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991.
992.
猪源大肠杆菌耐药性与I型整合子关系研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的为了解猪源大肠杆菌中I型整合子的流行情况,探讨I型整合子与大肠杆菌耐药表型的相关性。方法采用微量肉汤稀释法测定119株猪源大肠杆菌对8类14种抗菌药物的耐药性,并采用PCR法检测猪源大肠杆菌I型整合酶基因(int11)并扩增其可变区,对PCR产物进行酶切分析,测序分析整合子可变区携带的耐药基因盒。结果119株大肠杆菌耐药现象十分严重,对四环素、磺胺异恶唑、新诺明全部耐药,所有菌株均呈多重耐药。119株猪源大肠杆菌中有92株含I型整合子,检出率77.31%。扩增出7类大小不同的基因盒插入区片段,范围为1008bp-3149bp。7类I型整合子在119株猪源大肠杆菌中存在13种流行组合。78.15%大肠杆菌菌株的I型整合子携带2种或2种以上的基因盒,其中以携带编码氨基糖苷类药物耐药基因(aadA1、aadA2、aadA5、aadA22、aadB)最多,其次为编码磺胺类药物耐药基因(dfrA1、dfrA12、dfrA17、dfrA27),此外还携带编码利福平、林可霉素和氯霉素的基因1nuF、cm1A6、aar-3、off.结论I型整合子普遍存在于大肠杆菌中,且呈流行上升趋势;I型整合子参与耐药及多重耐药,但单株细菌携带的耐药基因盒与其耐药表型无对应关系。 相似文献
993.
根据Gen Bank登录的猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株(登录号KJ960180)的M基因保守序列,设计1对扩增片段大小为299 bp的特异性引物,经PCR扩增、克隆、测序鉴定后,提取质粒作为阳性标准品,建立了PEDV的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR检测方法。该方法在1.21×10^3~1.21×10^8拷贝/μL范围内呈现良好的线性,相关系数(R2)为0.999,扩增效率为99%,扩增产物的熔解曲线为单个特异峰,产物Tm值为85.5~86℃,最低检测限为1.21×10^1拷贝/μL。本研究建立的SYBR GreenⅠ实时荧光定量RT-PCR检测方法特异性强、重复性好、成本低且操作简单,适用于PEDV的早期诊断、定量研究和流行病学监测。 相似文献
994.
二溴海因(DBDMH)是目前国际上公认的杀菌力最强的新一代氧化型绿色环保广谱消毒药剂。采用二溴海因并添加助燃剂配制成蚕用熏烟消毒剂鲁烟Ⅰ号用于家蚕病原体的消毒,结果显示鲁烟Ⅰ号对感染家蚕的主要病毒、细菌、真菌病原均有很好的灭活效果:对家蚕核型多角体病毒(BmNPV)和质型多角体病毒(BmCPV)用2g/m3鲁烟Ⅰ号熏烟30min以上,对苏云金芽孢杆菌用2g/m3或1g/m3鲁烟Ⅰ号分别熏烟1、2h,对白僵菌和曲霉菌的分生孢子用1g/m3鲁烟Ⅰ号熏烟30min,均可达到100%杀灭病原菌的消毒效果。建议在养蚕前后采用3g/m3鲁烟Ⅰ号对蚕室蚕具熏烟消毒,以达到杀灭家蚕主要病原菌的目的。 相似文献
995.
番茄基因的分子标记与遗传作图——文献综述 总被引:9,自引:0,他引:9
介绍了番茄分子图,特别是抗病基因标记作图和构建精密遗传图的新进展,同时概述了分子标记及其作图在基因克隆、QTL定位、标记辅助选择,以及在细胞杂交、进化关系和良种纯度检测等方面的应用前景。 相似文献
996.
997.
998.
In this paper, genetic diversity of intraspecies, and genetic relationship of interspecies in Epinephelus spp. (E. merra, E. fario, E. awoara, E. akaara and E. septemfasciatus) were assessed by using mitochondrial DNA restriction fragment length polymorphisms (mtDNA RFLPs).The samples were collected from the coastal area of Zhanjiang,Guangdong province. MtDNA was extracted from the fresh liver tissue by applying a difference centrifugation procedures. Using 17 restriction enzymes with 5-or 6-bp recognition sites, the purified mtDNA was cleaved by single enzymes. These enzymes included BamH Ⅰ,Bgl Ⅰ,Bgl Ⅱ,Dra Ⅰ,EcoR Ⅰ,EcoR Ⅴ,Hind Ⅲ,Kpn Ⅰ,Mlu Ⅰ,Pst Ⅰ,Pvu Ⅱ,Sal Ⅰ,Sca Ⅰ,Sma Ⅰ,Sty Ⅰ,Xba Ⅰ and Xho Ⅰ. The phylogenetic analysis was done using the Neighbor joining(NJ) method and Unweighted pairgroup method with arithmetic mean(UPGMA) method. Genetic diversity indices such as haplotype diversity (h), average genetic distance between haplotypes (P) and nucleotide diversity (π) were calculated using Nei and Li's segment method to quantify the genetic diversity within species. There were 8, 5, 8, 5 and 2 haplotypes detected within E. merra, E. fario, E.awoara, E.akaara and E. septemfasciatus, respectively. The haplotype diversity (h) was 0.8943, 0.6186, 0.9242, 0.6927 and 0.1820,respectively. The average genetic distance between haplotypes (P) was 0.62%±0.31%, 0.64%±0.37%, 1.12%±0.55%,0.72%±0.42% and 0.45%, respectively. And the nucleotide diversity (π) was 0.22%, 0.13%, 0.46%, 0.17% and 0.04%, respectively. The wild groupers in the Zhanjiang Coastal Area exhibited a relative higher level of genetic diversity. The net genetic distance between species (Pnet) was 0.0694(E. merra - E. fario),0.1337(E. merra - E. awoara),0.1090 E. merra -E. akaara), 0.1286(E. merra - E. septemfasciatus),0.1590(E. fario -E. awoara),0.0825(E. fario -E. akaara),0.1153(E. fario - E. septemfasciatus),0.1131 E. awoara - E. akaara),0.0724(E. awoara -E. septemfasciatus) and 0.1336(E. akaara - E. septemfasciatus). Both NJ and UPGMA methods yielded an identical phylogenetic tree for the five species. The E. merra and E. fario first clustered together, then joined with E. akaara, and finally clustered with E. awoara and E. septemfasciatus. 相似文献
999.
中国东南沿海青蟹线粒体COI基因部分序列分析 总被引:18,自引:1,他引:17
对我国东南沿海5个地区的72个青蟹个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I (COI)部分序列序列进行了测定和分析。获得的72个细胞色素氧化酶亚基I (COI)序列可分为12个单倍型,与GenBank中已知的Scylla paramamosain COI序列的相似性达到98%以上,与其它3种
青蟹的差异为7.36%~15.54%。这些序列与S. paramamosain的遗传距离仅为0.00783,但是与S. serrata、S. olivacea和S. tranquebarica〗的遗传距离却分别达到0.11659、0.17812和0.08423。序列特征、遗传距离和系统进化等分析结果都表明本文研究的青蟹为S. paramamosain。结果提示,在进行青蟹属相关研究应当仔细鉴别采集样本的种类。 相似文献
1000.
目的 研究桑树中HD-Zip I亚家族成员的进化及结构等特点,明确该家族基因的器官特异性表达模式,阐明ABA及淹水、盐和脱水处理对桑树HD-Zip I基因表达水平的影响。 方法 通过桑树基因组数据库鉴定桑树HD-Zip I基因,并进行生物信息学分析;利用桑树与拟南芥HD-Zip I蛋白的序列比对结果,构建系统进化树;利用桑树RNA-seq数据分析桑树HD-Zip I基因的组织/器官特异性表达谱;利用qRT-PCR分析桑树HD-Zip I基因在激素及非生物胁迫处理下的表达模式。 结果 共鉴定出14个桑树HD-Zip I基因,根据进化关系可进一步将其分为6个分枝,各分枝内的成员具有相似的基因结构及保守基序。RNA-seq数据分析发现,MnHD-Zip 2和MnHD-Zip 6在根、枝条、冬芽、雄花和叶片中均呈现高水平表达。激素处理后的基因表达分析发现,MnHD-Zip 8、MnHD-Zip 9、MnHD-Zip 11、MnHD-Zip 12和MnHD-Zip 13受到ABA不同程度的上调诱导,桑树其余HD-Zip I基因的表达水平均受到ABA不同程度的抑制。非生物胁迫处理表达分析发现,桑树HD-Zip I亚家族基因均受到3种非生物胁迫不同程度的诱导表达。 结论 桑树β分枝成员受到盐和脱水胁迫的显著诱导表达,且在各种器官中也有较广泛的高表达,因此,推测这些基因在桑树生长发育及逆境胁迫中均发挥着重要的调控作用。此外,MnHD-Zip 8和MnHD-Zip 12受到了盐、淹水及脱水胁迫的显著诱导,由此推测它们在桑树逆境胁迫响应中具有潜在重要功能。 相似文献