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使用ITS、ITS2、psbA-trnH、rbcL和matK等序列对截获的10种苍耳属(Xanthium)杂草进行扩增测序,比较各序列的扩增和测序效率,采用最近距离法和相似性搜索算法评价不同序列的鉴定效率。采用最佳鉴定序列计算种间K2P距离并构建系统进化树。结果表明,ITS、psbA-trnH2个序列的扩增效率和鉴定效率最高;ITS序列的种间变异最大,其次是psbA-trnH序列,matK序列的种间变异最小;ITS序列的NeighborJoining(NJ)树可明显地将不同苍耳属杂草种分开;psbA-trnH序列可明显地将国内苍耳种和检疫性苍耳种分开。说明利用DNA条形码能够准确地鉴别苍耳属杂草,ITS和psbA-trnH序列是鉴别苍耳属杂草较理想的条形码组合。该研究结果为苍耳属杂草的分子鉴别提供了科学依据与新的思路。 相似文献
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从进境美国苜蓿干草中发现带有褐色至黑色斑点的苜蓿草茎杆,经保湿培养,在病部表面形成分生孢子器,球形或近球形,褐色至黑色,孔口边缘着生刚毛。分生孢子透明,光滑,单细胞,近圆柱形至卵圆形。在PDA上,菌落初为黄褐色,后转为橄榄绿色,气生菌丝体稀疏,边缘不规则,表面呈绒状,有褶皱,背面呈橄榄绿色。培养5 d后开始产生分生孢子器。培养过程中有厚垣孢子产生和微循环产孢现象,菌丝束浅棕色。Blast分析表明,从分离物基因组中扩增到的ITS基因与Gen Bank中已知的帚状刺壳霉(Chaetopyrena penicillata(Fuckel)Hhn.1918)菌株的ITS序列同源性达99%~100%,基于ITS基因序列的系统发育分析显示分离物与帚状刺壳霉(C.penicillata)聚在同一簇。综合形态学特征、培养性状及ITS序列分析,将分离物鉴定为帚状刺壳霉(Chaetopyrena penicillata(Fuckel)Hhn.1918),此为我国口岸首次截获。迄今为止,除伊朗和南非外,世界其他国家和地区尚未有该病菌在苜蓿草上发生为害的报道。 相似文献
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葡萄卷叶病是葡萄上一种重要的病毒病,在国内分布较为普遍,引起该病的葡萄卷叶伴随病毒(Grapevine leafroll-associated virus,GLRaV)是由多种病毒单独或复合侵染造成.已报道的GLRaVs至少有5种,其中GLRaV-3是葡萄卷叶病毒属Ampleovirus典型成员(Ling et a1.,2004).目前,检测GL-RaV-3的方法主要有指示植物法、酶联免疫吸附法、分子生物学检测法等,而这几种技术均存在不足.SYBR Green Ⅰ实时荧光RT-PCR技术关键要避免引物之间、引物与其它模板之间的非特异性互作干扰.由于DPO引物自身以及引物之间很少形成二级结构且对退火温度不敏感等特点(Chun et al.,2007),因此,本研究结合SYBR Green和DPO引物的各自优点,建立一种特异性强、灵敏度高的GL-RaV-3检测方法,以期为葡萄卷叶病毒的快速检测及预防提供技术支持. 相似文献
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[目的]建立一种快速、灵敏的重组酶聚合酶扩增技术(RPA)检测葡萄卷叶伴随病毒3(Grapevine leaf-roll-associated virus3,GLRaV-3)方法.[方法]根据GLRaV-3已测序和已报道的HSP7O基因(Heat shock protein 70)保守序列,设计用于RPA检测的特异性引物,建立GLRaV-3的RPA检测方法,并对其特异性和灵敏度进行验证.[结果]建立RPA检测方法能够从GLRaV-3带毒株中检测到约380 bp的特异性条带,仅需在37℃下恒温反应40 min,无需特殊的仪器设备,经特异性评价特异性好,且该方法与普通PCR检测灵敏度基本一致.[结论]建立的RPA检测方法特异性强、灵敏度高,无需特殊的仪器设备,适合GLRaV-3的快速检测方法. 相似文献