4个微卫星标记在波尔山羊中的遗传多态性研究

根据比较基因组学方法,利用绵羊6号染色体上与主效多胎基因(FecB)紧密连锁的4个微卫星标记OarAE101、OarHH55、BM1329和BMS2508,对波尔山羊进行了等位基因频率、多态信息含量、有效等位基因数和杂合度的遗传检测。结果表明,4个微卫星位点在波尔山羊上多态性丰富;OarAE101基因座的多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、平均杂合度(He)分别为0.847 4,6.553 1和0.862 8;OarHH55基因座分别为0.767 6,4.302 9和0.796 8;BM1329基因座分别为0.841 4,6.305 2和0.857 6;BMS2508基因座分别为0.783 1,4.6104和0.8096。4个微卫星位点均为高度多态位点,可用于波尔山羊遗传多态性评估和多胎性状研究。     

家蚕微卫星标记的荧光原位杂交研究

家蚕既是重要的农业经济昆虫,又是遗传学研究常用的实验动物和现代分子生物学研究的良好材料. 目前已有多种分子标记被用于家蚕遗传连锁图的构建, 但人们对这些分子标记在染色体上的物理定位仍知之甚少. 该文以微卫星(SSR03)序列为探针, 对家蚕染色体进行荧光原位杂交, 在减数分裂的间期、粗线期、中期染色体上都观察到单一荧光信号, 表明该序列为单一序列微卫星遗传标记. 利用Image J 软件测算杂交信号在该染色体上位置, 信号位点距离近端的相对长度与该染色体相对长度比值为12.502±0.470. SSR03可作为家蚕染色体物理图的遗传标记.     

浙江省水稻品种对条纹叶枯病抗性鉴定和Stvb-i基因的SSR检测

以浙江省11个粳稻品种(系)对条纹叶枯病抗性进行自然鉴定,并进而用一个与水稻条纹叶枯病抗性基因Stvb-i紧密连锁的RM209微卫星标记进行了分子检测。结果表明,春江051、丙00502SJ、丙00502HSF47、HGP5和HPG6共5个水稻品种(系)检测到Stvbi-抗性基因,其中丙00502HSF47田间表现感病,其它4个品种(系)均表现出良好的田间抗性。Z5、HGP3和HGP4虽未检测到Stvb-i抗性基因,但也表现出较强的田间抗性,推测这3个品种可能含有新的抗病基因或具有其它某种抗病机制。     

用于染色体步行的PCR技术

对用于染色体步行的PCR技术进行了综述，将已报道的11种用于兆色体步行的PCR技术分为4类，指出了各种技术方法的优点及成功运用的例子，并对这些技术的局限性和今后发展的趋势进行了探讨。     

新疆肠道传播的非甲非乙型肝炎（戊型）病毒（ET—HEV）核酸特异片段的PCR扩增

本研究建立了自患者粪便中直接进行ＥＴ－ＨＥＶ核酸特异片段扩增的方法．即便经反转录反应后的ＰＣＲ放大法。ＰＣＲ流程为：变性：９４℃９０ｓ，退火：４０℃９０ｓ，延伸；７３℃１２０ｓ，共２５个循环。所用引物为ＥＴ－ＨＥＶ特异．从而决定了ＰＣＲ产物的特异性．该产物已用于制备ＥＴ－ＨＥＶＲＮＡ持异的诊断探针．     

应用微卫星标记研究中国15个地方白羽鹅品种遗传多样性

利用22个微卫星DNA标记对中国15个地方白羽鹅种进行遗传分析。结果表明：22个微卫星标记中3个为高度多态座位，1个低度多态座位，其余均为中度多态座位。平均杂合度最高的是太湖鹅（0．7105），最低的是皖西白鹅（0．5838）。织金白鹅与溆浦鹅遗传距离最近，为0．0417，而太湖鹅与四川白鹅最远，为0．7259。通过UPGMA法15个地方白羽鹅聚为3大类：织金白鹅、溆浦鹅、闽北白鹅、右江鹅、莲花白鹅、武冈铜鹅、同始鹅、浙东白鹅、籽鹅聚为第一类，广丰白翎鹅、皖西白鹅聚为第二类；酃县白鹅、百籽鹅、太湖鹅、四川白鹅聚为第三类。本研究证明中国地方鹅群体的遗传多性样比较丰富，具有较高的选择潜力。     

用微卫星标记评估中国水稻主栽品种的遗传多样性

【目的】为正确评估中国水稻(Oryza sativa L.)主栽品种的遗传多样性提供依据。【方法】应用位于水稻)12条染色体上已筛选的24个微卫星(simple sequence repeats, SSR)标记组合（每条染色体2个），分析63个主栽常规稻品种和杂交稻组合亲本(2002年推广面积达6.67×104 ha（100万亩）)的遗传变异。【结果】共检测到135个等位基因，平均每个标记5.6个；多态性频率（frequency of polymorphisms, FP）变动范围为0.486～0.840，平均0.682。水稻恢复系比保持系/不育系遗传差异大；与常规籼稻品种相比，常规粳稻品种的遗传多样性较低。聚类分析表明，中国籼稻品种主要来自华南稻区和长江流域稻区，粳稻品种则分布于北方稻区和太湖流域(江苏和浙江省)，表现出明显的地域分布特点。【结论】作者认为，应用微卫星标记所作的中国水稻品种聚类分析与传统系谱分析趋势一致，结果更为精确。     

利用小麦微卫星引物建立偃麦草Ee染色体组特异SSR标记

选用40对小麦SSR引物对17份偃麦草(Thinopyrum sp．)、2份小麦(Triticum aestivum)材料进行了PCR扩增分析，从中筛选到引物Xgwm325能在不同偃麦草材料中扩增出4条长度分别为1400、440、120和100bp的特异DNA片段，可以作为偃麦草种质的特异SSR标记。利用小麦-二倍体长穗偃麦草(Th.elongatum)异代换系和异附加系对引物Xgwm325进行了扩增鉴定，结果只有100bp左右的片段出现在长穗偃麦草所有E^e组染色体上，该片段可以作为E^e染色体组的特异SSR标记。     

利用微卫星标记分析6个山羊品种遗传多样性

利用微卫星标记技术,分析了山西黎城大青羊、吕梁黑山羊、阳城白山羊、新疆南疆山羊、新疆北疆山羊以及宁夏中卫山羊6个地方山羊品种的分子水平上的遗传多样性,结果表明:19个微卫星位点均为中度和高度多态位点,平均多态信息含量(PIC)达0.6859"0.7083;6个品种平均位点杂合度在0.3832"0.4277之间。遗传分化系数表明:BM203、BM023、BMS6526和BM8754个位点的遗传分化系数(GST)估算值较大,分别为0.0475、0.0491、0.0107和0.0262,BM3033值最小,为0,表明前4个位点在不同品种间的基因分化占总群杂合度的4.75#、4.91#、1.07#和2.6#;其它位点遗传分化系数(GST)值不高,遗传变异主要存在于各个品种内,品种间遗传变异不大。以Nei氏标准遗传距离的UPGMA和N-J聚类结果表明,吕梁黑山羊与阳城白山羊具有较近的亲缘关系,黎城大青羊与新疆南疆山羊具有较近的亲缘关系;以共祖距离的UPGMA和N-J聚类结果,阳城白山羊与新疆南疆山羊亲缘关系较近,山西地方山羊与新疆山羊有可能存在一定的基因交流。     

猪链球菌2型可能的毒力基因分布

通过猪链球菌2型(Streptococcus suis type 2，SS2)毒力菌株HA9801与无毒力菌株12^#之间的抑制性差减杂交(SSH)实验，获得了可能与SS2菌株毒力相关的5个基因片段，分别是转录调节子(15^#，和154^#片段)，氨基酸通透酶(210^#片段)，ABC转运子(9^#片段)及表面锚定蛋白(187^#片段)。根据5个片段的序列，设计了5对引物，用PCR方法对不同来源、不同核糖型及不同毒力的35株SS2菌株进行检测。结果表明，这5个片段存在于所有的脑膜炎分离株，缺失于所有的肺炎分离株、心内膜炎分离株、败血症分离株及无毒力菌株，但其中154^#片段则在1株肺炎分离株中存在。从而表明，这5个片段可能与脑膜炎有关，可望用于脑膜炎分离株的检测。