16S rDNA序列分析法对香蕉根部内生细菌种群多样性初析

采用16S rDNA序列分析法对香蕉根部内生细菌种群多样性进行初步研究,随机选择12个阳性克隆测序。结果表明,该序列与未培养及可培养的芽孢杆菌、雷尔氏菌、伯克氏菌、戴尔福特菌、肠杆菌等细菌的序列同源性在97%～100%之间,说明香蕉根部存在大量未培养及可培养的内生细菌。     

采用16S rDNA片段鉴定鳗鲡病原菌的初步研究

初步探讨了采用16S rDNA片段鉴定鳗鲡病原菌的方法.根据已知细菌16S rDNA序列的高度保守区设计引物,利用PCR法扩增16株已鉴定的鳗鲡病原菌的16S rDNA片段,测序分析后,通过Gen-Bank数据库进行同源性检索,并构建相应的系统发育树.结果表明：16株鳗鲡病原菌均扩增到了400bp左右的基因片段,其中14株菌的16S rDNA片段序列与网上已发表的同属菌株的同源性为100%,其余2株为99%;8株病原菌被鉴定到种,分别属于嗜水气单胞菌和温和气单胞菌,其余8株被鉴定到属,分别属于气单胞菌属、假单胞菌属和肠杆菌属;鉴定结果与生化鉴定结果在属的分类单元上符合程度高达82%.     

多环芳烃厌氧降解菌的筛选与鉴定

[目的]筛选并鉴定多环芳烃厌氧降解茵。[方法]通过富集,在厌氧条件下从受焦油长期污染的土壤中筛选出多环芳烃的高效厌氧降解茵,并对其进行了生理生化试验和16SrDNA鉴定。[结果]从受焦油长期污染的土壤中分离出2株多环芳烃降解茵W2和Y3,经综合表征和16SrDNA序列分析,初步鉴定菌株W2为鞘氨醇单胞茵属（Sphingomonas sp．）,菌株Y3为芽孢杆菌属（Bacillussp．）。[结论]为多环芳烃的生物降解研究提供了理论依据。     

基于全基因组序列和E距离信息的CoxA16病毒亲缘关系分析

柯萨奇病毒A组16型(CoxsackievirusA16,CoxA16)病毒是引起手足口病(Hand,footandmouthdisease,HFMD)的主要病原体。为了解不同地区CoxA16病毒株的系统进化关系,收集了NCBI数据库中注释有具体地区分布的23条CoxA16全基因组序列,分别采用Kimura2-parameter法和E距离法对病毒株进行亲缘关系分析。结果表明,基于E距离的系统进化树最大程度地吻合了Kimura 2-parameter遗传距离法构建的系统进化树,且E距离法普适性较强,颇具应用潜力,为更精确地判断病毒株之间的进化关系提供了一条新途径。     

威海近海底泥中兼性厌氧菌的分离及鉴定

对威海近海底泥中兼性厌氧菌进行了分离和鉴定,分离得到7株不同种类的细菌:HY1、HY2、HY3、HY4、HY5、HY6、HY7。经Blast软件比对分析以及构建系统发育树,结果表明,HY7与Mi-crobacterium kitamiense的相似性达到99.79%,属于同一个种;而HY1、HY2、HY3、HY4、HY5、HY6与数据库中已明确鉴定种的最大同源性都小于95%,应该是潜在的新属新种,有待进一步鉴定。     

不同浓度的FBS和hLIF对小鼠原核期受精卵体外发育率的影响

通过在mM16培养液中添加不同浓度的FBS及hLIF,探讨小鼠原核期受精卵的体外培养条件,旨在建立稳定的小鼠原核期受精卵的体外培养系统。实验结果表明:在mM16中添加10%或15%的FBS都可降低胚胎在体外的发育率,其体外囊胚发育率与对照组mM16(未加血清组)差异显著(73.3%对32.6%;73.3%对35.8%);5001、0001、500 IU/ml 3种不同浓度的hLIF都可提高小鼠受精卵体外发育率,三者之间差异不显著,但以添加1 000 IU/ml hLIF组中,桑椹胚/囊胚率及囊胚脱出率为最高。结论:在mM16中添加血清不能有效地支持小鼠受精卵在体外的发育,添加1 000 IU/ml hLIF能够很好地支持小鼠受精卵的体外发育。     

不同密度油菜宁油16号摘薹试验研究

采用裂区设计,研究了不同种植密度下宁油16号油菜摘薹对产量、经济效益、生育进程及植株性状的影响。结果表明:1次摘薹后生育期推迟,一次分枝数和一次分枝角果数减少,二次分枝数和二次分枝角果数增加,三次分枝数和三次分枝角果少量出现。油菜籽产量略有减少,但总经济效益明显提高。2次摘薹后此现象更为明显。种植密度则以9.00万株/hm2最优。     

鼓槌石斛内生细菌分离、 鉴定及功能分析

为微生物农药和肥料生产提供菌种资源,用组织分离法从鼓槌石斛健康组织分离内生细菌,用对峙法和抑菌圈法筛选拮抗菌株;以平板法筛选解磷、解钾和固氮菌株;以田间试验检验固氮菌株的增产效果;用PCR扩增功能菌株的16S rDNA,结合菌株的菌体、菌落形态特征和部分生理生化特征,确定功能菌株分类地位。结果表明,从鼓槌石斛组织共分离到33株内生细菌,数量和种类为根〉茎〉叶;其中GB7属解淀粉芽孢杆菌（Bacillus amyloliquefaciens）,GB16属链霉菌（Streptomyces sp.）,GB8、GB9、GB21属芽孢杆菌（Bacillus spp.）,均有病害生防功能;GB2属不动杆菌（Acinetobacter calcoaceticus）,GB20属肠杆菌（Enterobacter sp.）,具解磷功能;菌株GB1属产酸克雷伯氏菌（Klebsiellaoxytoca）,具固氮功能。     

紫色土硅酸盐细菌的遗传多样性研究

硅酸盐细菌是土壤中一类能分解硅酸盐类矿物，破坏其晶格结构，使矿物钾转化成有效钾释放出来供植物生长的细菌。它不仅能溶磷解钾，亦有固氮的作用。目前的种类主要有，环状芽孢杆菌（Bacillus circulans）、胶质芽孢杆菌（B．rmtcilaginosus）和土壤芽孢杆菌（B．edaphicus）三个种的菌株。由于硅酸盐细菌的独特作用，已广泛应用于采矿、冶金、微生物肥料、饲料工业上。我国在硅酸盐细菌的生物学功能方面已进行了大量的工作，尤其是在硅酸盐细菌作为生物肥料方面，但是对硅酸盐细菌的分类地位和遗传多样性研究较少。贺积强等研究表明，紫色土硅酸盐细菌的理化性质和解磷解钾特性存在差异，本研究应用RAPD、TP-PCR和16S rRNA PCR-RFLP进一步分析了这些硅酸盐细菌的遗传多样性及系统发育地位，以期弄清其遗传背景。     

西藏拉果错卤虫线粒体DNA遗传多样性的研究

对西藏拉果错卤虫线粒体12S-16S rDNA片段进行了限制性片段长度多态性（RFLP）分析。对两个样本ARC1347和ARC1348分别分析了40和31个个体。应用PCR技术扩增了卤虫单个休眠卵的线粒体12S-16S rDNA，选用能识别四碱基的限制性内切酶Hpa Ⅱ、Nde Ⅱ、TaqⅠ和Hag Ⅲ对该基因片段进行RFLP分析。在两个样本中均各检测出5种单倍型，其中单倍型AAAA为两个群体所共有，并均以该单倍型为主，它的个体数所占的百分比在两个群体（ARC1347和ARC1348）中分别为85．0％和83．9％。ARC1347号样本各单倍型之间的平均遗传距离为0．0350，ARC1348号样本各单倍型间的平均遗传距离为0．0121；ARC1347和ARC1348样本的线粒体12S-16S rDNA的多态度（或称核苷酸多样性指数）π值分别为0．0052和0．0013。结果说明，西藏拉果错卤虫具有一定的群体内遗传多样性。