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高质量RNA的提取是开展云南栘[木衣]分子生物学研究的前提。采用OMEGA (Plant RNA Kit 50)试剂盒、TIANGEN(TRNzol-A+Reagent)试剂盒、CTAB法、Trizol法、SDS法及其改良法6种方法提取云南栘[木衣]叶片的RNA,并用琼脂糖凝胶电泳、核酸蛋白检测仪及RT-PCR技术比较了6种不同方法提取的总RNA样品的质量。结果表明,2种试剂盒法和trizol法不适合云南栘[木衣]RNA提取,无法得到28S、18SrRNA条带,CTAB法和SDS法虽能得到RNA的3条带,但拖带现象严重,A260/A230的比值较低,对SDS法进行改进,提高β-巯基乙醇的量,在缓冲液中增加PVP,使用HiBind RNA Mini柱,有效地抑制多酚多糖的污染,得到了较高质量、可用于RT-PCR扩增的云南栘[木衣]的RNA。对其开展分子生物学研究提供技术支撑。 相似文献
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西番莲组织培养技术研究 总被引:1,自引:0,他引:1
以西番莲(Passiflora edulis Sims)种子及当年生实生苗幼嫩茎段为材料,进行茎段培养与胚乳愈伤组织诱导,结果表明:在MS+1.0mg/L 6-BA+1.0mg/L IBA培养基中,愈伤组织产生率最高,达66.67%,并且愈伤组织质地松软,颜色较绿。在MS+1.0mg/L 6-BA+0.05mg/L IAA中芽诱导率最高,为55.56%。在对胚乳愈伤组织诱导时,只有MS+1.0mg/L 6-BA+0.05mg/L NAA培养基中有愈伤组织产生,诱导出的愈伤组织呈嫩绿色,质地松软,继续培养有不定芽产生。 相似文献
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采用荧光AFLP标记技术,对采集于腾冲的3个自然类型90份腾冲红花油茶样本进行遗传变异分析,结果显示:7对AFLP引物扩增出697条带,多态性条带百分率(PPB)为100%,有效等位基因数(Ne)为1.361 4,基因多样性指数(H)为0.257 6,Shannon’s信息指数(I)为0.421 5,腾冲红花油茶具有较为丰富的遗传变异。在自然类型水平上,基因多样性指数(Hnfp)和Shannon’s信息指数(Infp)分别介于0.241 8~0.255 8和0.395 9~0.413 2之间,遗传多样性水平为单瓣类型半重瓣类型重瓣类型。3个自然类型之间的遗传分化系数(Gst)为0.034 5,与AMOVA分析结果一致(Φst=0.056),表明自然类型内不同个体的遗传差异是腾冲红花油茶遗传多样性的主要来源,需要对现存个体加强保护。基于Nei’s遗传距离的UPGMA聚类分析,将3个自然类型分为2个大组,其中单瓣类型独自构成一组,半重瓣类型与重瓣类型构成另一组。而基于单株之间Nei’s遗传距离的UPGMA聚类结果,将90个个体主要聚分为3个大组,较清晰地将3个自然类型分开,并表明半重瓣是单瓣和重瓣类型的过渡类型,且3种自然类型具有各自特有的遗传物质基础。因此,腾冲红花油茶划分为3种自然类型具有一定的科学性和合理性。 相似文献
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《果树学报》2017,(7)
【目的】分析‘红阳’猕猴桃全基因组AP2/EREBP转录因子家族。【方法】利用Kiwifruit Genome Database、EMBI、TAIR、SMART、Pfam、MEME、Protparam、SOPM、SWISS-MODEL、Signal P4.1 Sever网站,和Clustal X2、Bio Edit、MEGA6.0、Map Inspect、MEV软件,分析‘红阳’猕猴桃AP2/EREBP转录因子类型、结构域、系谱进化、蛋白理化性质及高级结构、信号肽分析、基因定位、序列元件和基因表达模式。【结果】‘红阳’猕猴桃全基因组中有204条AP2/EREBP转录因子,根据其结构域划分为4个亚家族。进行多序列比对和系谱进化分析,发现2个亚家族各分为6个亚组。生物信息学分析表明,204条蛋白氨基酸序列高级结构与拟南芥AP2/EREBP转录因子相似性较高。其中存在2条分泌型蛋白。基因定位表明,该家族基因在10号染色体无定位;有染色存在串联复制现象。同源拟南芥基因表达模式分析表明,AP2/EREBP转录因子对外界胁迫有显著性表达。【结论】利用生物信息学方法获得204条猕猴桃AP2/EREBP家族转录因子,并与拟南芥AP2/EREBP转录因子进行系谱进化、结构域、基因定位和同源表达等分析,结果表明猕猴桃AP2/EREBP转录因子在进化过程中比较保守,并参与了植物发育和胁迫应答调控。 相似文献
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为了探讨光合基因PsrbcL的表达模式与杨树(Populus spp.)生长速率的关系,对扦插于同一生境下的西南乡土杨树种康定杨(Populus kangdingensis)、乡城杨(Populus xiangchengensis)、三脉青杨(Populus trinervis)和大叶杨(Populus lasiocarpa)扦插无性系地径、苗高及其PsrbcL基因的表达模式进行了测定分析。结果显示,4种杨树在6和8月份的苗高和地径绝对生长量的综合生长指标从大到小为康定杨>乡城杨>三脉青杨>大叶杨,而PsrbcL基因在每种杨树中6和8月份的表达增加量与生长指标的趋势一致,说明PsrbcL基因的表达量与该4种杨树生长速率具有较好的正相关性。因此,PsrbcL基因的表达模式可作为4种杨树生长速率的一个重要参考指标,本研究结果可为西南乡土杨树种的引种栽培及生产利用提供理论依据。 相似文献
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二氢硫辛酰胺脱氢酶(DLD2)是一种广泛存在于各种生物而且在能量代谢中起到重要作用的氧化还原酶,植物体内抗氧化酶在清除活性氧的过程中发挥重要作用,通过调控中华猕猴桃酶活性水平从而提高抗旱性。为了探究DLD2基因在中华猕猴桃这种不耐旱树种的功能,本研究使用同源物种分析法对中华猕猴桃转录组中的二氢硫辛酰胺脱氢酶(DLD2)基因序列进行分析,利用网上在线分析工具分析其编码蛋白质的结构并预测其功能。研究结果表明,该核苷酸序列的开放阅读框为1 605 bp,可编码534个氨基酸,丙氨酸所占比例为9.9%、甘氨酸所占比例为9.4%以及脯氨酸所占含量为3.9%;在亲疏水性分析中得出该基因编码的蛋白是一个亲水性蛋白;跨膜结构分析中也得出该蛋白全部位于细胞膜外部,不含有跨膜结构;蛋白质motif搜索中,也得出含有氧化还原酶位点,使得该基因中酶的活性大大提高;结构域中存在Pyr_redox结构域,它属于吡啶核苷酸二硫键氧化还原酶,初步推测对中华猕猴桃能起到氧化代谢作用。该研究结果可为后续的基因功能确证以及中华猕猴桃品种改良提供了依据。 相似文献
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云南松不同类型群体种子形态及萌发特征比较 总被引:1,自引:0,他引:1
为了探究云南松通直和扭曲天然群体表型变异规律,对2种类型群体的种子形态及其萌发特征进行比较.结果表明,云南松种子性状的平均表型分化系数为9.87%,表型变异主要来源于群体内.群体内各种子性状均存在极显著的差异,群体间除了种翅长度外,其他均存在显著或极显著的差异,2种类型群体间的种子重量不存在显著差异,通直群体的种子形状指数高于扭曲群体,但种翅形状指数低于扭曲群体.从萌发特征来看,2种类型群体的发芽过程相似,通直群体的发芽率、发芽势和日均发芽率稍高于扭曲群体,由此表明,在相同条件下,云南松通直群体在种子萌发初期具有一定的优势. 相似文献
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