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171.
FMDV OA/58病毒株VP1蛋白结构构建与B细胞抗原表位的预测 总被引:6,自引:6,他引:0
以口蹄疫病毒株OA/58 RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA,然后与pGEM-T easy载体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和EcoR Ⅰ酶切法鉴定.运用同源模建得到OA/58 VP1蛋白3D结构,并结合理化性质、亲水性、可塑性和免疫原性进行分析,预测OA/58 VP1的抗原表位.结果 OA/58 VP1存在多个潜在的抗原表位位点,可能的蛋白质抗原表位区域:2~11,15~35,38~50,77~88,90~107,121~125,131~135,140~149,154~163,169~175,178~189,197~213.应用同源模建得到的OA/58 VP1蛋白3D模型来预测其B细胞表位,为进一步研究OA/58 VP1功能,构建突变体和选择表达新型OA/58 VP1蛋白分子提供有参考价值的信息. 相似文献
172.
本实验用RHDV CD株人工感染家兔,发病死亡后,取肝脏匀浆,用Trizol试剂从匀浆上清中提取病毒RNA。根据Genbank已发表序列保守区设计并合成引物,采用RT—PCR方法扩增了RHDV衣壳蛋白VP60主要抗原表位基因。PCR产物纯化后,进行序列测定。测序结果表明,VP60主要抗原表位基因长525bp。该序列与已发表的其它13株RHDV VP60同一核苷酸序列及推导的氨基酸序列进行同源性比较。结果显示,CD株核酸序列与WX-84株同源性最高为97.5%,与其它毒株的同源性在92.0%~96.6%之间。氨基酸序列与WX-84株、墨西哥Mexico-89株同源性最高为99.4%,与其它毒株的同源性在96.6%~98.3%之间。 相似文献
173.
测土配方施肥包括三个环节,一是测土、二是配方、三是施肥。
一、测土:主要包括收集资料,确定取土单元,田间取土,GPS定位,晾晒研磨,土样检测(PH值、有机质、全氮、速效氮、速效磷、速效钾以及中微量元素)及数据的记载和整理。 相似文献
174.
以黑果枸杞(Lycium ruthenicum Murr.)种子为试验材料,研究不同浓度NaCl胁迫以及不同浓度24-表油菜素内酯(EBR)浸种对盐胁迫下黑果枸杞种子萌发情况,分析黑果枸杞种子发芽率、发芽势、发芽指数和相对盐害指数等指标,以期筛选出合适EBR应用于生产实践中。结果研究表明:低浓度的NaCl胁迫能促进黑果枸杞种子的萌发,但高浓度的处理则具有抑制作用。NaCl胁迫下,经不同浓度的EBR浸种处理后,萌发指标均有所提高;适当浓度EBR浸种可以促进盐胁迫下黑果枸杞种子的萌发。但高浓度时可能抑制其萌发;当EBR浓度为0.05 mg/L时,对促进黑果枸杞种子萌发效果最为明显。 相似文献
175.
据历年资料记载,金秀瑶族自治县1994年末牛的存栏数为24 038头,其中黄牛8 973头,水牛15 065头,能繁牛12 734头,出栏为3 466头;2003年末牛的存栏数为11 525头,其中黄牛3 589头(1 731),水牛7 936 头(3 039),能繁牛4 740头,出栏为5 640头.可见近10年来,金秀养牛业呈现倒退现象. 相似文献
176.
177.
叶片是植物与外界接触的主要器官,从4个杨桃品种的叶片的角质层纹饰、表皮毛和气孔器类型等进行对比分析,为良种鉴定及种苗繁育提供依据。 相似文献
178.
179.
【目的】了解广东省某猪群中猪圆环病毒 2 型(Porcine circovirus type 2,PCV2)流行毒株的遗传进化情况,丰富 PCV2 分子流行病学数据,为当地 PCV2 疫苗候选株的选用和研发提供参考。【方法】使用 qPCR 方法对疑似 PCV2 的样品进行检测,发现 1 株具有高病毒载量的 PCV2 毒株,命名为 GD222858。通过 PCR 方法进行全基因组分子克隆及遗传进化分析。使用 MegAlign 软件将该毒株 ORF1、ORF2 基因编码的氨基酸序列与 PCV2 同亚型参考毒株进行比对,分析氨基酸序列的相似性;采用 DNAStar 预测该毒株的 Cap 蛋白二级结构及 B 细胞表位,并与 4 株疫苗株 DBN-SX07-2(HM641752)、LG(HM038034)、SH(HM038027)、ZJ(AY686764)的 Cap 蛋白抗原指数进行比对分析。【结果】GD222858 毒株基因组长度为 1 767 bp。遗传进化分析表明该毒株属于 PCV2d 亚型。与国内外 82 株参考毒株的核苷酸相似性为 91.4%~99.6%,与越南毒株 Han8(GenBank 登录号:JQ181600)的亲缘关系最近。在 ORF1 编码的 Rep 蛋白处发现多个特异性突变位点 F70Y、F77L、W202R、N256S;ORF2 编码的Cap 蛋白相对保守。Protean 预测 Cap 蛋白的氨基酸第 5~18、24~25、39~41、48~49、57~65、99、101、112~114、139~140、145~150、162~165、175~181、188~189、205~211、227~232 位 置 处 均 可 能 存 在 潜 在 的 B 细 胞 表 位。GD222858 毒株的 Cap 蛋白抗原指数与 4 株疫苗株均有差异,在氨基酸 45~57、124~132、223~233 位置处抗原指数明显高于 4 株疫苗株,且与疫苗株 HM038034 差异最大。【结论】GD222858 毒株感染猪群的原因可能是 Rep 蛋白多个位点发生特异性突变及疫苗株选用不当所致。 相似文献
180.