黄Ⅳ肉鸡微卫星多态性与生长和屠宰性状的相关分析

利用31个微卫星标记分析了黄Ⅳ肉鸡群体的173个个体各标记座位的等位基因数、基因频率、杂合度和多态信息含量,同时测定群体的14项生长性状和屠宰性能指标,采用方差分析法对标记与性状进行相关分析。结果表明:各位点平均等位基因数为4,平均杂合度为0.330 6,平均多态信息含量为0.487 1。方差分析显示:微卫星标记ABR0322、MCW0104对2周龄体重有极显著和显著影响;MCW0331对4周龄体重有显著影响;ABR0322、MCW0258对6周龄体重有极显著和显著影响;MCW0331、MCW0258对8周龄体重、屠体重和半净堂重有显著影响;ABR0322、ADL0146、MCW0067对胸肌重有显著影响;MCW0183、MCW0258对腹脂重有显著影响;ADL0146、MCW0095、MCW0331对肝重有显著影响;LEI0146、MCW0183、MCW0245、MCW0331对肌胃重影响显著;ADL0278、MCW0258、MCW0331对心重有显著影响;MCW 0331对腿肌重有极显著影响。     

问荆化感作用对大豆生殖后期形态、生理和产量性状的影响

[目的]为了探讨问荆对大豆生殖后期生长的化感效应,[方法]采用温室盆栽法,研究问荆夏枝水浸液对北豆42（BD）、北交8032（BJ）、登科1号（DK1）、登科3号（DK3）和黑河43（HH）5个品种大豆生殖后期形态、生理指标及产量性状的影响。[结果]结果表明,问荆水浸液处理后,各品种大豆的株高、叶面积、叶绿素含量、单株粒数、单株结荚数、有效结荚数、结荚高度都降低;MDA含量、WSS含量增加,过氧化氢酶活性、过氧化物酶活性先升高后降低。北交8032在0.04 kg·L-1、0.07 kg·L-1问荆水浸液处理后产量性状的株高显著降低（P<0.05）,北豆42在0.07 kg·L-1问荆水浸液处理后节数显著降低（P<0.05）,其他品种大豆最终株高、节数变化较小。[结论]说明在低浓度问荆水浸液下大豆有一定的抗性,但是问荆的化感效应对大豆生长有很大影响。     

豫西脂尾羊的分子遗传育种研究进展

该文从豫西脂尾羊的生产性能、血液生化指标、血液蛋白、染色体核型、微卫星标记评估和相关基因的研究等方面,对近些年来国内外对于豫西脂尾羊的分子遗传育种研究进展进行了综述,以期为豫西脂尾羊育种研究工作提供参考。     

生菜EST-SSR的分布特征分析

从NCBI数据库下载了81518条生菜EST序列,处理后得到无冗余序列61757条,共搜索到2040个SSR位点,出现频率为3.3%。三碱基重复是主要的类型,占38.53%,其次是二碱基和六碱基重复,出现次数最低的是四碱基重复。在181种重复基元类型中,(AGA)n和(ATG)n是主导的重复基元类型,分别占12.01%和3.53%。设计合成的30对引物在50份生菜资源进行鉴定,共筛选出4个材料特异性标记。该研究为后续开发生菜多态性 EST-SSR标记,进行种质资源鉴定、分子标记辅助育种、遗传图谱构建奠定了基础。     

生菜EST-SSR的分布特征分析（英文）

从NCBI数据库下载了81 518条生菜EST序列,处理后得到无冗余序列61 757条,共搜索到2 040个SSR位点,出现频率为3.3%。三碱基重复是主要的类型,占38.53%,其次是二碱基和六碱基重复,出现次数最低的是四碱基重复。在181种重复基元类型中,(AGA)n和(ATG)n是主导的重复基元类型,分别占12.01%和3.53%。设计合成的30对引物在50份生菜资源进行鉴定,共筛选出4个材料特异性标记。该研究为后续开发生菜多态性EST-SSR标记,进行种质资源鉴定、分子标记辅助育种、遗传图谱构建奠定了基础。     

脊尾白虾血细胞ESTs的生物信息学与微卫星序列特征分析

对前期测序得到的脊尾白虾血细胞2853条EST序列进行了生物信息学和微卫星序列特征分析。EST序列拼接得到1053条Unigenes,包括329条Contigs和724条Singlets。BLAST分析表明,593(56.3%)条Uingenes与数据库中已知基因具有相似性。KEGG代谢途径分析表明,181条Unigenes映射到120条代谢途径。通过EST-SSR分析,共得到416条微卫星序列,检出率为14.58%。其中,两碱基重复序列374条,占89.90%,AG重复类型最多;三碱基35条,占8.41%,AAT重复类型最多;四碱基7条,占1.68%,AAGT重复类型最多。本研究可为脊尾白虾功能基因资源挖掘及分子标记筛选提供有效数据。     

茴鱼微卫星标记开发及保护遗传学研究进展

正茴鱼(Thymallus)隶属于鲑形目、鲑科、茴鱼亚科,是一类具有重要渔业价值的珍稀名贵冷水性鱼类[1-2]。目前已知该属鱼类主要有分布于欧洲的欧洲茴鱼(T.thymallus)、分布于北美洲的北极茴鱼(T.arcticus)和亚洲北部的其他茴鱼种和亚种。其中,亚洲东北部是茴鱼物种多样性最丰富的地区。在东西伯利亚地区的贝加尔湖、勒拿河、叶尼塞河及其他环北冰洋河流水系中分布有贝加尔茴     

大竹蛏5 个野生群体遗传多样性的微卫星分析

运用微卫星标记对大竹蛏(Solen grandis)辽宁丹东(DD)、河北秦皇岛(QHD)、山东日照(RZ)、江苏吕四(LS)和广西北海(BH)近海5个不同地理野生群体共计150个样品进行了遗传多样性分析。结果表明:14个位点多态信息含量范围为0.696~0.853,均呈现高度多态性,每个位点检测到的等位基因数8~22个,共检测到199个等位基因,平均等位基因数为14.2,等位基因丰富度为11.05,5个群体的期望杂合度分别为0.769(DD),0.791(QHD),0.826(RZ),0.815(LS),0.785(BH),观察杂合度分别为0.837(DD),0.812(QHD),0.875(RZ),0.809(LS),0.858(BH),表明各群体处于较高的遗传多样性水平。Hardy-Weinberg平衡检验显示,仅有Sg16位点在丹东群体显著偏离平衡,其余位点在5个群体均正常,表明各群体遗传较稳定,处于平衡状态。5个群体间的遗传距离在0.141 2~0.340 9,DD和QHD的遗传距离最小,DD和BH的遗传距离最大;基于Da遗传距离构建的UPGMA聚类树显示,距离相邻的DD、QHD渤海湾群体聚为一支,RZ、LS黄海群体聚为另一支,最后与南海群体BH聚在一起,聚类结果与地理位置密切联系,基于贝叶斯遗传聚类得到了相同的结果。分析群体间的Fst值可知,两两群体间的Fst值在0.039 1~0.094 7,群体间产生了中等程度的遗传分化,并且达到了极显著水平(P=0.000 1)。由此可见,中国沿海各地理群体野生大竹蛏种质遗传多样性较为丰富,但不同群体间存在显著的遗传分化,故各增殖放流海区应当加强对放流苗种及繁殖亲本的种质检测,防止异地繁养等人为因素对大竹蛏各野生种群遗传结构造成破坏。     

不同环境下水稻株高和穗长的QTL分析

【目的】水稻株高和穗长是影响水稻产量的2个重要因素,选育长穗大粒和株高适中的品种将对水稻的增产有非常重要的意义。通过对株高和穗长进行多环境QTL分析,鉴定稳定表达的株高和穗长的主效QTL,增加对株高和穗长遗传行为的了解,为水稻株型育种提供参考。【方法】首先,以辽宁省超级粳稻品种沈农265和云南省的地方粳稻品种丽江新团黑谷杂交衍生的粳-粳交重组自交系（recombinant inbredline,RIL）群体为试验材料,采用QTL IciMapping v3.0软件基于完备复合区间作图法在多环境条件下（沈阳,2011;海南,2012年;沈阳,2013年）对株高和穗长进行QTL分析;其次,基于上面定位的结果,结合已发表的文献和水稻数据库中的相关数据,对在3种环境条件下检测到的主效QTL进行比较分析,确定其可靠性;最后,采用主效QTL-BSA法（Bulked Segregant Analysis of Major QTL）对3种环境条件下检测到的主效QTL进行分析,进一步缩小目标QTL的区间范围。【结果】在3种环境条件下,沈农265和丽江新团黑谷的株高和穗长均存在显著差异,在RIL群体中,株高和穗长存在较大幅度变异,呈现双向超亲分离,近似于正态分布,这表明株高和穗长均为多基因控制的数量性状。在3种环境下,共检测到9个与株高和穗长相关的QTL,包括5个株高QTL,分布于第6、7、9和12染色体上,LOD介于2.67-19.39,加性效应值在-17.68-2.90,单个QTL贡献率为4.25%-37.35%;4个穗长QTL,分布于第6、7和9染色体上,LOD介于3.57-23.18,加性效应值在-3.22-1.42,单个QTL贡献率为11.30%-61.62%。有5个QTL被单独检测到,仅有4个QTL能在2个或3个环境中被检测到。其中,位于第9染色体上相同区间的qPL9a和qPH9能在3种环境中被检测到,而位于第7染色体上相同区间的qPH7和qPL7b分别能在2种或3种环境中被检测到,增效等位基因均来自丽江新团黑谷。同时,依据已发表的相关文献和Gramene网站对所定位的主效QTL进行整合分析,在第7染色体上的RM10-RM248区域存在一个油菜素内酯的信号转导调控因子基因OsBZR1和8个控制株高或穗长相关的QTL,在第9染色体上的RM566-RM242区域存在多个赤霉素合成或油菜素内酯合成相关基因和9个控制株高或穗长相关的QTL,进一步验证了所检测到的主效QTL的可靠性。利用主效QTL-BSA分析法将第9染色体上控制株高和穗长的QTL-qPHL9（qPL9a和qPH9）定位在RM1189-RM24457,物理距离522.46 kb,而将新发现的第7染色体QTL-qPHL7（qPL7b和qPH7）定位在RM478-RM429,物理距离为856.49 kb。【结论】3种环境中,在沈农265和丽江新团黑谷的RILs群体分别检测到5个控制株高和4个控制穗长的QTL,其中位于第9染色体上的主效QTL-qPHL9同时影响株高和穗长,在3种环境中均能被检测到,位于第7染色体上的主效QTL-qPHL7同时影响株高和穗长,该位点能在2种环境中被检测到,是一个新的多效性QTL位点。     

Application of Molecular Markers Linking to Cytoplasmic Male Sterile Loci to Assist Maintainer Line Selection and Their Selection Efficiency in Welsh Onion （Allium fistulosum L.）

Cytoplasmic male sterility exists widely in most natural populations of welsh onion （Alliumfistulosum L.）, which makes it possible to breed out many male sterile lines for heterosis utilization. Unfortunately, the breeding of cytoplasmic male sterility in welsh onion has a little progress due to the limitation of its biological characteristic and traditional selection approach. To study the feasibility and the efficiency of utilizing marker assisted selection for male sterile lines in welsh onion, one SCAR marker, SCS13, and one RAPD marker, S2002400, which could distinguish between N and S cytoplasm in several welsh onion cultivars, were identified. The two markers were then confirmed by Southern blotting, and used to screen the N or S cytoplasm of individual plants in seven welsh onion cultivars in this study. Male sterile and fertile plants were evaluated by aceto-carmine dying. The frequency of N-cytoplasmic plants and maintainer genotype was calculated in the seven open populations of welsh onion. The minimum number of plants needed to identify a maintainer was evaluated to be 95% reliable. Results showed that 20 to 80% decrease of crosses and self-crosses for identifying a maintainer genotype could be achieved by the marker-assisted selection compared with traditional selection method. It was proved that the molecular markers could precisely identify cytoplasmic types individually, performed by one generation of cross and two generations of testcrosses and self-crosses. Finally, several maintainer genotype plants were selected with the help of the two markers in the seven cultivars. The screened markers could assist and accelerate sterile and maintainer lines selection with less labor and cost.