Genome-wide search for segregation distortion loci associated with the expression of complex traits in Populus tomentosa

Segregation distortion of molecular markers has been reported in a broad range of organisms. It has been detected in an interspecific BC1 Populus pedigree established by controlled crossing between clone “LM50” (Populus tomentosa) and its hybrid clone “TB01” (P. tomentosa×P. bolleana). The study with a total of 150 AFLP markers (approximately 18.9% of the total loci) exhibited significant deviation from the Mendelian ratio (1:1) (p<0.01). Twenty-five percent of the markers were mapped on the pa-rental specific genetic linkage maps of clones “LM50” and “TB01” with a pseudo-test-cross mapping strategy. Twelve linkage groups had markers with skewed segregation ratios, but the major regions were on linkage groups TLG2, TLG4 and TLG6 in the linkage map of clone “LM50”. We also analyzed the association between distorted loci and expression of complex traits with Map-maker/QTL software. A total of 16 putative QTLs affecting 12 traits were identified in the distorted regions on seven linkage groups. Therefore we could detect the distribution of skewed loci along the entire genome and identify the association between quantitative traits and segregation loci via genetic mapping in an interspecific BC1 P. tomentosa family. Furthermore, the genetic nature and pos-sible causes of these segregation distortions for differentiation between female and male parents were also discussed.     

猪的PGD MOS HXB基因位点的PCR—SSCP分析

PCR－SSCPS即聚合酶链一单链构型多态性（PCR－SingleStrandC0nformatlonPolmporph；sins，SSCPS），它是通过DNA单链内部构型的变化来检测DNA序列变化的，所检测的突变点不仅仅限于酶切位点，检测的灵敏度也较高，并且不需任何特殊仪器，因而应用前景较为广阔。本文所研究的三     

牛消化道Ⅰ型肽载体克隆测序及编码蛋白结构分析

从牛瓣胃上皮提取RNA,根据已知的人、鼠、兔、羊PepT1序列设计引物,PCR扩增目的片段cDNA,扩增产物经纯化、克隆后测序.克隆测序片段为1566 bp(DQ309694),与其它动物已知PepT1序列比对,发现该片段位于第3～10跨膜结构域之间.牛测定序列与人、鼠、兔、羊、狗、鸡和猪PepT1相应片段核苷酸序列同源性分别为82.89%、80.14%、78.93%、96.04%、83.08%、63.90%和85.66%,相应片段氨基酸序列同源性分别为81.45%,79.62%、76.25%、94.06%、81.49%、61.41%和83.56%.对8种动物(牛、人、鼠、兔、羊、狗、鸡、猪)测序片段内氨基酸序列同源性分析表明,PepT1是高度保守的蛋白,其中跨膜结构域的氨基酸序列保守性高于膜外环.8种动物PepTl测序片段内各跨膜结构域的氨基酸序列同源性均在90%以上,第3、4、 5 6、7,8,9和10跨膜结构域的氨基酸序列同源性分别为90.97%、91.07%、97.62%、93.45%、94.05%、91.67%、91.45%和95.83%.8种动物测序片段内膜外环的氨基酸序列同源性在70%～99%之间,以第4-5跨膜结构域之间膜外环的同源性最高,9-10跨膜结构域之间膜外环的同源性最低,3-4、4-5、5-6,6-7、7-8、8-9、9-10跨膜结构域之间膜外环的氨基酸序列同源性分别为77.63%、98.86%、86.72%、90.13%、91.25%、88.33%和71.74%.9-10结构域之间是1个位于细胞外的大膜外环,可能对底物的识别有重要作用,牛在此区域与鸡相同区域的氨基酸序列同源性仅为29.3%,与大鼠,狗、人、兔、猪和羊相应序列的同源性依次为65.17%、71.64%、67.16%、60.20%、73.13%和88.56%.对测序BPepT1片段编码蛋白的糖基化和磷酸化位点分析表明,测序片段编码蛋白共有6个N-糖基化位点和3个蛋白激酶C依赖性(PKC)磷酸化位点.     

Hapseeker:一个分析单倍型的C++程序(英文)

The C++ program: Hapseeker was developed to analyze DNA or RNA sequence, besides, Hapseeker could be used to identify haplotype, calculate frequency of each haplotype as well as find variable site quickly. Moreover, Hapseeker had many advantages such as simple operation, rapid running speed and high accuracy.     

禽流感病0毒血凝素保守氨基酸对其受体结合位点的影响

采用PCR定点突变技术,对H5N1亚型禽流感病毒的血凝素HA基因受体结合位点相关的保守氨基酸分别进行以下位点的定点突变:35位K→R、45位D→N、98位Y→F、193位K→R和267位A→T,构建突变表达载体pCI-HA,转染293T细胞进行瞬时表达.流式细胞检测结果显示:193位K→R的突变体的HA的表达显著增加;98位Y→F突变体的HA的表达受到显著抑制.同时,血球吸附试验表明,同→HA突变体吸附鸡红细胞和马红细胞时,显示出不同的红细胞吸附能力.因此,受体结合位点相关的193位和98位的保守氨基酸不仅对受体结合位点结构域的形成有影响,它们还在决定AIV感染的宿主特异性中具有重要的作用.     

俄罗斯小麦蚜虫抗性基因的分子图谱和等位基因关系

俄罗斯小麦蚜虫（RWA）是一种世界性的小麦害虫。虽然应用抗虫小麦能很好地防治俄罗斯小麦蚜虫，但是继续利用蚜虫抗性基因的关键是开展遗传鉴定工作。本研究旨在弄清俄罗斯小麦蚜虫抗性基因Dn1、Dn2、Dn4、Dn5、Dn6、Dnx和几个未鉴定Dn基因的染色体位点和遗传关系。     

林木遗传图谱构建和数量性状基因定位

本文简要介绍了９０年代以来利用ＲＦＬＰ和ＲＡＰＤ分子标记的构建林木的遗传连锁图谱，并应用高密度的遣传连锁图谱上的分子标记进行林木重要数量性状的ＱＴＬ作图，进而阐明了控制多基因的数目，确定ＱＴＬ在染色体上的位置，测定单个基因的作用效应，遗传连锁图谱构建和数量性状基因定位预示林木遗传育种研究将产生深刻的变革。     

PCV2 Rep蛋白N-糖基化位点突变对病毒复制的影响

N-糖基化对病毒的感染与增殖均具有重要作用,与PCV2复制相关的Rep蛋白含有三个N-糖基化位点。为了分析PCV2Rep蛋白N-糖基化位点突变对病毒复制的影响,本试验构建了三个双拷贝突变体感染性克隆2M23、2M256、2M286,并成功拯救病毒。通过间接免疫荧光检测病毒的拯救效果,TCID50测定病毒的感染力,荧光定量PCR检测细胞病毒的载量。结果显示,PCV2Rep蛋白的23~25aa、256~258aa N-糖基化位点突变后降低病毒的复制能力,而286~288aa突变后增强病毒的复制能力,为进一步阐明PCV2的复制及致病机制提供参考。     

DNA甲基化标记及其在猪生产上的研究进展

<正>表观遗传学是在不影响DNA序列变化的前提下,而发生的可遗传基因表达的变化[1]。DNA甲基化是重要的表观遗传学现象之一,它的主要作用是通过与转录因子相互作用或者改变染色质的结构来抑制基因的表达[2],启动子区和转录起始位点的DNA的甲基化作用尤其突出,DNA甲基化参与生命体活动的很多过程,目前检测DNA甲基化     

池蝶蚌与三角帆蚌种群的遗传变异分析

采用不连续聚丙烯酰胺垂直板电泳技术和特异性染色方法,对池蝶蚌和三角帆蚌两个种群的4个年龄段和4种组织(外套膜、闭壳肌、肝脏和鳃)中的两种同工酶(EST、MDH)进行分析。结果表明,这两种贝类的同工酶具有明显的组织特异性,且三角帆蚌种群的遗传多样性较池蝶蚌种群丰富。