不同栽培及发育期对大豆根系RNA提取效果的影响

[目的]探讨从不同栽培条件下大豆不同发育期根系中提取RNA的最佳效果以及水浸处理对提取效果的影响。[方法]以吉农18为材料,分别采用沙质和土质栽培大豆至不同发育时期,根系取样,并采用RNAiso Reagent试剂盒提取根系总RNA,用2%的变性琼脂糖凝胶电泳及紫外分光光度计检测RNA样品的完整性及纯度。[结果]不同栽培基质条件下大豆根部同一发育期在沙质栽培条件下提取总RNA的效果优于土质栽培,水浸处理后的样品优于处理前。[结论]水浸处理后所提取的大豆根系RNA质量较高,能满足基因克隆和基因表达分析的要求。     

山药叶片总RNA提取方法的比较

[目的]提取高质量的山药叶片总RNA。[方法]以山药叶片为材料,采用异硫氰酸胍法、改良CTAB法提取山药叶片总RNA并进行比较分析,利用琼脂糖凝胶电泳分析所提RNA的完整性,并用紫外分光光度计分析RNA的纯度。[结果]改良CTAB法提取的总RNA的28S、18SrRNA条带清晰、整齐,测得A260/A280为1.72.0。[结论]改良的CTAB法适合山药叶片总RNA提取。     

遗传算法在RNA二级结构预测中的应用

介绍了几类遗传算法在RNA二级结构预测中的应用,并探讨该领域进一步的研究方向。     

高等植物线粒体基因组研究进展

高等植物线粒体基因组在目前已知生物中是最大、最复杂的, 阐述了高等植物线粒体基因组的最新研究进展。从全基因组的测序方法开始,重点介绍了高等植物线粒体基因组的组成和结构特点,特别是基因含量、内含子、基因间隔序列、RNA编辑、重复序列、叶绿体和细胞核与线粒体之间的DNA交换以及线粒体基因的遗传起源和进化等热点问题,以期为更好的了解核质互作、植物进化等科学问题奠定基础。     

2种提取椰子树RNA方法的比较研究

椰子树组织中富含多糖和酚类化合物,为了获取高质量的RNA,笔者以椰子树叶片和根部为材料,比较分析CTAB法和SDS法提取RNA的效果。结果表明：CTAB法提取椰子树组织的总RNA效果较好,能有效克服酚类物质和多糖对RNA提取的影响。经OD值检测和电泳检测,总RNA的28 S和18 S条带清晰可见,纯度较高,完整性好,无明显降解,以此RNA为模板进行RT-PCR反应,能获得特异条带,表明该RNA完全可以用于后续的分子生物学操作。     

2种微藻总RNA提取方法的比较

以微茫藻和莱茵衣藻为材料,比较Trizol试剂法和SDS-LiCl沉淀法提取2种微藻总RNA的效果,以期筛选出适合微藻RNA的提取方法。结果表明,SDS-LiCl沉淀法能从微茫藻中提取高质量的RNA,而Trizol法和SDS-LiCl沉淀法均能从莱茵衣藻中获得高质量的RNA,但Trizol法更为简单有效。RT-PCR结果表明,SDS-LiCl沉淀法提取的微茫藻总RNA和Trizol法提取的莱茵衣藻总RNA都能直接用于分子克隆和基因表达分析等分子生物学实验。     

蝴蝶兰ACC氧化酶和ACC合成酶融合反义表达载体的构建

为了获得具有超常花期的蝴蝶兰新品系,根据已报道的蝴蝶兰ACC合成酶(ACS)基因和ACC氧化酶(ACO)基因的序列,设计引物从蝴蝶兰总RNA中克隆出ACS保守区的461 bp片段和ACO的333 bp片段,完成2个基因的克隆和测序后,将ACS基因片段和ACO基因片段以反义的方向插入到中间载体pBI221 CaMV启动子...     

Effect of specific hTERT RNA interference on biological characteristics of colon carcinoma in vivo and in vitro

AIM: To investigate the effect of specific hTERT RNA interference on biological characteristics of colon carcinoma in vivo and in vitro. METHODS: A small interference RNA (siRNA) targeting to hTERT mRNA (pU6-hTERT-siRNA) was constructed. The siRNA was transfected into LoVo colon cancer cells in vivo and in vitro with Lipofectamine^TM2000. The groups of non-specific siRNA (pU6-hTERT) and non-treatment were designed as negative control and blank control,respectively. The cell growth in vitro was detected by MTT method. The effect of pU6-hTERT-siRNA on xenografts in nude mice was observed by determining the tumor size. The mRNA expression of hTERT in vitro and in vivo was detected by FQ-PCR quantitatively. The protein level of hTERT was determined by Western blotting. RESULTS: The inhibition rate of cell growth in vitro 72 h after transfection with recombinant plasmids containing hTERT-target sequences was 42.1%, significantly higher than that in control group (3.2%, P<0.01). The size of xenografts in pU6-hTERT-siRNA group was (85.9±18.7)mm³, significantly smaller than that in control group and blank group , P<0.01. The mRNA expression and the protein level of hTERT were both specifically inhibited by pU6-hTERT-siRNAs in LoVo colon cancer cells and xenografts (P<0.01). No difference between control group and blank group was observed (P>0.05).CONCLUSION: hTERT expression in LoVo colon cancer cells is inhibited significantly in vivo and in vitro by using plasmid-based siRNA. Down-regulation of hTERT expression distinctly inhibits the growth of LoVo colon cancer cells in vitro or subcutaneously transplanted in athymic mice.     

紫花苜蓿LEA蛋白基因ihpRNA表达载体构建及烟草转化

根据紫花苜蓿LEA蛋白MsLEA3-1基因(GenBank登录号： EU665182)序列,设计两对含有酶切位点的特异性引物LEAf1/ LEAf2和LEAr1/ LEAr2,以构建好的PMD-LEA质粒为模板,分别合成用于构建干扰载体的正反义片段pMD-F和pMD-R,将正反义片段分别插入表达载体pART27的相应位置,构建成含有发夹结构的RNAi载体pART-F-R,经过Not I酶切鉴定,证明载体构建成功。通过农杆菌介导的方法,以干扰表达载体pART-F-R转化烟草,经过PCR检测,得到16株阳性转基因植株,为MsLEA3-1基因的功能研究奠定基础。     

库尔勒香梨9个新miRNA克隆鉴定

利用在小RNA高通量测序试验中筛选出的脱萼组与宿萼组差异表达新miRNA基因,采用 Stem-loop法对总体表达量居前20位、在脱萼组和宿萼组中具有显著性差异表达、在子房和萼片组织中具有显著性差异表达的新miRNA进行成熟体的克隆鉴定、前体序列二级结构分析、qRT-PCR试验以及靶基因预测。结果显示,在不同的样本中有9个新miRNA（novel_miRNA）的成熟体序列以及4个novel_miRNA的表达量与高通量测序结果完全一致,并且预测得到大量具有生物学功能的靶基因。新发现的miRNA可能与‘库尔勒香梨’萼片脱落和宿存有密切关系。