意大利蜜蜂工蜂中肠发育过程中长链非编码RNA的差异表达分析

【目的】长链非编码RNA(lncRNA)在真核生物的基因表达、表观遗传和细胞周期调控等方面发挥重要功能。本研究旨在探究意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂中肠发育过程中lncRNA的表达谱及其作用。【方法】利用RNA-seq技术和链特异性建库方法对意蜂7和10日龄工蜂中肠(Am7、Am10)进行深度测序,下机的原始数据经过Perl脚本过滤得到高质量有效读段。利用bowtie工具将有效读段比对核糖体数据库,进一步利用Top Hat2软件将未比对到核糖体数据库上的数据比对到参考基因组。利用CPC和CNCI软件对转录本的编码能力进行预测。通过RT-PCR对部分lncRNA进行鉴定。利用edgeR软件进行差异表达lncRNA(DElncRNA)分析,进而预测lncRNA的上下游基因,并对上下游基因进行GO及KEGG代谢通路富集分析。联用RNAhybrid、Miranda和Target Scan软件预测DElncRNA靶向结合的mi RNA及mi RNA靶向结合的靶基因,并通过Cytoscape软件构建DElncRNAs-mi RNAs-m RNAs的调控网络。最后,通过RT-qPCR验证测序数据的可靠性。【结果】Am7和Am10的深度测序分别获得134 802 058和147 051 470条原始读段,经严格过滤分别得到134 166 157和146 293 288条有效读段;共得到3 890个DElncRNA,包括2 005个上调lncRNA与1 885个下调lncRNA。RT-PCR验证结果显示共有8个lncRNA能扩增出符合预期的目的片段,表明预测出的lncRNA真实存在。DElncRNA的上下游基因数为1 793个,它们涉及42个GO条目,包括代谢进程、发育进程、细胞进程、应激反应和免疫系统进程等;这些上下游基因还涉及251条代谢通路,包括碳代谢、嘌呤代谢和脂肪酸的生物合成等物质代谢通路,硫代谢、甲烷代谢和氧化磷酸化等能量代谢通路,Hippo信号通路、Wnt信号通路和Notch信号通路等信号通路,溶酶体、内吞作用和泛素介导的蛋白水解等细胞免疫通路,以及MAPK信号通路、Jak-STAT信号通路和NF-kappa B信号通路等体液免疫通路,上述结果表明DElncRNA在意蜂中肠发育过程中参与物质和能量代谢、细胞生命活动和免疫调控。进一步分析发现TCONS_00020918可通过调控西方蜜蜂王浆主蛋白1编码基因在意蜂工蜂中肠的营养吸收、级型分化中发挥功能。DElncRNA的调控网络分析结果显示DElncRNA与mi RNA、m RNA间存在复杂的调控关系,部分DElncRNA处于调控网络的中心位置且能靶向结合较多的mi RNA,也有部分mi RNA可被多个DElncRNA共同靶向,表明这些DElncRNA可能在中肠发育中发挥重要作用。随机挑取5个DElncRNA进行RT-qPCR验证,结果显示它们的表达量变化趋势与测序结果一致,证实了本研究测序数据的可靠性。【结论】差异表达长链非编码RNA(DElncRNA)广泛参与意蜂工蜂中肠的新陈代谢、细胞活动和免疫调控并作为竞争性内源RNA(ce RNA)发挥作用,研究结果为关键lncRNA的筛选和功能研究提供了必要的数据支持。     

汉江上游纤毛虫群落结构及与环境理化因子的关系

【目的】研究汉江上游纤毛虫群落结构,为汉江上游水环境保护和水产养殖提供基础资料。【方法】在汉江上游汉中市境内的烈金坝、梁西渡、南柳渡、蒙家渡和黄金峡5个采样点,于2013年1,3,5,7,9,11月份分别采集10~20cm水样,统计各样点水体中的纤毛虫种类数、丰度、多样性指数(Id)和Pantle-Buck污生指数(Is),分析环境理化因子与纤毛虫群落参数之间的相关性。【结果】从5个采样点共鉴定到纤毛虫98种(包括6个未定名种),隶属于3纲12目39科45属。其中前口目、下毛目均为优势类群,膜口目、盾纤目为次优势类群,其余目为常见类群。从物种分布来看,黄金峡纤毛虫物种数最为丰富,为47种;其次为南柳渡,有45种,蒙家渡、梁西渡、烈金坝的物种数分别为43,41和35种;从各物种的相对丰度来看,汉江上游水体纤毛虫的优势种为毛板壳虫、钝漫游虫、钩刺斜管虫、食藻斜管虫、珍珠映毛虫、长圆膜袋虫、天蓝喇叭虫、叶绿尖毛虫和有肋楯纤虫,纤毛虫丰度为20 493~85 872个/L,多样性指数和Pantle-Buck污生指数分别为3.73~4.66和1.38~1.73。相关性分析表明,汉江上游水体纤毛虫的物种数与NH+3-N质量浓度呈显著正相关(P0.05);丰度与NH+3-N质量浓度、NO-3-N质量浓度呈显著正相关(P0.05),且与BOD5呈极显著正相关(P0.01);污生指数与NH+3-N质量浓度、NO-3-N质量浓度、CODcr及BOD5呈显著正相关(P0.05),但与DO呈极显著负相关(P0.01)。【结论】汉江上游水质自源头向下游呈现出"清洁-轻度污染-中等污染-轻度污染"的变化趋势,对汉江上游水体纤毛虫群落影响最大的环境理化因子是NH+3-N,其次是NO-3-N和BOD5,CODcr和DO的影响相对较小。     

广东韩江潮州段浮游植物群落结构特征与水质评价

为探究广东韩江潮州市饮用水源保护江段浮游植物群落结构特征及水质富营养化状况,于2019年2月至2020年1月在潮州段设立4个采样点,进行浮游植物调查和水质监测。结果表明,韩江潮州共鉴定出浮游植物8门103属290种,其中绿藻门42属99种,硅藻门21属87种,蓝藻门24属70种。全年有9个月的种类组成以硅藻门为绝对优势种,绿藻门仅在6、9、10月种类数多于硅藻门,表明该江段浮游植物组成为硅藻-绿藻型。浮游植物丰度月变化在0.83×10⁶～1.99×10⁶个/L,月均丰度为0.90×10⁶个/L,全年以硅藻门丰度最高,占47.01%。优势种11种,其中硅藻门5种,隐藻门4种,蓝藻门和裸藻门各1种,颗粒沟链藻(Melosira granulata)是绝对优势种。Shannon-Wiener多样性指数(H)为3.14～5.08,平均值4.40;Pielou均匀度指数(J)为0.69～0.99,平均值0.87;Margalef丰富度指数(D)为2.60～6.85,平均值5.08,表明水质为轻度污染。Cluster聚类和NMDS排...     

太阳活动与ENSO事件对汉江谷地旱涝灾害影响分析

为探究汉江谷地旱涝灾害发生机理,根据18个代表站点1960-2010年气象资料,运用Z指数法界定出旱涝灾害等级和年份后,分析太阳黑子活动和ENSO事件对汉江谷地旱涝灾害的关系。结果表明:1)研究时段内汉江谷地呈暖干化趋势,气温以0.136℃/10a的速度上升,降水以15.7mm/10a的速度减少,旱涝灾害的发生呈增加趋势。2)20世纪70-80年代旱涝灾害指数与太阳黑子数呈负相关,80年代后二者呈正相关,太阳黑子的减少趋势与研究区域干旱化趋势相同。3)厄尔尼诺强度增大时研究区域的涝灾增多,拉尼娜发生强度增大时旱灾增多。     

扬州市邗江区水稻穗稻瘟病发生特点及成因分析

稻瘟病是水稻三大病害之一,不同地区不同品种间发生程度有较大差异。通过对2014年扬州市邗江区水稻穗瘟病进行田间调查和解析,并对该病2014年在该地区的发生特点,偏重流行的成因进行分析,提出相应的防治措施。     

跨流域调水方案优选方法初步研究

以陕西省关中地区引汉济渭调水工程为例,采用层次分析和效用函数计算模型相结合的方案优选方法,计算该地区拟采用的三种调水方案的综合量比值。通过对三种方案评价结果分析发现,对国家南水北调中线调水工程影响最小,工程可实施性和经济性较好的调水方案综合量比值最大,为最佳调水方案。该结论与引汉济渭调水工程的初步推荐方案相一致。效用函数与层次分析法相结合的调水方案优选方法不但包含了评价系统所包含的数据信息,较好减免了人为因素对方案决策的影响,而且更能全面、客观地反映实际情况,因此,其是较为理想的跨流域调水方案优选方法。     

基于RS与GIS的韩江流域土地利用变化分析

利用地理信息系统(GIS)和遥感(RS)技术,结合数理统计等方法,定性定量分析了1986～2006年韩江流域土地利用的数量变化和特征.结果表明,韩江流域的城市化进程不断加快,主要表现为建设用地的快速增加和耕地的急剧减少,未利用地的迅速减少导致后备用地压力很大,区域土地利用变化速度属于快速变化型.研究结果对制定区域土地利用总体规划有重要的借鉴和指导作用.     

2001-2006年邗江稻区二化螟发生规律及其危害情况

根据2001-2006年扬州市邗江稻区二化螟调查测报资料,统计分析了该种群的发生规律及其危害情况。结果显示,6 a间整个稻区二化螟一、二代蛾盛发期多出现于5月中旬和7月下旬,蛾和卵高峰期具多峰现象;2001-2003年越冬残留和一代幼虫量及螟害率变化一致,其余3 a间一代和冬后残留幼虫量变化相反,仅与一代螟害率一致,其中2003年螟害发生最重。研究还表明,除去外源因素影响,二化螟冬后残留和一代幼虫量高低可评估当年螟害率及预测翌年该虫发生程度。     

邗江区公道镇实施秸秆还田的实践和思考

近几年来．邗江区公道镇围绕农业可持续发展，按照循环再生的要求，积极推广机械化秸秆还田和机插秧集成技术，在保护环境、改善土壤等方面取得了明显成效。     

川气东送管道站场ESD系统误触发原因及对策

紧急关断系统（ESD）是输气站场自动化系统的重要组成部分，其可靠性与设备自身、外部供电情况等因素有关。以近几年川气东送输气管道沿线站场ESD误触发事故为例，对川气东送管道沿线各输气站场ESD系统误触发事件进行整理、分析，得出ESD外部供电系统异常是ESD误触发的主要原因；从ESD系统上级供电、同级负载及下级负载等方面，对导致ESD系统误触发的设备因素、人为因素、设计因素进行分析，提出防范措施。将防范措施推广应用于川气东送各站场，验证了其能够明显提高ESD系统在应用过程中的可靠性。