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阿勒泰白头牛以早熟,繁殖力高,生长发育快,耐高寒、高温,耐粗饲,适应性好和抗病能力强等优良特性深受新疆广大农牧民青睐。同时具有较好的生产能力。肉质嫩,乳脂率高,体型美观,性格温驯,是一种古老而原始的地方优良牛种。2003年来由于各种原因,白头牛选种、选育工作没有得到足够的重视,加上引入大量外国优秀牛品种并进行无计划的杂交,纯种白头牛的数量在不断减少,甚至面临濒临灭绝的危险。 相似文献
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阿勒泰白头牛是新疆阿勒泰地区的乳肉役兼用地方品种,具有白头、抗病力强和性情温顺特点。结构变异(structure variations, SVs)是影响牛表型性状的重要遗传变异形式。本研究旨在获得阿勒泰白头牛基因组SVs的特征和种质特征的候选基因。以20头阿勒泰白头牛测序深度为17.32X的基因组序列为基础,通过Delly、Lumpy和Manta三个软件进行SVs的检测,并通过SURVIVOR软件取交集进行整合,总共鉴定到37847个SVs。从类型看,缺失、易位、倒位、复制和插入的比例分别为55.5%、26.7%、8.7%、8.9%和不足0.1%。从长度看,缺失、倒位和复制的分布呈现右偏态。以频率大于0.9为标准,获得636个高频SVs,涉及865个蛋白编码基因。基因注释和富集分析发现,阿勒泰白头牛的高频SVs与免疫抗病和神经功能相关,契合了抗病力强和性情温顺特征,可作为相关特征的候选基因(免疫抗病:BolA-DQB、TNIP3、IL1RAP和IL1R1,神经性情:EPHA6、GRM7和HTR2A)。值得注意的是,我们发现ASIP基因5′非编码区存在一个缺失,该基因可减少真黑素的合成,... 相似文献
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