番茄资源对叶霉病的抗性鉴定和SSR标记遗传变异分析

 对62份番茄种质资源进行了抗番茄叶霉病鉴定, 共筛选出抗病材料17份, 其中对全部生理小种(1.2.3、1.2、2.3、1.2.3.4、1.2.4)均表现抗病或免疫的材料9份;抗3个生理小种的材料4份;抗2个生理小种的材料2份;抗4个生理小种的材料2份。并应用SSR标记技术对62份种质资源进行了遗传多样性分析, 50对SSR引物中筛选出11对多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物, 共扩增出94条谱带, 平均每个引物扩增出8.55条带, 多态性条带比例达63.94%, 遗传相似系数在0~1之间, 表现出丰富的遗传多态性, 可将番茄野生种和栽培种分开, 反映了种间的遗传差异。     

红马银花的资源状况及其生长规律的调查研究

目的分析红马银花(Rhododendron vialii)的遗传多样性以推测其濒危原因,为保护和开发利用红马银花提供理论依据。方法利用SSR分子标记技术,对云南省4个红马银花居群共155个个体的遗传多样性和遗传结构进行了分析。结果8个位点共检测到57个多态性位点,平均每个位点有6对等位基因;在物种水平上具有较高遗传多样性(不同等位基因数N_e=2.780±0.166,有效等位基因数N_a=5.563±0.269,Shannon’s信息指数I=1.156±0.057,观测杂合度H_o=0.546±0.038,期望杂合度H_e=0.598±0.025)。AMOVA分析显示：遗传多样性81%来自居群内,19%来自居群之间,并且居群分化系数(F_st)为0.094±0.020。居群内近交系数(F_is)为0.088±0.081;Structure聚类分析将4个居群聚为2组。结论导致红马银花濒危的主要原因是生境遭到破坏,遗传多样性暂时没有受到很大的影响,建议主要以就地保护为宜。     

用于SSR分析的大豆DNA的快速提取

描述了一种可从大豆种子及叶片中快速提取DNA的方法，既节省时间，又可获得供上百次PCR扩增使用的DNA，并通过实验证明该方法获得的DNA可用于大豆SSR分析。     

小麦山农4143抗黑胚病遗传分析及抗性遗传位点检测

黑胚病是小麦生产的重要籽粒病害,麦根腐平脐蠕孢(Bipolaris sorokiniana)是黑胚病的主要致病菌.为分析小麦抗黑胚病遗传规律并检测抗性位点,本研究以抗黑胚病小麦品系山农4143与感病品系宛原白1号的F7代重组自交系(RIL)群体为材料,于2018～2019年在3个试验点种植,采用“孢子液喷洒、套袋保湿”...     

84个茶树品种遗传多样性及亲缘关系的SSR分析

利用33对多态性SSR引物对84个茶树品种进行亲缘关系和遗传多样性分析,并基于SSR数据,对供试品种进行UPGMA遗传相似性聚类分析.结果表明:参试品种具有较高的遗传多样性(共检测到94个等位位点,每个引物2～4个,平均2.85个;引物多态性信息含量为0.20～0.79,平均值为0.56;可观测等位位点数最多9个,最少...     

番茄SSR遗传连锁图谱的构建及每序花数性状的QTL定位

以每序花数性状差异显著的栽培番茄与野生醋栗番茄杂交产生的F2为作图群体，应用SSR标记构建了番茄的遗传连锁图谱。图谱共包含120个标记,总长度为879．1cM，标记平均间距7．33cM。利用区间作图法在第2和第5染色体上检测到2个与每序花数有关的QTLs，其贡献值分别为5．22％和8．39％。     

小麦新品种川农16与新材料H461贮藏蛋白及SSR差异分析

应用酸性聚丙烯酰胺凝胶电泳(A-PAGE)、十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)和简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)标记,对穗数型多分蘖小麦品种川农16与大穗型寡分蘖小麦品系H461生化及分子水平上的遗传差异进行了检测.结果表明,川农16与H461间至少有10条醇溶蛋白差异带,其高分子量谷蛋白亚基组成分别为(1,20,5 10)和(2*,7 8,2 12).在小麦21条染色体上的72个SSR位点上共检测到95个等位变异,每一个位点所检测到的等位变异数目为1至2个,平均1.3个;其中,23对SSR引物(31.9%)能够揭示川农16与H461间的差异.     

多年生黑麦草叶片长度数量性状位点(QTLs)研究

选择固定有益等位基因,研究多年生黑麦草叶片长度数量性状位点,结果表明:与叶长最为相关的3个标记所表达的变异占表型总变异的50.9%(r2);在选择中如能将这3个标记最优化地组合在一起,其综合共同作用有望使叶片长度延长和缩短26 mm;鉴于供试材料在最初3个世代的群体选择中所估测到叶片长度的遗传力为0.32,这样在今后的选择工作中,即使只使用现有的两个标记,其效果亦优于传统的表型选择法.     

长江2号多花黑麦草主要形态性状的回交改良分析

采用回交的方法对长江2号多花黑麦草（Lolium multiflorum‘Changjiang No.2’）的主要形态性状进行改良。结果表明：杂交组合C2,C7及C8的茎粗及节间长表现优于亲本长江2号。经过一轮回交,各回交组合除含有目标性状外,其他性状也发生了不同程度的回复。SSR分析表明,20对SSR引物在7个育种群体中共扩增出217个条带,多态性条带比率为92.2%。SSR分子标记水平上的遗传相似性分析表明,回交组合形态性状上的变化是发生在遗传物质变化上的。这将为长江2号多花黑麦草的进一步改良提供基础信息。     

Fine mapping quantitative trait loci under selective phenotyping strategies based on linkage and linkage disequilibrium criteria

In fine mapping of a large‐scale experimental population where collection of phenotypes are very expensive, difficult to record or time‐demanding, selective phenotyping could be used to phenotype the most informative individuals. Linkage analyses based sampling criteria (LAC) and linkage disequilibrium‐based sampling criteria (LDC) for selecting individuals to phenotype are compared to random phenotyping in a quantitative trait loci (QTL) verification experiment using stochastic simulation. Several strategies based on LAC and LDC for selecting the most informative 30%, 40% or 50% of individuals for phenotyping to extract maximum power and precision in a QTL fine mapping experiment were developed and assessed. Linkage analyses for the mapping was performed for individuals sampled on LAC within families and combined linkage disequilibrium and linkage analyses was performed for individuals sampled across the whole population based on LDC. The results showed that selecting individuals with similar haplotypes to the paternal haplotypes (minimum recombination criterion) using LAC compared to random phenotyping gave at least the same power to detect a QTL but decreased the accuracy of the QTL position. However, in order to estimate unbiased QTL parameters based on LAC in a large half‐sib family, prior information on QTL position was required. The LDC improved the accuracy to estimate the QTL position but not significantly compared to random phenotyping with the same sample size. When applying LDC (all phenotyping levels), the estimated QTL effect were closer to the true value in comparison to LAC. The results showed that the LDC were better than the LAC to select individuals for phenotyping and contributed to detection of the QTL.