SNP标记在小麦遗传育种中的应用研究进展

小麦遗传育种对于小麦产量的提高意义重大。高密度单核苷酸多态性(SNPs)广泛应用于小麦数量性状位点(QTL)定位和标记性状关联分析,这极大推动了小麦遗传学和基因组学领域的发展,并有助于阐明表型和基因型之间的复杂关系,提高了小麦的育种效率。通过综述SNP在小麦遗传育种中的研究进展,为小麦育种提供进一步理论指导。     

我国梅雨研究回顾与讨论

[目的]回顾我国梅雨的研究进展及其研究成果。[方法]利用国家气象信息中心提供的1961~2009年相关台站降水、日照资料和1996年NCEP/DOE2逐日高度场资料,从梅雨的划分、梅雨区范围及其空间分布3个方面,回顾了前人对我国梅雨的研究。[结果]制定一个客观的、统一的梅雨划分标准需进一步研究和探讨,以便为我国梅雨范围的确定提供基础。在梅雨期的划定中,加以考虑日照时长参数,可使入出梅的划定更加可靠。气候平均结果显示宜昌以西的湖北西南部仍有梅雨现象,梅雨范围可西延一个经度;传统梅雨区的西北角梅雨现象不显著,已不属于我国梅雨范围;应以客观、统一的梅雨标准区分湖南中部、江西中部和浙中南地区的春雨和梅雨。[结论]我国学者对江淮梅雨的分型还存在诸多争议,选择合适的分析方法和分析区域对梅雨分型有着重要影响。     

新疆多浪羊白细胞介素8 cDNA的克隆测序及其变异SNP的分析

采集多浪羊的血液,分离白细胞,提取总RNA,用白细胞介素8（IL-8）的引物进行两步法的RT-PCR扩增、克隆与酶切鉴定,测序后进行序列比对,与NM_001009401.1同源性高达99%,初步判定为多浪羊的IL-8编码全长cDNA。通过序列比对,发现多浪羊IL-8的基因起始密码子上游第七个碱基发生突变,在NM_001009401.1中是T,而在测序的多浪羊的IL-8中是C。对该测序序列进行数据库搜索和序列比对,发现该碱基变异很独特,并对该变异可能对mRNA蛋白翻译的影响进行了初步的分析。     

鸡催乳素受体基因的多态性分析

[目的]研究PRLR基因对鸡就巢和产蛋性状的影响。[方法]设计10对引物,采用PCR-SSCP方法,扩增了旧院黑鸡、固始鸡、山地乌骨鸡以及新扬州鸡PRLR基因部分外显子及邻近内含子序列。[结果]检测到4个多态位点,分别为外显子3处的SNP1（A10862G,位于5’-UTR）、外显子6处的SNP2（A25670G,为同义突变）、内含子8处的SNP3（G30716A）以及外显子10处的SNP4（A31900G）。卡方独立性检验结果发现,4个多态位点不同基因型在4个群体间的分布差异极显著（P〈0.01）。[结论]PRLR基因可能是影响鸡就巢和产蛋性状的一个主效基因。     

蜡样芽孢杆菌分型方法的研究进展

蜡样芽孢杆菌是一种可引起食物中毒的机会致病菌,在自然界分布广泛,致病菌株与炭疽杆菌具有相似的毒素,引起中毒的菌株分为呕吐型和腹泻型。研究该菌的分型方法对蜡样芽孢杆菌的溯源和流行病学调查具有重要意义。目前,该菌的分型方法有传统分型和分子分型,传统分型方法包括噬菌体分型、生化分型等;分子分型方法包括重复序列PCR分型、扩增片段长度多态性分型和全基因组测序分型等。本文以蜡样芽孢杆菌为研究对象,对其分型方法进行了综述,说明了不同分型方法的优缺点,以期为该细菌病的防控提供一定的参考。     

SNP对油菜种子萌发和幼苗生长的影响

研究外源一氧化氮(NO)供体硝普钠(SNP)在10、50、100、200、500、1000、2000μmol/L等7个浓度下对油菜种子萌发和幼苗生长的影响。结果表明:100μmol/L的SNP可有效促进供试油菜种子的萌发,提高油菜种子的发芽率、发芽势、发芽指数和活力指数,促进油菜幼苗地上部分的生长,而高浓度的SNP对油菜种子萌发有抑制作用,且浓度越高抑制作用越明显。SNP对油菜幼苗根的生长亦有抑制作用。总体来看,在100μmol/L处理的综合效果最好。     

牛肌肉生长抑制素（MSTN）基因的检测、分型研究

本研究根据皮埃蒙特牛肌肉生长抑制素（MSTN）基因序列设计了3条特异性引物，以纯种皮埃蒙特牛、皮荷杂种牛和荷斯坦牛的DNA为模板，对是否携带MSTN基因的个体牛进行单核苷酸多态性分析，提出了一套牛肌肉生长抑制素基因检测分析以及准确鉴定其基因型的方法。     

瘤荔枝螺对饵料的摄食选择性研究

为了解决瘤荔枝螺亲螺促熟培育的适宜饵料问题,选用菲律宾蛤仔、缢蛏、等边浅蛤、紫贻贝、条纹隔贻贝、小杂蟹、小青占鱼为饵料,研究瘤荔枝螺对7种饵料的摄食喜好性。结果表明,在海水比重1.013~1.015、水温22~25℃,溶氧量4~5 mg/L的条件下,瘤荔枝螺对条纹隔贻贝具有很强的嗜好性,对缢蛏、紫贻贝、小杂蟹也表现出正选择,对菲律宾蛤仔、等边浅蛤、小青占鱼表现为明显的负选择,其被避食程度由弱到强依次为等边浅蛤>菲律宾蛤仔>排卵后等边浅蛤≥排卵后菲律宾蛤仔>小青占鱼。     

玉米大斑病抗性基因SNP基因芯片分析

利用SNP基因芯片(56 110个SNP)对3对玉米大斑病Ht3近等基因系进行检测分析。借助生物信息学和比较基因组学方法,确定了29个相关数量抗性候选基因,均分布于2、3、7、9号染色体;14个候选基因与各类酶活性、能源合成、金属离子、DNA合成修饰、抗逆等功能相关。其中,GRMZM2G058197位于7号染色体bin7.04区域166087520-166091392,与玉米大斑病质量抗性基因Ht3基因位置相吻合。     

利用小麦660K SNP芯片分析川麦44在其衍生后代中的遗传贡献

为明确小麦骨干亲本川麦44的遗传特性,利用小麦660K SNP芯片对川麦44及其衍生品种进行解析。结果表明,川麦44在6个衍生品种中的遗传贡献率为23.77%～72.63%,平均为48.58%,衍生品种存在遗传偏亲现象。川麦44特异性标记在不同染色体和染色体组中分布不均匀,衍生品种中特异性标记数具有B染色体组A染色体组D染色体组的共同特征。在除1B和6A外的染色体上,共筛选出52个川麦44高遗传率片段,片段长度为0.10～76.20 Mb,其中5B上的片段数量最多,累计长度最大。本研究结果为进一步明确骨干亲本川麦44的重要基因组区段及其功能奠定了基础。