松材线虫黄素单加氧酶家族基因结构与表达模式分析

黄素单加氧酶（flavin-containing monooxygenases, FMOs）是一类广泛存在于植物、动物、微生物中，主要参与调控生物体对内源性及外源性物质代谢的生物酶家族。为探究松材线虫FMOs(Bursaphelenchus xylophilus FMOs, BxFMOs)在宿主中定殖和响应杀线剂胁迫过程中所发挥的功能，本研究首先通过生物信息学手段从松材线虫基因组中筛选并鉴定了13个BxFMOs家族基因，随后对获得的BxFMOs家族基因进行理化特性、进化发育、蛋白结构及基因表达模式分析。结果表明：BxFMOs家族成员分布于5条染色体上，氨基酸数目为432～572个，分子量为49.77～66.09 kDa，等电点为6.26～9.27，其结构较为保守。基因表达模式分析揭示，BxFMOs家族对松材线虫定殖和响应杀线剂胁迫具有显著影响。本研究对探索松材线虫在宿主中的定殖机制和寻求防治松材线虫分子靶标具有重要的指导意义和理论价值。     

猪DDX家族成员基因结构与表达特性分析

为了系统研究DDX解旋酶家族成员在猪生长发育中的作用，试验采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR检验技术，对猪DDX家族的42个成员的基因结构、理化性质、功能结构域、聚类进化树、GO功能，以及在大白猪和马身猪盲肠组织中的表达情况进行了研究。结果表明：猪DDX家族除DDX28和DDX53基因没有内含子外，其他成员均含有外显子和内含子，且外显子平均数量为16个，内含子平均数量为15个。除8号染色体外，其他染色体上均有猪DDX家族成员分布。该家族成员均为疏水蛋白并且大多数不稳定，具有多个亚细胞定位，整体来看主要分布于细胞核中。猪DDX家族成员共预测到了15个保守基序，其中DDX1、DDX11、DDX19B、DDX26、DDX36、DDX39A、DDX58和DDX60基因缺失D-E-A-D保守基序，有10个保守基序出现在超过30个成员的序列中，同时不同成员有相同的基序类型和特定的基序排列顺序。聚类分析将猪DDX家族42个成员分为6大簇，其中DDX2和DDX48、DDX21和DDX50、DDX43和DDX53、DDX5和DDX17具有高度同源性，支持率为100%。该家族大多数成员具有ATP依赖性...     

多花黄精ACY1基因家族鉴定及其表达分析

【目的】筛选鉴定多花黄精中氨基酰化酶（aminoacylase 1,ACY1）基因，为多花黄精抗逆基因功能研究奠定基础。【方法】基于多花黄精转录组数据，对多花黄精氨基酰化酶（PcACY1）基因家族进行鉴定，分析基本理化性质、基因结构、保守基序、进化关系等，并采用qRT-PCR验证ACY1家族成员在不同组织器官中和盐胁迫处理下的表达模式。【结果】多花黄精ACY1家族有2个成员，均为亲水蛋白，具有信号肽，无跨膜结构，亚细胞定位预测结果显示2个成员均定位于细胞质中。与植物其他物种ACY1构建进化树发现，其进化特性可分为2类。植物ACY1启动子顺式作用元件预测结果显示，ACY1存在多种激素、胁迫和生长发育相关的响应元件。qRT-PCR分析结果显示，PcACY1成员在多花黄精不同组织器官中的表达水平差异较大且受盐胁迫诱导。【结论】PcACY1在多花黄精生长发育和抵御逆境过程中可能发挥重要作用，这为进一步研究多花黄精ACY1的功能及遗传改良等奠定基础。     

硼对大白菜谷氨酰胺合成酶家族基因影响研究

大白菜(Brassica pekinensis(Lour.) Rupr.)对硼的需求量较高且对低硼胁迫很敏感，常出现硼缺乏症.目前国内外对硼调控蔬菜风味品质的研究较为缺乏.采用盆栽试验研究了不同硼肥用量对大白菜生长发育、风味以及谷氨酰胺合成酶(Glutamine Synthetase, GLN)家族基因表达的影响，初步探讨了硼对大白菜风味品质的调控机理.结果显示，施用硼肥提高了大白菜必需氨基酸占氨基酸总量的比例.主成分分析表明，蛋氨酸和半胱氨酸是大白菜的第一限制氨基酸，鲜味氨基酸中的天门冬氨酸和谷氨酸对大白菜风味贡献最大.施用硼肥后大白菜根GLN1.2和GLN2的表达量上调，GLN1.1和GLN1.4的表达量下调.‘华良早5号’叶柄GLN1.1和GLN1.4的表达量上调，‘脆甜白2号’叶柄GLN2表达量上调，GLN1.2表达量下调；叶片GLN家族基因表达量总体上调.大白菜地上部半胱氨酸质量分数与叶柄GLN1.4极显著正相关，酪氨酸质量分数与叶片GLN1.4显著负相关.不同大白菜品种对高硼的耐受能力存在差异，‘脆甜白2号’对高硼的耐受能力强于‘华良早5号’.     

玉米GLR家族基因的鉴定与分析

利用生物信息学方法鉴定玉米自交系B73基因组中的全部GLR家族基因,共有16个成员,并对其进行系统分析.多重序列对比结果表明,玉米GLR家族具有较高的保守性,包含两个谷氨酸受体结合区(GlnH1和GlnH2)和4个跨膜区域(M1、M2、M3、M4).系统进化树分析结果表明,玉米GLR家族可分为两大类ZmGLRⅡ和ZmG...