第2.3.4.4分支H5亚型高致病性禽流感病毒主要抗原位点分析

为了解第2.3.4.4分支H5亚型高致病性禽流感病毒主要抗原位点,本试验对A/chicken/Yunnan/1/2014与Re-5的HA1蛋白进行比较,对Re-5母本病毒的差异氨基酸位点进行突变,利用反向遗传技术构建重组病毒。用Re-5阳性标准血清进行HI试验,比较重组病毒与Re-5母本病毒的HI滴度,发现D61N、R69K、S145L、S149A、N171D、R178M、Q185R、K234Q、N256H、A279T、V281M、N289H等12个位点改变后导致HI滴度发生改变,是第2.3.4.4分支病毒的主要抗原位点。对2010-2012年第2.3.4.4分支的H5亚型高致病性禽流感病毒的HA序列进行分析,与Re5疫苗株HA1序列进行比对,进行点突变构建重组病毒,HI试验表明,Re5-2010、Re5-2011、Re5-2012、yn2014-Re5与Re5HI滴度分别相差了2,3,4,5个滴度,说明随着时间的推移,病毒变异越来越大。互相替换Re-5和yn2014的HA1或HA2,发现Re5-yn2014与Re5、yn2014-Re5与yn2014的HI滴度一致,说明其抗原位点主要在HA1蛋白区域。这些数据为深入了解该分支病毒的变异和对该病毒的防控提供了技术支持。     

Association of Polymorphisms in the 5'Regulator Region of the VIPR-1 Gene with Chicken Broodiness

本研究旨在探索血管活性肠肽Ⅰ型受体(Vasoacitve intestinal peptide type Ⅰ receptor,VIPR-1)基因5'调控区(-496～-1 bp)多态性及其单倍型效应对鸡就巢性的影响,寻找影响肉鸡就巢性的分子标记,为降低或者剔除肉鸡就巢行为的育种研究提供相应依据.采用测序技术对498只清远麻鸡VIPR-1基因5'调控区进行多态性检测及基因型分析,利用最小二乘均数对VIPR-1基因5'调控区的多态位点与就巢性状进行相关分析,利用PHASE软件对多态位点进行单倍型分析.结果,VIPR-1基因5'调控区存在12个多态性位点,G-359T、G-266T、A-134G、A-94G、C-72G对18～43周龄的就巢持续天数影响达到显著水平(P＜0.05),A-94G位点对18～54周龄的就巢率的影响达到显著水平(P＜0.05);构建的单倍型对18～54周龄的就巢持续天数的影响达到极显著水平(P＜0.01).最小二乘分析结果表明,CCTGGGAAC,CAG/TTGGGGAAGCAC型个体的就巢持续天数比其它单倍型个体极显著的延长(P＜0.01).结果表明,VIPR-1基因5'调控区(-496～-1 bp)可能存在影响鸡就巢行为的分子标记,CCTGGGAAGCAG/TTGGGGAAGCAC型个体对鸡就巢性具有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于家鸡就巢行为的筛选.     

长顺绿壳蛋鸡ATP2B2基因多态性及其对蛋壳品质的影响

为了探究钙离子转运ATP酶B2(ATP2B2)基因多态位点对长顺绿壳蛋鸡蛋壳品质的影响,本实验采用PCR产物直接测序和序列比对软件鉴定ATP2B2基因SNP位点,SPSS 22.0软件单因素方差分析检测SNP位点不同基因型蛋壳指标的差异。结果发现,3个SNP位点位于第4外显子的非编码区（UTR）、第15外显子的蛋白质编码区（CDS）和第25外显子的蛋白质编码区（CDS）,分别为g.4030584 A>G、g.4144313C>T和g.4193196G>A,共存在6种单倍型和10种双倍型。卡方（χ2）检验结果表明：3个SNP位点所产生的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。关联性分析研究的结果显示：g.4030584 A>G、g.4144313C>T突变位点显著影响个体蛋壳强度;3个SNP位点联合产生的双倍型H2H4个体的蛋壳厚度显著高于H1H1、H1H2;H1H1个体的蛋壳强度显著高于H2H3、H2H5、H2H6。综上结果表明,g.4030584 A>G、g.4144313C>T突变可能是影响蛋壳强度的标记位点,...     

单个B细胞抗体制备技术研究进展

单克隆抗体在疾病预防、诊断和治疗方面具有重要意义,尤其在免疫机制研究方面具有突出贡献。随着单克隆抗体制备技术的发展,单个B细胞抗体制备技术成为新一代快速制备单克隆抗体的方法。该技术利用每个B细胞仅可产生一种特异性抗体的特性,直接筛选出分泌特异性抗体的B细胞,对其表达抗体重链和轻链的基因进行克隆和体外表达,从而获得特异性单克隆抗体。相较传统抗体制备技术,该技术具有快速、高效、产量高等优点,且表达的抗体具有天然构象,不仅可用于病原微生物相关抗原的抗体开发、病毒跨种传播机制等研究,还在抗肿瘤治疗、抗自身免疫病等方面发挥重要作用。本文主要对单个B细胞抗体制备过程和应用现状进行综述,以期为单克隆抗体制备技术的发展和完善提供参考,促进其更好地应用于相关领域。     

一种副猪嗜血杆菌新型分型方法——多基因位点序列分型

副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,Hps)为革兰氏阴性菌,属于巴氏杆菌科嗜血杆菌属,是猪副猪嗜血杆菌病的主要致病菌.应用多基因位点序列分型技术对副猪嗜血杆菌进行分型,具有简便快速、重复性强、分辨率较高、所得数据标准等优点.并且还可通过互联网实现实验室间数据共享及比较.通过试验对多基因位点序列分型(MLST)技术的原理、方法及结果进行了阐述.以期为副猪嗜血杆菌的分型提供参考.     

矮牡丹与芍药属其他5个种叶绿体基因组特征的比较

【目的】中国特有的野生牡丹一直被国内外视为珍贵的种质资源。野生矮牡丹被认为是现代栽培牡丹品种重要的祖先种之一,开展矮牡丹在内的芍药属植物叶绿体基因组(cp DNA)特征分析对阐明牡丹系统进化、培育和改良栽培品种具有重要的理论与实践价值。【方法】在矮牡丹叶绿体高通量测序的基础上,从NCBI数据库下载凤丹牡丹、大花黄牡丹、滇牡丹、川赤芍和草芍药的cp DNA数据,利用Geneious 8. 0、EMBOSS 6. 4. 0等软件,对芍药属6个种的cp DNA进行对比分析。【结果】矮牡丹cp DNA序列共152 628 bp,共有112个基因,使用25 988个密码子,编码蛋白78个;有19个基因(包括4个rRNA、7个tRNA、8个蛋白编码基因)在IR(反向重复)区重复。共搜索到143个SSR位点,单核苷酸重复基序位点最多,为116个(占81. 12%),没有六核苷酸重复基序。尽管芍药属叶绿体基因组比较保守,但不同种间IR和LSC(大单拷贝区)的边界位置仍有一定变化,凤丹牡丹LSC/IR的rpl2基因有718 bp延伸至LSC区域,而其他种的rpl2基因均完整地位于IR区。【结论】从基因组大小和基因内容来看,芍药属cp DNA高度保守;草芍药与滇牡丹cp DNA最大,为152 698 bp;凤丹牡丹cp DNA最小,为152 153bp。矮牡丹cp DNA蛋白编码基因密码子偏好使用A/T碱基,SSRs位点的碱基组成也偏好使用A/T碱基,143个SSRs位点中,A/T组成的位点有134个;矮牡丹cp DNA SSRs分布具有不均匀性,14个SSR位点位于IR区段,103个位于LSC区段,26个位于SSC区段。IR边界分析显示,芍药属LSC/IRb的边界变化是IR区扩张与收缩的主要原因。研究结果为芍药属植物的系统进化与栽培起源等研究提供支持,对芍药属植物分子标记开发及优良品种选育具有参考价值。     

四川察青松多白唇鹿国家级自然保护区野生兽类的红外相机初步监测

2017年8月至2018年8月,利用红外相机技术对四川察青松多白唇鹿国家级自然保护区内野生兽类开展监测研究.研究期间共计88个有效相机监测位点,共计6031个有效相机日,共获得野生兽类照片8708张,视频423段,能够准确识别到具体物种的照片8508张,视频403段,独立有效记录1237次,共准确识别出野生兽类5目11...     

林木遗传图谱构建和数量性状基因定位

本文简要介绍了９０年代以来利用ＲＦＬＰ和ＲＡＰＤ分子标记的构建林木的遗传连锁图谱，并应用高密度的遣传连锁图谱上的分子标记进行林木重要数量性状的ＱＴＬ作图，进而阐明了控制多基因的数目，确定ＱＴＬ在染色体上的位置，测定单个基因的作用效应，遗传连锁图谱构建和数量性状基因定位预示林木遗传育种研究将产生深刻的变革。     

利用红外相机对四川冶勒自然保护区兽类和鸟类资源的初步监测

2008年4月—2021年12月,在四川冶勒自然保护区内及周边区域设置了84个相机监测位点,累计4 504个有效相机工作日,共获得独立有效记录2 039次,识别出野生兽类4目15科19种,野生鸟类3目8科19种,包括4种国家I级和17种国家II级重点保护野生动物。毛冠鹿（Elaphodus cephalophus）(RAI=16.408;SO=65.48%)、中华鬣羚（Capricornis milneedwardsii）(RAI=11.878;SO=30.95%)、猪獾（Arctonyx collaris）(RAI=1.465;SO=27.38%)、野猪（Sus scrofa）(RAI=1.332;SO=21.43%)、小熊猫（Ailurus fulgens）(RAI=0.977;SO=26.19%)的相对多度和位点占有率位于兽类前5位;血雉（Ithaginis cruentus）(RAI=5.662;SO=34.52%)、红腹角雉（Tragopan temminckii）(RAI=3.730;SO=22.62%)、大噪鹛（Garrulax maximus）(RAI=0.222;SO...     

Genome-wide search for segregation distortion loci associated with the expression of complex traits in Populus tomentosa

Segregation distortion of molecular markers has been reported in a broad range of organisms. It has been detected in an interspecific BC1 Populus pedigree established by controlled crossing between clone “LM50” (Populus tomentosa) and its hybrid clone “TB01” (P. tomentosa×P. bolleana). The study with a total of 150 AFLP markers (approximately 18.9% of the total loci) exhibited significant deviation from the Mendelian ratio (1:1) (p<0.01). Twenty-five percent of the markers were mapped on the pa-rental specific genetic linkage maps of clones “LM50” and “TB01” with a pseudo-test-cross mapping strategy. Twelve linkage groups had markers with skewed segregation ratios, but the major regions were on linkage groups TLG2, TLG4 and TLG6 in the linkage map of clone “LM50”. We also analyzed the association between distorted loci and expression of complex traits with Map-maker/QTL software. A total of 16 putative QTLs affecting 12 traits were identified in the distorted regions on seven linkage groups. Therefore we could detect the distribution of skewed loci along the entire genome and identify the association between quantitative traits and segregation loci via genetic mapping in an interspecific BC1 P. tomentosa family. Furthermore, the genetic nature and pos-sible causes of these segregation distortions for differentiation between female and male parents were also discussed.