高粱响应丝黑穗病侵染的转录组分析

高粱是中国重要的粮食作物,用途非常广泛。丝黑穗病在中国的高粱产区均有发生,已成为影响中国高粱生产最重要的病害。本研究采用高通量测序技术对被丝黑穗病病菌侵染的抗感病高粱进行转录组测序,筛选得到差异基因620个,其中229个上调表达,391个下调表达。差异基因中有330个获得GO数据库功能注释,主要涉及生物合成过程、催化活性、细胞过程等诸多生理生化过程;KEGG数据库富集分析发现,共有105个基因被注释到52个代谢通路中,其中类黄酮生物合成、苯丙素生物合成、二苯乙烯、二庚烷和姜辣素的生物合成、植物激素信号传导、苯丙氨酸代谢、植物病原互作、类胡萝卜素生物合成、油菜素内酯生物合成等通路显著富集。有26个差异基因被鉴定为转录因子,分布在10个转录因子家族中。RT-qPCR验证了高粱中差异基因的表达量变化趋势与转录组测序分析结果一致。本研究结果表明,在抗病高粱响应病原菌侵染的过程中,大量基因被诱导或抑制表达,与病原胁迫响应有关的部分转录因子显著上调表达,抗病相关的代谢和信号传导途径被激活。本研究为进一步挖掘高粱抗病基因提供参考。     

马粪海胆的染色体制备及组型分析

采用改进的染色体制备方法,分别对马粪海胆Hem icentrotus pulcherrimus受精卵的二细胞期、八细胞期和囊胚早期的细胞进行染色体制备,结果显示,于囊胚早期取样的马粪海胆,其滴片效果最好。通过组型分析确定马粪海胆的染色体数目为2n=42,组型公式为2n=42=20m+20 sm+2 s。t     

2型猪链球菌强毒株与无毒株胞外蛋白的双向电泳图谱比较分析

利用双向电泳技术可以对体外培养的2型猪链球菌强毒株和无毒株进行胞外蛋白质组比较,寻找与毒力相关的蛋白质.2型猪链球菌强毒株和无毒株在无蛋白细菌培养液中37℃摇床培养16 h,从培养物上清中获得胞外蛋白.第一向电泳用pH4-7线性IPG胶条进行等电聚焦,第二向电泳用SDS-PAGE凝胶再分离蛋白,经过考马斯亮蓝R350染色,图像扫描后,利用软件分析处理图像.在2型猪链球菌强毒株和无毒株的胞外蛋白质图谱中都分别检测出180±10个蛋白质斑点,它们的蛋白质分子质量分布基本相似;在所检测到的差异蛋白质斑点中,其中有50个蛋白斑点只存在于无毒株中而强毒株中不存在,有52个蛋白斑点只存在于强毒株中而无毒株中不存在,有7个蛋白斑点的表达量相差达5倍以上.这为研究2型猪链球菌的致病机理提供了蛋白质组学方面的信息.     

荷斯坦奶牛产后期血浆差异蛋白质组学研究

为了检测和分析荷斯坦奶牛分娩后不同时期血浆中的差异蛋白。采用二维凝胶电泳(2-DE)分离血浆蛋白,考马斯亮蓝染色,PDQuest8.0软件检测分析差异蛋白点,MADIL-TOF-TOF串联质谱鉴定差异蛋白点。结果发现3种差异蛋白,分别是结合珠蛋白、免疫球蛋白γ2链C区和3,5-二碘水杨酸络合的牛血清白蛋白。对3种蛋白在产后不同时期的趋势进行分析,可能分别与产后应激、免疫应答和物质运输有关。荷斯坦奶牛产后不同时期血浆中蛋白表达存在差异,对差异表达蛋白的研究有利于探索奶牛产后生理机制,可作为产后饲养、配种及防止产后感染等研究的基础。     

基于液质平台代谢组学生物样本的采集和制备

代谢组学是利用高通量检测技术对内源性代谢物进行定性和定量分析,从而挖掘代谢物与相应生物学变化的相对关系。目前,代谢组学在药物研发、疾病研究、药物毒理学等领域发挥着越来越大的作用。液相-质谱联用平台,检测的相对分子质量范围大、分辨能力强、扫描速度快,拥有很高的灵敏度和较宽的动态范围,其在代谢组学中的应用得到越来越多研究者的认可。生物样品的采集和制备是代谢组学试验中至关重要的步骤,直接决定着试验结果的可靠性。由于样本自身的复杂性以及对样本采集和制备过程中细节的忽视,往往导致试验结果出现偏差,甚至导致错误的结论。因此充分验证样本的采集和处理方法在试验中尤为重要。本文主要综述了基于质谱平台的代谢组学常用生物样本的采集和制备方法,为代谢组学试验提供相关参考。     

日粮形式与出栏前停用纤维饲料对生长肥育猪性能的影响

一、简介猪饲养营养界有研究显示,颗粒饲料可提高增重速度、改善饲料转化效率,但会增加猪只腹部的不饱和脂肪酸,高纤维日粮比玉米大豆为主要成分的日粮对腹部脂肪的碘值升高效果更明显。宰前停用高纤维饲料可解决饲喂高纤维日粮导致的屠宰率降低现象,但对猪只腹部脂肪碘值升高现象只能部分缓解。日粮形式与纤维饲料的使用策略这两大因素对生长育肥猪生长性能的影响却鲜有研究,本试验拟在这方面进行探究,以期对饲料使用者有所帮助。     

恩诺沙星致猪肝脏蛋白质差异表达

采用双向电泳技术和质谱分析技术分析小型猪肝脏的蛋白质表达,以探讨恩诺沙星对猪肝脏蛋白质表达的影响。结果显示,与空白对照组相比,在低剂量组(5mg/kg)、中剂量组(25mg/kg)和高剂量组(125 mg/kg)都发现了glyoxalase domain-containing protein 4(GLOD4)的表达显著下降(P0.05),在中剂量组和高剂量组中都发现了线粒体stress-70protein(HSP70)的表达显著下降(P0.05)。结果表明,恩诺沙星会对部分猪肝脏蛋白质表达造成影响。     

非靶向代谢组学对砂梨水心病不同代谢物质的差异分析

水心病是多发于梨果肉中的常见性生理性疾病,严重影响了梨果肉的风味口感.为了研究水心病发病果肉带来的代谢物差异,我们以花后125 d的发生水心病的'秋容'梨果肉为材料,以未发病的健康果肉为对照,采用基于液相色谱-质谱联用非靶向代谢组学技术,分析'秋容'梨水心病果肉的差异代谢产物.结果 发现水心病果肉中苦味氨基酸含量升高,...     

补偿生长对猪肌肉蛋白质组的影响及其与肉嫩度的关系

补偿生长是大家熟知的一种现象,是通过一段时间采食量的减少来限制生长,但是通过补偿生长,到达屠宰重时动物的生长没有受到限制.已经有很多学者报道了补偿生长与自由采食相比肌肉嫩度增加,然而补偿生长与肌肉嫩度之间的机理仍然不清楚.这篇综述综合了国外补偿生长对肌肉蛋白组影响的最新研究进展,揭示了补偿生长对屠宰后O h和48 h肌肉蛋白组的有趣变化,这可能对弄清补偿生长与蛋白周转及肉嫩度之间的关系很有用.     

瘤胃微生物移植及应用研究进展

反刍动物瘤胃微生物对瘤胃发育、营养物质消化和宿主生理健康有重要意义。瘤胃微生物移植(rumen microbiota transplantation, RMT)是将特定供体的瘤胃微生物及其代谢物移植到受体中,通过操纵瘤胃微生物群落进行菌群重塑或微生物组修复,改善宿主机能状态、生产效率、产品质量等,并可预防或治疗部分胃肠道疾病的措施。本文就RMT的发展历程、应用、安全性及潜在作用机制等进行了综述,重点阐述了RMT在揭示瘤胃微生物组特性或功能、调节宿主新陈代谢、提高生长性能、调控微生物区系平衡、疾病治疗等方面的作用,为RMT的研究与应用提供技术参考。