除臭菌株对NH_3和H_2S释放及物质转化的影响

将通过高温和氨水逐级驯化筛选的除臭菌株用于牛粪堆肥,研究其对NH3和H2S释放量及物质转化的影响。其中菌株B1与A1除臭效果最好,NH3总释放量较对照分别降低68.59%和61.00%,NH4＋-N仅增加4.47%和7.19%,NO3-N略有提高,而有机氮分别增加28.99%和27.42%,说明除臭菌株能将无机态氮转化为有机氮,使全氮含量提高19.81%和18.80%,有效地减少了氮素损失;H2S总释放量较对照分别降低89.69%和86.88%,硫酸盐增加40.77%和36.49%,说明菌株可有效促进H2S向硫酸盐转化,减少H2S挥发,使全硫含量提高29.05%和22.64%。相关分析显示NH3释放量与H2S释放量、pH呈极显著正相关,与全氮、有机氮和硫酸盐呈负相关;H2S释放量与pH呈显著正相关,而与全硫和硫酸盐呈负相关。添加与未添加除臭菌株的NH3和H2S释放量经方差分析差异达到显著水平,表明添加除臭菌株可有效地控制牛粪堆肥NH3和H2S释放,保留氮素和硫素养分。     

The under-recognized dominance of Verrucomicrobia in soil bacterial communities

Verrucomicrobia are ubiquitous in soil, but members of this bacterial phylum are thought to be present at low frequency in soil, with few studies focusing specifically on verrucomicrobial abundance, diversity, and distribution. Here we used barcoded pyrosequencing to analyze verrucomicrobial communities in surface soils collected across a range of biomes in Antarctica, Europe, and the Americas (112 samples), as well as soils collected from pits dug in a montane coniferous forest (69 samples). Data collected from surface horizons indicate that Verrucomicrobia average 23% of bacterial sequences, making them far more abundant than had been estimated. We show that this underestimation is likely due to primer bias, as many of the commonly used PCR primers appear to exclude verrucomicrobial 16S rRNA genes during amplification. Verrucomicrobia were detected in 180 out of 181 soils examined, with members of the class Spartobacteria dominating verrucomicrobial communities in nearly all biomes and soil depths. The relative abundance of Verrucomicrobia was highest in grasslands and in subsurface soil horizons, where they were often the dominant bacterial phylum. Although their ecology remains poorly understood, Verrucomicrobia appear to be dominant in many soil bacterial communities across the globe, making additional research on their ecology clearly necessary.     

木聚糖酶产生菌的筛选鉴定及木聚糖酶基因(Xyn B)的克隆

采用富集培养、透明圈平板筛选的方法,从长期堆放青贮饲料的土壤中分离到7株木聚糖酶产生菌。选取透明圈最大的木聚糖酶产生菌X7作为基础菌,对其进行16S rRNA部分序列PCR扩增测定,经BLAST同源性分析确定X7为枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis strain GD3b(Genebank编码:HM055602.1)。然后设计特异引物,以X7基因组为模板,对其进行Xyn B基因序列PCR扩增,扩增产物经BLAST同源性分析表明已成功克隆了X7菌株的Xyn B基因,为日后构建木聚糖酶基因酵母表达载体,培育能够分泌表达具有高活性的木聚糖酶酵母工程菌奠定了基础。     

蒙古羊Hoxc8基因甲基化与胸椎数量的关系

为了研究蒙古羊Hoxc8基因的甲基化与胸椎数的关系,试验采用亚硫酸氢盐测序PCR方法进行检测。结果表明:蒙古羊的14枚胸椎个体(T14)占26.1%,7枚腰椎个体(L7)占69.5%,其中Hoxc8 exon-1含27个CpG。T13型个体的甲基化CpG分别为6,3,6;T14型个体的甲基化CpG分别为23,20,21。T13和T14的甲基化比例平均值分别为(18.500±0.064)%和(79.030±0.056)%(P=0.002)。T14蒙古羊Hoxc8 exon-1的甲基化功能区(120～142个碱基)的CpG胞嘧啶全部甲基化,而T13则相反。说明蒙古羊Hoxc8 exon-1甲基化CpG的密度和数量影响Hoxc8基因的表达,并且调控胸椎的发育。     

1994—2009年我国部分地区37株鸡传染性支气管炎病毒S蛋白基因序列分析

对自1994—2009年从我国5省区免疫鸡群中分离到的37株传染性支气管炎病毒(IBV)的S蛋白基因序列进行分析,发现S1基因序列存在广泛的氨基酸替换、缺失和插入现象,大部分IBV分离株S1基因的推导氨基酸序列变异主要集中在60～63、73～74、97、128、282～299位等。S2基因较为保守,主要在裂解位点后的2～47、122～152位发生氨基酸的替换,可见IBV S基因的不断变异可能是造成本试验所调查的5省区免疫鸡群IB频发的重要原因。遗传进化分析发现本试验所调查地区近十多年来肾型毒株仍是主要流行株,没有或少有4/91型毒株流行。所调研地区鸡的腺胃炎持续广泛地发生,但是从临床腺胃病料中很少分离到IBV,可见IBV不太可能是引起腺胃炎的主要病原。     

广义3S技术在林业上的应用现状与发展趋势

为提高林业管理的技术水平,从广义3S技术的定义、基本组成出发,总结和论述当前广义3S技术在林业上(包括森林资源监测、灾害管理与防治、林业管理与决策等方面)的应用,提出广义3S技术在林业上应用的5个发展趋势,分别为:①从中、大尺度向小尺度发展;②从单一的GPS定位向集成的多技术全球定位系统发展;③从通用的GIS软件向专业的GIS应用软件过渡;④从单机模式向网络发展;⑤从PC台式机向掌上PDA发展.     

产志贺毒素多重耐药大肠杆菌噬菌体的生物学特性及全基因组分析

为探明大肠杆菌噬菌体的生物学特性和全基因组特征,本研究以在广西某猪场污水中分离得到的1株产志贺毒素且多重耐药的大肠杆菌GXEC010为宿主菌,同时在污水中分离到1株具有裂解作用的噬菌体,并通过透射电镜观察、最佳感染复数测定、一步生长曲线绘制、热敏感性与酸碱度稳定性评估、杀菌试验及全基因组测序等方法分析该噬菌体的生物学特性与基因组特征。结果表明,分离纯化得到能高效裂解大肠杆菌GXEC010的噬菌体,命名为vB_EcoM_BP10,其噬菌斑呈清晰透明,边缘光滑整齐;该噬菌体的最佳感染复数为1;一步生长曲线结果显示,感染宿主菌潜伏期为5 min,爆发期为65 min,爆发量为51;可耐受温度范围为30~60 ℃,在pH为5~8的环境中能维持稳定性;噬菌体杀菌试验结果显示,感染复数（MOI）为1时噬菌体vB_EcoM_BP10具有良好的杀菌效果。全基因组测序结果表明,噬菌体vB_EcoM_BP10基因组总片段长度为52 288 bp,GC含量为44.16%,含有71个阅读框（ORF）。GO功能注释表明,噬菌体vB_EcoM_BP10可参与小分子代谢、细胞氮化合物代谢等生物学过程中,具备核苷酸转移酶活性、离子结合、DNA结合等分子功能。与Escherichia phage ST32、 Enterobacteria phage phiEcoM-GJ1的亲缘关系较近。综上所述,噬菌体vB_EcoM_BP10具有清晰的宿主受体特异性,良好的热稳定性和酸碱稳定性,本研究结果能为有效防控产志贺毒素多重耐药大肠杆菌奠定一定的理论基础。     

冬夏两季畜禽废水的活性污泥中细菌遗传多态性研究

对冬夏两季膜生物器处理畜禽废水的效果进行研究,分析两季废水中细菌遗传多态性与废水处理效果的关系.直接提取废水中活性污泥总DNA,构建16S rDNA基因文库.选取两季各8个成功的阳性克隆子,分别采用Hinf Ⅰ、Hae Ⅲ、Alu Ⅰ、Msp Ⅰ 4种限制性内切酶消化重组质粒,电泳分别表现出不同谱型.结果表明,4种限制性酶中,Hinf Ⅰ的酶切图谱反应的遗传信息量最丰富.细菌遗传多态性Shannon-Wiener指数冬季为0.953,夏季为2.079,即夏季多态性高于冬季;根据出水水质监测,夏季处理效果优于冬季,与多态性指数呈正相关.     

亚硫酸氢盐测序法检测小鼠胚胎Oct4启动子区甲基化

应用亚硫酸氢盐测序技术,以昆明小白鼠几种不同时期体内胚为研究对象,对其单拷贝基因Oct4启动子区进行甲基化检测.基因组经低熔点琼脂糖包埋、亚硫酸氢盐修饰后,运用巢式PCR对处理后的DNA进行两轮扩增,扩增产物通过琼脂糖凝胶电泳检测和单克隆测序进行分析.结果表明,亚硫酸氢盐测序法是一项敏感而有效的DNA甲基化检测手段.