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小麦蓝矮植原体免疫膜蛋白(Imp)基因的克隆和分子特性分析 总被引:2,自引:0,他引:2
【目的】探讨小麦蓝矮植原体免疫膜蛋白在介体-病原-寄主互作的分子机理。【方法】通过植原体免疫膜蛋白基因序列两侧的保守区设计引物对Imp 1051/Imp 2265,用PCR方法扩增小麦蓝矮植原体免疫膜蛋白基因;对扩增片段的最大开放阅读框和基因的同源矩阵、系统发育树分析;对克隆基因所编码蛋白进行跨膜区、亲疏水区和前导信号序列分析。【结果】从小麦蓝矮病病株和接种长春花中均扩增到约1.0 kb的特异片段,其中小麦蓝矮植原体免疫膜蛋白基因长495 bp,推导的编码蛋白含有164个氨基酸。与10种植原体的免疫膜蛋白基因进行序列同源性分析,小麦蓝矮与三叶草绿变植原体同源性最高,核苷酸和编码的氨基酸序列的同源率分别为98.4%和95.1%。蛋白质结构分析结果表明:小麦蓝矮免疫膜蛋白N端有一个跨膜的前导信号序列,C端为跨膜锚定区,中间为膜外亲水区。【结论】小麦蓝矮植原体与三叶草绿变、翠菊黄化、洋葱黄化和泡桐丛枝植原体的免疫膜蛋白为同型蛋白。 相似文献
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嗜肾型鸡传染性支气管炎病毒W93疫苗株S1基因的克隆与序列测定 总被引:1,自引:0,他引:1
根据国外已发表的鸡传染性支气管炎病毒(IBV)S1基因序列,设计了两对引物并以RT-PCR特异性扩增出嗜肾型IBV W93疫苗株的S1基因,基因产物大小为1.62kb,与设计相符,对其进行序列测定后,与标准毒株H52、H120、M41、BEAU株的S1基因进行同源性比较,结果表明,W93株与H52、H120、M41和BEAU株的核苷酸序列的同源性分别为96.8%、97.1%、96.9%和96.8%,由此可以看出嗜肾型IBV W93疫苗株与标准毒株在S1基因上具有高度的同源性。 相似文献
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鉴定了致病性差异明显的6个大豆花叶病毒分离物,对这些分离物外壳蛋白(CP)基因进行了测序。6个分离物CP基因全长均为795bp,推测的CP全长均为265个氨基酸残基。序列同源性比较表明,症状反应相同的各SMV分离物间,CP基因核苷酸和推测的氨基酸序列同源性分别为98.2%~99.6%、99.6%~100.0%;而症状反应不同的分离物间,CP基因核苷酸和推测的氨基酸序列同源性分别为90.4%~96.7%和97.7%~99.6%。结果显示,致病范围相近的分离物,序列同源性较高。 相似文献
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将烟曲霉的一种胞外脱乙酰几丁质酶(AF CSN)纯化,并测定该酶N-端氨基酸的序列。用此序列推测的寡核苷酸引物扩增得到脱乙酰几丁质酶(csn)的cDNA,其全长为804bp,编码一种251个氨基酸的单肽,对csn的序列比较分析表明,它与茄病镰刀菌在两个区域具有同源性,这两个区域分别有重复天冬氨酸及苏氨酸残基,这说明它与细菌具有相同的演化起源。cns与已知的细菌脱乙酰几丁质酶没有同源性,Southern杂交分析显示,cns在烟曲霉基因组中的单拷贝的。用质粒栽体pET28a(t),csn cDNA被导入E.coli中得到csn的融合蛋白,在IPTG诱导下,E.coli细胞中可获得大量的约28kDa的成熟蛋白。 相似文献
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以平凉市蔬菜产地为研究区域,于2004—2011年抽取土壤样品147点(次),测定重金属As、Hg、Pb、Cr、Cd的含量。以甘肃省主要农业土壤环境地球化学背景值为参考标准,应用地累积指数法划分出不同土类样点土壤重金属累积程度,结果只有1个样点的综合地累积指数达到1级,属轻度累积,其余146个样点综合地累积指数均小于零,属无累积状态,说明平凉市菜田土壤重金属累积总体上处于安全水平。对147个样点(次)土壤的5种重金属含量的相关性进行了分析,表明Hg与其它元素之间无相关关系,与其它重金属不同源,累积过程和来源途径是单独和独立的;Cd与Cr也没有相关性,累积过程和来源途径不同源;其余重金属之间累积过程和来源途径存在高度的同源性。 相似文献
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半夏凝集素基因的克隆及转基因烟草对蚜虫的抑制作用 总被引:1,自引:0,他引:1
采用同源序列克隆方法,通过设计特异性引物从甘肃西和半夏叶片基因组DNA中克隆到1条1 069 bp的半夏凝集素基因pta,与以同科内植物的mRNA为模板扩增得到的凝集素基因序列的同源性很高,达到98%以上,功能区完整,具有1条信号肽和3个甘露糖结合区,GenBank登录号AY725425。用该基因替换pBI121载体的GUS基因,正向插入35S启动子之下,构建了植物表达载体pBI-pta。通过农杆菌介导法转化烟草,从20株Kan抗性植株中得到PCR检测阳性植株14株,证明pta已整合到烟草基因组中。对随机挑取的7株PCR阳性植株进行了抗蚜虫(Myzus persicae)筛选试验,结果表明:不同株系蚜口密度抑制率在22.5%~89.4%,平均蚜口密度抑制率56.2%。 相似文献
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为寻找对亚硝酸盐具有高效降解能力、稳定和安全的优良菌株,采用亚硝酸盐氧化细菌(Nitrite-oxidizing bacteria,NOB)富集、分离技术从湖州某水域淤泥中分离得到一株纯培养菌株N3。提取细菌的总DNA,利用细菌16S rDNA特异性引物进行多聚酶链反应(PCR)扩增;扩增产物经琼脂糖凝胶电泳和Sanger末端终止法测序分析,用NCBI-Blast软件将测序结果在Genbank等数据库中进行同源性检索。结果表明,N3的DNA扩增产物片断大小为1441bp,测序结果经检索证实N3与标准菌株Cellulosimicrobium cellulans(AY665978.1)16S rDNA保守性片段有100%的同源性,可以判定所分离得到的N3菌株为纤维单胞菌属的纤维化纤维单胞菌(Cellulosimicrobium cellulans)。 相似文献
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Background: Pregnancy associated glycoproteins form a diverse family of glycoproteins that are variably expressed at different stages of gestation. They are probably involved in immunosuppression of the dam against the feto- maternal placentome. The presence of the products of binucleate cells in maternal circulation has also been correlated with placentogenesis and placental re-modeling. The exact structure and function of the gene product is unknown due to limitations on obtaining purified pregnancy associated glycoprotein preparations. Results: Our study describes an in silico derived 3D model for bubaline pregnancy associated glycoprotein 2. Structure-activity features of the protein were characterized, and functional studies predict bubaline pregnancy associated glycoprotein 2 as an inducible, extra-cellular, non-essential, N-glycosylated, aspartic pro-endopeptidase that is involved in down-regulation of complement pathway and immunity during pregnancy. The protein is also predicted to be involved in nutritional processes, and apoptotic processes underlying fetal morphogenesis and re- modeling of feto-maternal tissues. Conclusion: The structural and functional annotation of buPAG2 shall allow the designing of mutants and inhibitors for dissection of the exact physiological role of the protein. 相似文献
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