毛竹PeYTH2基因的克隆与初步功能分析

N⁶-methyladenosine (m⁶A)是 RNA 中最广泛的甲基化修饰方式之一,是效应蛋白(readers)的结合位点,在 mRNA 前体剪接,mRNA 降解和翻译,维持基因和基因组稳定性中发挥了重要作用。包含 YTH(YT521-B homology)结构域的 RNA 结合蛋白是重要的调控蛋白,通过结合 m⁶A 来影响含有 m⁶A 修饰的RNA。植物比其他真核生物含有更多的 YTH 蛋白,但其在毛竹中的生物学重要性仍然未知。本研究利用PCR 从毛竹 c DNA 中克隆 PeYTH2,通过生物信息学方法,对 PeYTH2 蛋白序列进行进化分析和氨基酸序列比对发现,其与麦类和高粱之间的同源性较高并且与水稻、大麦、高粱之间的功能域相似度较高。序列分析表明,PeYTH2 的 CDS 长度为 1 887 bp,编码 629 个氨基酸,蛋白质分子量为 68.262 kD。采用实时荧光定量聚合链式反应(qPCR)分析毛竹 Pe YTH2 的空间表达模式和 ABA 与 NaCl 逆境处理下 PeYTH2...     

文心兰花瓣转录组分析与调控花瓣衰老关键基因挖掘

花瓣衰老是观赏园艺植物具有经济价值的重要性状。为了解文心兰衰老花瓣的转录组学特征,挖掘参与调控文心兰花瓣衰老的关键基因,本研究对盛开期(E)、衰老初期(F)和衰老期(G)的文心兰切花花瓣进行RNA测序。测序序列经组装拼接后,共获得48 661个Unigenes,在NR、NT、SwissPort、KEGG、COG、InterPro、GO数据库中分别注释到34 922 (71.77%)、26 286 (54.02%)、23 134 (47.54%)、25 678 (52.77%)、14 483(29.76%)、25 580 (52.57%)和9 103 (18.70%)条Unigenes。经表达量比较,在盛开期(E)和衰老初期(F)之间获得差异表达基因3 914条,衰老初期(F)和衰老期(G)之间获得差异表达基因1 579条。经GO功能富集分析,花瓣盛开期(E)和衰老初期(F)共有3 914、衰老初期(F)和衰老期(G)之间共有1 579条差异表达基因被注释参与生物学过程、细胞组分和分子功能三个功能组。KEGG功能富集分析表明,盛开期(E)和衰老初期(F)之间的差异表达基因参与18个代谢通...     

GbTCP5与GbGL3启动子中TCP顺式作用元件的结合特性分析

TCP转录因子是参与植物生长发育的特异性家族蛋白,但是棉花TCP转录因子家族中的大多数成员功能尚不清楚。为了定位GbTCP5转录因子调控的靶基因,本研究通过Plant CARE在线网站分析棉花纤维发育基因GbGL3上游3 000 bp启动子中的顺式作用元件,构建含有TCP顺式作用元件的载体PHISII-GbGL3和酵母表达载体p GADT7-GbTCP5,通过酵母单杂交分析GbTCP5与GbGL3启动子中TCP顺式作用元件的结合特性。结果表明：GbGL3上游3 000 bp启动子中包含TCP顺式用作元件和功能各异的顺式作用元件,酵母单杂交实验结果表明GbTCP5能够与GbGL3启动子中含有的TCP顺式用作元件结合。本研究为进一步了解GbTCP5转录因子的功能提供依据。     

多组学技术在红豆杉研究中的应用

组学技术及多组学联合分析已成为动植物分子生物学研究常用的技术手段,以转录组学、蛋白质组学及代谢组学为基础的组学技术,已被广泛应用于红豆杉的各项研究中。综述了近年来国内外有关基因组、转录组、蛋白质组与代谢组等组学技术在红豆杉分子标记开发、紫杉醇生物合成、功能基因、抗寒能力以及紫杉醇生物合成相关代谢物中的应用,讨论了这些工作对红豆杉研究的重要意义,为红豆杉分子育种、功能基因挖掘及紫杉醇生物合成分子机理研究提供理论依据,并为今后的研究工作提供思路。     

不同苦瓜品种营养和功能成分含量及总抗氧化能力比较

本研究比较了25个不同品种(系)苦瓜果肉中营养成分、功能成分含量和总抗氧化能力差异,并分析了功能性成分与苦瓜总抗氧化能力的相关性,以期为鲜食和加工型苦瓜品种选育、苦瓜功能食品开发提供依据。结果表明,不同品种(系)苦瓜果肉维生素C、可溶性蛋白、纤维素、氨基酸和总酸含量呈显著性差异,平均值分别为85.71μg/g、7.98 mg/g、319.04 mg/g、1.45 mg/g、0.41%,变异系数分别为28.47%、29.07%、11.05%、43.45%、12.20%。不同品种(系)苦瓜总皂苷、多糖、类黄酮和总酚含量呈显著性差异,平均值分别为5.02 mg/g、38.36 mg/g、2.64 mg/g、7.68 mg/g,变异系数分别为45.62%、25.47%、21.97%、18.49%。不同苦瓜品种(系)1,1-二苯基-2-苦基苯肼自由基(1,1-diphenyl-2-picrylhydrazy, DPPH)、2,2’-联氮-双-3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸(2,2’-azinobis-3-ethylbenzothiazoline-6-sulphonic acid diammoniu...     

红花SCoT-PCR反应体系的建立与优化

为构建红花最佳扩增体系,为以后研究红花遗传多样性和目的基因标记提供了科学依据。本研究采用L₁₆(4⁵)正交试验和单因素试验相结合的方法对红花SCoT-PCR反应体系中的引物,DNA、dNTPs、PCR Buffer (含Mg²⁺)、Taq DNA聚合酶进行优化,每个因素都设为四水平。结果表明,五个影响因素中dNTPs的影响最大,红花最佳反应体系为引物0.6 mmol/L,DNA 60 ng,dNTPs 0.25 mmol/L,Taq DNA聚合酶1.5 U,PCR Buffer (含Mg²⁺) 2μL,ddH₂O补足至20μL。选用引物S15对八种红花资源对扩增体系进行验证,结果显示扩增条带清晰,多态性好,表明该体系适合红花分子标记研究。     

蒙古甘草与新疆红杆甘草再生植株体系的构建

为了建立蒙古甘草和新疆红杆甘草植株再生体系,本研究采用胚轴、叶片、子叶和茎段做外植体,探究了不同激素配比对二者愈伤组织诱导及再生植株生长情况的影响,筛选出愈伤组织诱导和植株再生的最适外植体及最佳培养基。实验结果显示：MS+2.0 mg/L NAA+2.0 mg/L 6-BA为愈伤组织诱导与植株再生诱导的最佳培养基,其中,胚轴与子叶是最佳诱导外植体,愈伤组织诱导率均高于90%。本研究建立的快繁体系可为甘草优良品种繁育及甘草生产提供理论参考与实践指导。     

基于SRAP分子标记的海南油茶品种遗传多样性分析

为了解海南油茶(Camellia oleifera)种质资源的遗传多样性,本研究采用SRAP技术分析了25份油茶材料的亲缘关系和遗传多样性。结果表明,筛选的16对多态性较高的引物组合,共扩增得到500条清晰稳定的条带,其中多态性条带465个,多态性条带百分比(PPB)为93.00%,Nei’s遗传一致度范围为0.510 0～0.868 0,遗传距离范围为0.141 6～0.673 3。遗传多样性参数等位基因数(N_a)、有效等位基因数(N_e)、基因多样性指数(H)、Shannon信息指数(I)和总遗传多样性(H_t)分别为1.930 0、1.546 8、0.319 5、0.479 0和0.319 5,表明25份油茶种质资源遗传多样性丰富。聚类结果将25份油茶材料分为三大类,未严格按照地理区域划分,说明其遗传背景复杂,一定程度上反映出了目前海南油茶资源的混乱现状。SRAP标记可以反映油茶种质资源间的遗传关系,本研究结果对油茶引种、育种、种质资源保存以及新品种开发等方面具有指导作用,可为海南油茶资源分类鉴定提供参考。     

筇竹钾转运体QtHAK12的克隆及表达分析

钾元素在竹笋中含量较高,也是竹笋品质的重要指标之一。为了研究高亲和性K⁺转运蛋白KUP/HAK/KT家族成员在竹笋K+吸收过程中发挥的重要作用。本研究利用RACE技术从筇竹(Qiongzhuea tumidinoda)中克隆得到一个KUP/HAK/KT家族成员的同源基因,命名为QtHAK12 (登录号:MT078986)。同时,对QtHAK12基因进行生物信息学及表达模式分析。结果表明,QtHAK12基因片段全长为2 467 bp,编码区为1 647 bp,包含548个氨基酸。生物信息学分析表明,该编码蛋白具有10个跨膜区域,定位于细胞质膜上,并且具有KUP/HAK/KT钾转运体的典型结构“K-trans”结构域。聚类结果表明,QtHAK12编码蛋白与狗尾巴草(Setaria viridis)、小米(Setaria italica)、水稻(Oryza sativa)等作物HAK蛋白相似度高达89%以上,同源性分别为90.17%、90.17%、89.89%。RT-qPCR结果显示,QtHAK12基因在不同组织(笋,根,茎,叶)中均有表达,且为非诱导表达。低钾和高盐处...     

燕麦SSR标记开发及其在品种指纹图谱构建中的应用

使用磁珠富集法开发燕麦(Avena sativa L.) SSR分子标记,从中筛选出合适的引物构建燕麦10个国审品种的DNA指纹图谱。结果表明,通过磁珠富集法获得了150对SSR引物,从中筛选出6对多态性好且扩增稳定清晰的引物,共检测到50个多态性片段;使用其中2对引物构建了燕麦10个国审品种的DNA指纹图谱。筛选出的6个SSR引物具有很好的多态性,可应用于更多燕麦品种的DNA指纹图谱构建和遗传多样性分析。每个国审燕麦品种均具有唯一DNA指纹编码,可用于燕麦品种真伪鉴定,为品种权保护提供科学依据。