水产品收购价格预测的时序组合模型研究

我国水产品市场已经出现了区域性、结构性的供大于求及价格持续下降的现象。为此，对水产品价格进行预测是必要的。以1978～1999年数据为样本，利用时序组合模型对2000年的水产品收购价格进行了预测研究。     

基于LS-SVM的小水电站年发电量智

针对小水电站年发电量序列的特点，将最小二乘支持向量机（least squares support vector machine, LS-SVM）回归模型引入年发电量预测领域，并给出了相应的过程和算法。与常规基于人工神经网络（artificial neural networks, ANN）的智能预测方法比较，该模型优点是明显的：①将神经网络迭代学习问题转化为直接求解多元线性方程；②整个训练过程中有且仅有一个全局极值点，确定了预测的稳定性。最后，一个实际的预测例子表明：该模型实现容易、预测准确，适用于小水电站预测。     

侵染苘麻的菜豆金色黄花叶病毒的鉴定及基因组结构分析

为明确引起我国山西晋中地区苘麻叶片表现皱缩和花叶症状的病原物及其基因组分子特征, 本研究利用双生病毒简并引物扩增获得病毒基因组部分序列,经测序、比对后设计特异性引物扩增病毒基因组序列, 进而通过生物信息学方法构建系统发育树并进行序列分析。结果表明:引起苘麻叶片皱缩、花叶的病原物为番茄黄化曲叶病毒(tomato yellow leaf curl virus, TYLCV), 将该分离物命名为TYLCV-Abu, GenBank登录号为OP293347, 但未扩增到β卫星。该病毒DNA-A基因组全长为2 782 bp, 含有6个开放阅读框。TYLCV-Abu分离物与TYLCV茄子分离物KSQ1-3(GenBank登录号KC428753)的核苷酸序列一致性最高, 为98.99%, 其中C4和V2编码的蛋白变异较大。重组结果分析显示,分离物TYLCV-Abu是由TYLCV-F(GenBank登录号KY971326)和TYLCV-KSQ1-3重组得到, 重组区域为其基因组2 617－2 782 nt区域。这是首次从苘麻样品中扩增到TYLCV全基因组序列并进行分析。     

夜来香花叶病毒江西分离物的分子特征与序列分析

夜来香花叶病毒(telosma mosaic virus, TeMV)是侵染西番莲的重要植物病毒之一。本研究通过RACE和RT-PCR技术获得3条TeMV江西分离物全基因组序列,除poly(A)尾外,3个分离物基因组全长均为10069 nt。试验中采用汁液摩擦接种的方式对分离物进行生物学特性研究,首次发现该病毒可侵染豌豆寄主。对所获分离物全基因组进行序列一致性分析,结果显示,江西分离物间核苷酸与氨基酸序列一致性分别为98.1%-98.6%和98.8%-99.3%,与GenBank中报道的TeMV分离物全基因组的核苷酸与氨基酸序列一致分别为87.3%-98.9%和91.2%-99.5%,其中与武夷山分离物(MK340755)序列一致性最高。基于不同分离物CP基因的系统发育分析显示,寄主来源相同的分离物亲缘关系较近,推测TeMV的遗传进化与不同的植物寄主相关。     

信息分析技术在生物医学领域的应用分析——以核酸和蛋白质为例

信息分析技术与生物医学领域充分融合,产生了新兴交叉学科——生物信息学。生物信息学广泛渗透于生物医学研究,为其提供了数据查找、数据处理、功能及结构预测等技术支持。文章就生物信息学所研究的主要内容加以梳理,从核酸和蛋白质两个方向对现有使用较多的数据库及分析方法分类逐层进行整理分析,发现信息分析技术应用于生物医学领域研究中在信息检索的检全率与检准率、衍生疾病的预测、寻找制药靶点、新研究方向的探索等方面起到了积极的作用。     

猪流行性腹泻病毒云南省流行毒株S1基因序列分析

为深入了解云南省猪流行性腹泻病毒（porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）的流行现状及现有疫苗株的保护效果,从2017—2022年云南省PEDV感染临床阳性样品中扩增出9份样品的PEDV S1基因,利用生物信息学方法,对9份样品S1基因进行了遗传进化树构建、同源性分析和氨基酸突变位点分析等。结果显示：2份样品位于G1基因群,其余7份位于G2基因群的G2b基因亚群。7份G2b基因亚群样品的核苷酸和推导氨基酸同源性较高,与G2基因群的AJ1102和L/W/L疫苗株处于不同基因亚群且同源性较低,并在第13、139、289和363位发生了不一致的突变位点;与现有疫苗株相比,在抗原中和位点COE区域以及其他区域,有明显的抗原性变化。结果表明：云南省存在G1基因群和G2b基因亚群PEDV同时流行,但以G2b基因亚群为主;流行株和疫苗株间存在较远的遗传和亲缘关系,以及氨基酸突变和抗原性差异,这很可能是导致目前PED控制不理想的原因,因此需要研发安全有效的疫苗。     

一株酵母菌酿造柿子酒的发酵特性及其序列鉴定

通过三因素二次回归旋转组合试验设计，研究了发酵温度、接种量、发酵液初始pH值对菌株PS2酿造柿子酒发酵特性的影响，得出了柿子酒质量与工艺因素间的回归模型。结果表明：3个因素对柿子酒质量均有极显著影响（p〈0.01），最佳工艺参数是发酵温度为22℃，接种量为10．4%，pH值为3．4。利用ITS1-5．8S—ITS2序列分析鉴定该菌株的分类水平，结果表明菌株PS2为Saccharomyces cerevisiae HA6（登录号SC09327）。     

大肠杆菌F18菌毛A亚单位基因(fedA)的克隆与序列测定

利用PCR技术 ,分别从产F18ab菌毛的猪水肿病大肠杆菌分离株G及产F18ac菌毛的大肠杆菌 8813株中扩增出 5 10bp左右的F18菌毛A亚单位基因 (fedA)。将这 2个PCR扩增产物按预定阅读框架克隆入pGEX 6p 1载体的谷胱甘肽S 转移酶 (GST)基因的下游 ,筛选获得阳性重组质粒 ,并对质粒中的插入序列进行测定。序列分析表明 :F18ab与F18ac的fedA基因的核苷酸序列同源性为 97.6 % ,推导的氨基酸序列同源性为 94.7% ,两者的主要区别在于F18acfedA基因的第 36 3bp处比F18ab多 3个核苷酸 ,并出现一个新的酶切位点 (NgoMI)     

蒙古牛肌肉生长抑制素基因编码序列检测分析

肌肉生长抑制素(myostatin)基因是影响骨骼肌生长和发育重要的候选基因。实验以2头双肌皮埃蒙特牛和30头蒙古牛基因组DNA为模板，针对牛myostatin基因设计了3对引物并扩增了3个外显子和部分5’调控区。对PCR扩增片段克隆、测序结果显示，2头皮埃蒙特牛均在编码序列938处发生G到A突变，使编码氨基酸由半胱氨酸变为酪氨酸，符合前人检测结果。首次在蒙古牛中发现在6个不同位点存在单核苷酸突变，其中3个无义突变，3个突变引起了编码氨基酸变化，反映了牛myostatin基因在进化过程中具有较高的突变性。