羊草种子萌发相关基因的筛选及表达分析

前期实验表明,变温处理(28 ℃ 12 h/16 ℃ 12 h)可显著提高羊草种子的萌发率,且羊草种子萌发中的第1天是接受变温信号的关键时期。以此为研究基础,结合羊草种子变温萌发的转录组测序数据,针对羊草种子萌发初期对变温处理的响应筛选出与种子萌发、休眠及低温相关的基因24个,利用测序结果中这些基因的RPKM值制作基因表达热图并分析其表达差异。以萌发率高、低的两种羊草种质的种子为材料,对24个基因在恒温12 h(28 ℃)和变温1 d(28 ℃ 12 h/16 ℃ 12 h)萌发处理中的表达分别进行了定量分析。结果表明,与恒温对照相比,变温处理12 h后,表达明显上调的基因有SAIN1,PP2C62,EXPB3,EXPB4,GA3ox,EXPA2和EXPA7,而表达明显下调的基因有bHLH49,GID1,ABI8,Chi1,11833,CBF3,NAC2,PP2C72,SAIN2和5423。通过进一步分析相关基因在高、低萌发率两个种质中表达的差异,筛选出其中可能与羊草种子萌发相关的基因有几丁质酶基因Chi1,转录因子基因CBF3,羊草新基因5423,赤霉素合成基因GA3ox,细胞松弛素蛋白基因EXPB4和羊草新基因SAIN1,将为下一步阐明羊草种子萌发的分子作用机理奠定基础。     

羊草叶绿体非编码区多态性标记筛选及群体遗传多样性

为筛选多态性丰富的羊草叶绿体非编码区片段,本研究以9个不同地理位置的羊草居群为材料,通过对12个叶绿体非编码区DNA片段测序及其序列间变异分析试图从中找出有遗传差异的叶绿体DNA(cpDNA)片段,并利用有多态性的cpDNA片段进行遗传多样性分析。结果表明,序列ndhF-rpl32、trnL-trnF、trnC-ycf6、aptI-aptH具有比较丰富的变异,可作为下一步研究野生羊草群体遗传学和谱系地理学较为理想的分子标记。在37个羊草个体4条非编码区片段的合并序列中,共检测到15种单倍型,单倍型多态性(Hd)为0.928,核苷酸多态性(Pi)为0.00101;遗传分化指数(Fst)为0.58884,基因流(Nm)为0.17,基因流较小;中性检验Tajima’s D(-1.08542)和Fu’s Fs(-5.301)均为负值,且差异不显著(P>0.10),推测羊草遵循中性进化理论,可能经历过种群扩张;AMOVA结果显示,65%的分子变异出现在居群间,35%出现在居群内;Mantel检验得到,遗传距离与地理距离具有显著相关性(r=0.449,P<0.05);居群分化值Nst 0.386(0.1865)大于Gst 0.234(0.1506),差异显著(P<0.05),表明羊草居群存在分子谱系地理结构。通过系统发育树分析得到,羊草15个单倍型分为两大分支,H2和H10聚为一支,它们与别的居群个体亲缘关系较远,其余单倍型聚为另一支;单倍型网络图显示,H2和H12、H10和H12亲缘关系较远,与系统发育树分析结果基本一致。本研究为羊草的种质资源保护、谱系地理学研究等工作奠定了基础。     

美国国家兽医认证计划及其主要制度

为给我国新型兽医制度建设提供借鉴,对美国国家兽医认证计划(NVAP)及其主要制度进行了研究。研究表明,美国认证兽医是经美国动植物卫生监督局(APHIS)法定程序认证,代表联邦兽医(官)和州动物卫生官(SAHO)实施流通动物检疫监管,协助政府兽医(官)控制动物疫病的执业兽医,具有官方兽医属性。目前,全美80%的兽医为认证兽医,总量高达6.8万名,有效弥补了政府兽医(官)力量的不足。《美国联邦法规》第161.1条规定,NVAP的管理主要涉及认证兽医的分类、职责、培训教育、认证、复审、纪律处分等制度。     

棉秆、莲房（壳）种食用菌效益高

收割后剩下的棉秆不再焚烧，而被用于食用菌加工。记者昨日从湖北省农科院获悉，该技术获评2010年湖北省科技进步一等奖。据湖北省农科院“农业副产物生物转化食（药）用菌及其精深加工与产品开发”最新研究成果，棉秆、莲房（壳）可以用来种植灵芝、香菇等食用菌，目前已在随州、     

赤霉素的生物合成及其在葡萄栽培上的应用

植物生长调节剂是一种人工合成的具有植物激素活性的物质,目前在果树生产中已广泛使用,而且使用的目的更是多样化,其中以赤霉素使用居多,又以在葡萄上的应用最为普及。本文针对赤霉素的生物合成及葡萄生产中利用赤霉素的研究报道对有关方面进行简要综合的论述。     

油茶丰产栽培技术要点

<正>油茶Camellia oleifera Abel.与油棕Elaels gulneensis Jacquin、油橄榄Olea europaeaL.和椰子Cocos nucifera Linnaeus并称为世界四大木本食用油树种,也是我国特有的优良乡土树种。目前     

白羊草R2R3-MYB转录因子的挖掘及对干旱胁迫反应的研究

本文以白羊草（Bothriochloa ischaemum）为材料，利用其目前已有的转录组序列，通过搜索、比对、功能域多态性分析、进化树构建和基因表达分析等手段，对白羊草R2R3-MYB型转录因子进行挖掘和干旱胁迫下的表达模式分析。结果从白羊草挖掘出43个R2R3-MYB转录因子，它们具有高度保守的[W]-X（19）-[W]-X（19）-[W]-X（n）-[W]-X（18）-[W]结构，主要参与生长发育、次生代谢和逆境响应等生物过程。通过进一步的分析，本研究筛选出8个可能参与干旱胁迫响应的R2R3-MYB转录因子。这为白羊草R2R3-MYB基因的功能研究和开发利用奠定了基础。     

征稿启事

《宁夏农林科技》创刊于1958年，南宁夏农林科学院主办，为省级综合性农业科技期刊，3次获得自治区出版系统先进集体、优秀期刊等奖励。1999年经国务院新闻办、国家新闻出版署审核备案。被《中国期刊网》、《中国学术期刊（光盘版）》全文收录，并被确定为中国学术期刊综合评价数据库统计源期刊；维普数据库、万方数据库、国际农业和生物学文摘数据库（CABI）等国内外数据库也将本刊收录；     

中国柽柳繁殖与栽培技术

中国柽柳(Tamarix chinensis Lour.)为落叶小乔木或灌木,野生于山东、辽宁、河北、河南、江苏(北部)等省,喜生于河流冲积平原、海滨、滩头、潮湿盐碱地和沙荒地,具有极强的耐盐碱能力和观赏价值。由于柽柳独特的抗逆性及盐碱地利用的不可替代性,对其研究逐步深入。2006年在种质资源调查、汇集中,在野外发现多个中国柽柳的变异单株。之后繁殖建立无性系。通过大田扦插、容器育苗多种繁育技术对中国柽柳进行扩繁。