杉木转录组SSR挖掘及EST-SSR标记规模化开发

[目的]为解决杉木SSR标记数量不足、已开发的位点多态性较差等问题,以杉木转录组测序数据为基础,结合多重PCR技术批量挖掘SSR,规模化开发EST-SSR位点,为杉木分子遗传学研究奠定良好基础。[方法]杉木转录组序列数据(Accession:SRX151872)从NCBI的SRA数据库下载。利用CLC和CMiB软件批量挖掘SSR位点;利用四色荧光标记通用引物多重PCR(multiplex-PCR)技术实现SSR标记的规模化开发。[结果]杉木转录组de novo assembly序列拼接共得到35633个contigs,总长度31.5 Mb,其中最小拼接长度155 bp,最大23794 bp,平均长度884 bp。得到2156个SSR位点,分布于1822个contigs中,其中256个contigs中包含1个以上SSR位点,复合型SSR数量为118个, SSR平均分布密度为68.4个/Mb。不同SSR重复单元(motif)中,三核苷酸SSR重复单元数量最多,占总数的41.7%。批量引物设计得到1582个有效位点的引物对,占SSR位点总数的73.4%。利用四色荧光标记通用引物多重PCR检测技术,对35个候选标记位点进行多态性检测,其中28个位点具有多态性,多态性位点比例达到80%,检测位点多态信息含量(PIC)平均值为0.573,表明所开发的EST-SSR位点具有很高的多态性。PCA分析结果表明, 28个EST-SSR多态性位点具有很强的鉴别杉木不同地理种源,甚至同一种源不同单株的能力。[结论]将转录组SSRs挖掘和四色荧光标记通用引物多重PCR技术相结合,成功建立杉木EST-SSR高效开发流程和方法,得到较多高质量的EST-SSR标记位点,这些位点已用于后续杉木遗传多样性保护研究。与传统SSR标记位点开发技术相比较,转录组海量序列为高质量多态性位点的选择可提供充足的数据保证。四色荧光标记通用引物基因分型结果清晰、稳定可靠,不但试验成本仅为原来的10%~15%,而且结合多重PCR扩增技术,可使试验效率提高5~6倍。新方法的建立和应用不仅能促进杉木分子遗传学相关研究,而且对其他非模式生物或新物种SSR标记开发也具有重要的参考作用。     

云南保山地区杉木的混农林模式及效益分析

云南保山地区农村用杉木为主的用材林树种与农作物间作的造林方式对村社林业的发展起着积极的促进作用, 并能够长期、稳定地发挥着良好的社会、经济和生态效益, 其主要间作模式有杉木＋ 农作物、杉木＋ 茶叶＋ 农作物。本文在对主要杉木混农组合类型介绍的基础上, 对其效益进行了分析。     

试论杉木林可持续经营的对策

改革传统林业经营措施 ,降低对林地干扰强度 ,增加杉木林不同生长发育阶段群落结构复杂性和物种多样性 ,杉阔轮栽 ,林地施肥 ,进一步加强宏观调控 ,加大杉木良种选育和推广力度等 ,均是实现杉木林可持续经营的较有效措施。为了全面实现杉木林可持续经营 ,则应针对不同产区、立地 (母岩 )开展可持续经营相关试验及评价指标体系的研究与探讨     

变温及赤霉素协同作用对轮叶党参种子萌发影响的研究

为解决轮叶党参栽培过程中种子发芽率低、出苗不整齐而造成的播种量大、成本高的问题,用不同浓度赤霉素进行种子浸泡并在变温条件下进行培养。试验结果表明：轮叶党参种子具有休眠特性,处理后种子发芽率与对照组相比,发芽率有显著提高,特别是在21~28℃条件下的800mg.kg-1的处理发芽率最高。     

杉木雄性不育性遗传机理初步分析

对杉木雄性不育原株混合授粉子代的开花情况作了观测与分析，初步认为杉木雄性不育性属核质基因作用型，即雄性不育株的细胞核有５对控制育性的隐性纯合基因，细胞质有一种控制不育性的基因，构成雄性不育基因型──Ｓ（ｍｓ＿１ｍｓ＿１ｍｓ＿２ｍｓ＿２ｍｓ＿３ｍｓ＿３ｍｓ＿４ｍｓ＿４ｍｓ＿５ｍｓ＿５）。     

Study on Variation Pattern of Microfibril Angle in Chinese Fir

Microfibril angle （MFA） in Chinese fir was tested by X-ray diffraction apparatus and calculated by computer software. The results were as follows： MFA was controlled strongly by inheritance, and there was no significant difference in MFA among interspecies, juvenile and mature wood. In the longitudinal, MFA reduces with the height rising from 0 to 5.5 m, especially in the heights from 0 to 1.5 m. The values of MFA are nearly consistence from 1.5 to 7.5 m. The variation range was between 10.82°and 12.57°from 1.5 to 7.5 m, R2 of power equation achieved 0.932 1, and analysis of variance indicated that the variation of MFA was not significant from 1.5 to 7.5 m, The age of the trees had an important influence on MFA, consequently, the difference in MFA was significant among annual rings in radial, which was maximal in near pith and reduced rapidly from the pith to sapwood, and its decline tendency was slow beyond the ninth annual ring. MFA reached minimum value at the 15th annual ring, and the difference reached more than 20° and R^2 of binomial equation achieved 0.755 6.     

广西不同生态地理区域杉木林水量平衡的研究

本文在进行了１０年森林气候和地面径流观测基础上,研究了桂东北低山,桂东南低山及桂中３个区域杉木林的水量平衡。结果是：３个区域杉木林水量平衡都以蒸散量为最大支出项,都由桂东北→桂东南→桂中增大。下渗土层水量居支出项第二,分布规律与蒸散量相反,地面径流（深）为最小支出项,分布规律与蒸散量一致。但是幼龄的杉木林例外,其径流量最大,下渗土层水量最小。水资源生态效益则以桂东北为最好.?     

粗鞘双条杉天牛的危害分布和抽样方法研究

本文采用聚集度指标、频次比较及回归分析方法对粗鞘双条杉天牛在杉木人工纯林的为害分布进行了研究.结果表明,粗鞘双条杉天牛在人工杉木林中为害分布属受密度制约的聚集型分布,其临界密度为m_0=2.5961株/样方;受害株的分布以植株群为基本单元,其形成是由于该天牛扩散活动能力弱,产卵范围比较集中所致.根据回归关系式m=0.6280 0.7905m,可确定随机抽样的理论抽样数θ,θ=t~2/D~2((a 1)/X β 1),以5种不同的抽样调查方法进行比较,结果以棋盘式和平行线抽样调查的结果精确度最高.     

宁夏人工种植银柴胡不同区域适应性研究

银柴胡主要分布在宁夏、内蒙古、陕西3省毗邻的干旱少雨沙生草原区,极耐干旱,主要伴生植物为耐旱的草本植物或小灌木,野生银柴胡生长区的土壤类型为淡灰钙土.还调查了银柴胡的生物学、生态学特性及宁夏主要种植区银柴胡的生长状况,结果表明,人工种植银柴胡的最佳地区是宁夏中部干旱带的沙生草原区.     

福建杉木一般产区实生林标准收获表的编制研究

在福建杉木一般产区收集实生林标准地资料 ,模拟调查因子与年龄的关系曲线 ,同时结合林分直径分布规律 ,编制出福建省杉木一般产区实生林标准收获表