新发林麝环状类病毒的鉴定和分析

利用病毒宏基因组学(viral metagenomics)方法,本研究从95份林麝粪便样品中检测到1株新型圆环病毒样(Circovirus-like)病毒,经过拼接获得其全基因组序列,该毒株命名为ls-cyc.其基因组全长约3552 nt,GC含量39.00％,含有2个开放阅读框(ORF),即ORF1和ORF2.其中O...     

“千人基因组计划”发布高精度遗传变异图谱

由中、美、英等国共同发起的大型国际合作项目"千人基因组计划"的最新研究成果10月31日在《自然》杂志上在线发表。该协作组公布了高分辨率的人类基因组遗传变异整合图谱,将为基因组学在人类疾病与健康领域中的应用,以及个体化医疗时代的到来奠定坚实基础。"千人基因组计划"2008年年初由中国华大基因、英国桑格研究所及美国国立人类基因组研究所等机构共同发起,最终将对2500个体的基因组进行测序,绘制最详尽的人类基因多态性图谱,寻找基因与人类     

犬瘟热病毒弱毒和野毒的全基因组扩增及序列测定

分析比对了GenBank中已公布的23株犬瘟热病毒全基因组序列,针对保守区设计了11对特异性通用引物,用于扩增犬瘟热病毒野毒株和疫苗株全基因组。通过优化11对引物的工作浓度及退火温度等条件,对保存的3株疫苗毒CDV3株、OR12株、CDV/R-20/8株和2株野毒HBF-1株和SD(14)07株进行了全基因组扩增。取5μL扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,结果显示11对通用引物对以上5株犬瘟热病毒扩增后,均获得11个特异性目的片段,条带大小与预期相符。选取疫苗毒OR12株和野毒HBF-1株的进行全基因组序列测定,与GenBank中已公布的序列进行比对,同源性均大于99.0%,证实这11对特异性通用引物能够实现对犬瘟热病毒野毒和弱毒全基因组的准确扩增,并获得准确的全基因组序列。     

基因芯片技术在畜牧业中的应用

DNA芯片（DNA chip）技术是20世纪90年代中期以来影响最为深远的重大科技进展之一,是近年来生命科学与微电子学等学科相互交叉的一门高新技术.该技术通过设计不同的探针阵列,使用特定的分析方法可以具有多种不同的应用价值,如基因表达图谱测定、基因突变检测、基因多态性分析、基因组文库作图及杂交测序等,为＂后基因组计划＂时期基因功能的研究及现代医学发展提供了强有力的工具,将在新基因的发现、基因诊断、药物筛选、给药个性化方面取得重大突破.     

传染性法氏囊病病毒超强毒株HLJ-0504全基因组克隆及其新特征分析

为了解传染性法氏囊病病毒(IBDV)HLJ-0504株的分子生物学特征,本研究利用融合PCR技术获得HLJ-0504株全基因组序列。核苷酸和推导氨基酸序列遗传演化分析发现,HLJ-0504A节段位于IBDV超强毒的分枝上,而B节段则介于超强毒株和减毒株之间,形成一个独立分枝,属于一株新的自然重组病毒。VP2抗原性预测分析表明,HLJ-0504株VP2第Ⅰ亲水区中的氨基酸发生突变(D212N),该突变可能导致了HLJ-0504株抗原性发生漂变。本实验结果为深入研究IBDV的分子特征奠定了基础。     

黑山羊源大肠杆菌烈性噬菌体生物学特性及基因组分析

为分离到能有效裂解黑山羊源大肠杆菌的烈性噬菌体,本课题采集不同来源的新鲜粪便样品并经目的菌富集后,结合双层琼脂平板法进行噬菌体分离纯化,随后制作透射电镜样品进行其外形特征观察;对获得的噬菌体进行裂解谱、最佳感染复数和生长曲线分析;该噬菌体对温度、pH和紫外线的敏感性测定;该噬菌体全基因组测定与分析。结果表明,从黑山羊粪便中分离出的一株烈性噬菌体PLYYY01,在大肠杆菌菌苔形成1~2 mm的透亮噬菌斑;通过透射电镜观察,该噬菌体头部直径在60nm左右,尾部长度为100nm左右;该噬菌体有较宽的裂解谱(37.5%,6/16),可裂解多种血清型大肠杆菌;最佳感染复数是0.1;具有较强的繁殖活性,潜伏期约为30 min,爆发量约为95PFU/cell;在40℃~50℃、pH 5~10之间噬菌体的效价较为稳定,对紫外线不耐受;基因组测序组装结果显示:PLYYY01基因组长度为57025 bp,(G+C)mol%含量为44.74%,共编码71个蛋白,未发现抗生素耐药基因及毒力因子基因。     

新城疫强毒株体外诱导小鼠肝癌H22细胞凋亡的试验研究

新城疫病毒(NDV)是副黏病毒科腮腺炎病毒属的病毒,主要感染禽类,对人可引起发热等轻微症状。其基因组是约为15kb的单股负链RNA,NDV只有一个血清型。目前国外研究表明,NDV溶肿瘤株73     

DNA甲基化与基因组印记

综合论述了DNA甲基化与基因组印记的最新研究进展,论述了它们的生物学意义,并阐述了两者的关系.     

蛋白质组学和营养

在科学发展的长河中,几乎没有哪一个领域能像营养学样取得如此巨大和有价值的进展〔1〕。随着分子生物学、细分子学及细胞内传导系统的研究,我们对营养素、激素、细因子、炎症介质对细胞代谢的作用,以及细胞代谢的调控了更深入的认识〔2〕。20世纪90年代,人类基因组测序草完成。基因虽是遗传信息的源头,而功能性蛋白是基因功的执行体。基因组计划的实现固然为生物有机体全体基序列的确定、为未来生命科学研究奠定了坚实的基础,但它并不能提供认识各种生命活动直接的分子基础,其间必研究生命活动的执行体———蛋白质这一重要环节。因此,命科…     

对虾白斑综合征病毒的分子生物学研究进展

对虾白斑综合征(white spot syndrome，WSS)是由对虾白斑综合征病毒(WSSV)引起的以感染对虾甲壳内侧出现直径为0．5～2mm大小的白色斑点为主要特征的暴发性传染病。该病感染率和死亡率都极高，给养虾业造成了巨大的经济损失。WSSV具有广泛的宿主范围，在甲壳纲和昆虫纲动物中均有其敏感的宿主，以虾、蟹等十足目类为多。目前，普遍认为WSSV存在水平传播(经口感染或浸泡感染)及垂直传播两种传播途径。