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171.
靶向测序基因型检测(GBTS)技术及其应用 总被引:2,自引:0,他引:2
借助于分子标记进行基因型检测的技术在生物遗传改良等领域发挥着重要的作用。国际跨国种业公司凭借其高通量、自动化、大规模的共享检测平台,基因型检测技术得到广泛应用。随着从3G时代的高成本固相芯片和随机测序式基因型检测(genotyping by sequencing,GBS)发展到成本低、对检测平台要求较低、基于靶向测序基因型检测(genotyping by target sequencing,GBTS)的液相芯片,基因型检测技术完成了向4G时代的转变。在本文中首先介绍了两项最新的GBTS技术(基于多重PCR的GenoPlexs和基于液相探针捕获的GenoBaits)及其原理。同时,发展了可以在单个扩增子内检测多个SNP,称之为多聚单核苷酸多态性(multiple single-nucleotide-polymorphism cluster,mSNP或multiple dispersed nucleotide polymorphism,MNP)的技术,极大地提高了目标位点(扩增子)内变异的检测效率。与GBS和固相芯片相比,GBTS技术具有平台广适性、标记灵活性、检测高效性、信息可加性、支撑便捷性和应用广谱性。同一款标记集(例如玉米40K mSNP),可以获得3种不同的标记形式(40K mSNP、260K SNP和754K单倍型);并可以根据应用场景的需求,通过控制测序深度获得多种不同的标记密度(1—40K mSNP)。GenoPlexs和GenoBaits 2种技术相结合,可广泛应用于生物进化、遗传图谱构建、基因定位克隆、标记性状关联检测(全基因组关联分析——GWAS和混合样本分析——BSA)、后裔鉴定、基因渐渗、基因累加、品种权保护、品种质量监测、转基因成分/基因编辑/伴生生物检测等领域。目前,已经在20余种主要农作物、蔬菜以及部分动物和微生物中开发了GBTS标记50余套,并已广泛应用于上述领域。最后,展望了与未来GBTS应用相关的几个问题,包括便携式、自动化、高通量、智能化检测平台;根据用户需求定制的可变密度、多功能分子检测;GBTS与其他技术(KASP、高密度芯片、BSA策略等)的整合;基于资源共享的开源育种等。这些将推动GBTS技术在动物、植物和微生物遗传改良等领域的广泛应用。 相似文献
172.
总结了《河南农业大学学报》在河南农业大学百年发展史上的重要作用,认为推动了科学研究的发展,促进了特色学科的形成,在坚守学术阵地、发现人才和培养人才方面作出了重要贡献. 相似文献
173.
174.
用杂色云芝产的漆酶粗酶液进行了对对苯二酚的降解及降解动力学的研究。结果表明:杂色云芝漆酶粗酶液对对苯二酚有较强的降解能力;杂色云芝漆酶粗酶液对对苯二酚的降解反应符合一级动力学特征。在不同的底物浓度下,具有不同的方程参数值。 相似文献
175.
构建了亮白曲霉来源的β-半乳糖苷酶活性中心的第219位丝氨酸的毕赤酵母饱和突变体库以筛选水解活性提高的乳糖酶。另外,通过以毕赤酵母发酵基础盐诱导培养基代替传统的BMMY培养基来诱导表达β-半乳糖苷酶和其突变体。结果表明,诱导时间在48~60 h且粗酶液中总蛋白量在0.2~0.8 mg/mL时,各乳糖酶的活力均高于其在BMMY培养基中的活力;各乳糖酶的比活力在此阶段保持相对稳定,且与纯化后的酶比活力呈正相关,即各乳糖酶的比活力高低可以粗酶液中乳糖酶的比活力来相对定量。在此基础上,利用高通量的48孔培养板创建了一种简便、高通量从β-半乳糖苷酶突变体库中筛选高水解活力乳糖酶的方法,并应用该方法快速地从突变体库中筛选到3个水解活力显著提高的突变体S-38、S-35和S-1,比活力分别提高了10.3%,9.2%和6%,高通量的筛选方法是定向进化技术中的重要环节,为其顺利开展奠定了基础。 相似文献
176.
采用子房注射法对‘紫宝石’蝴蝶兰进行外源DNA导入研究,结果表明:不同时期注射和不同注射处理方式对‘紫宝石’蝴蝶兰的落果率影响不同,对胚座组织和种子的GUS染色率的影响也不同,在授粉后65 d时,以2%DMSO为缓冲液,注射400μg/mL浓度质粒,种子的GUS染色率最高达6.14%。选取各注射时期无菌播种后获得的1 000个原球茎,经系列浓度的潮霉素筛选,结果发现授粉后65 d注射时获得的抗性植株最多,为31株,转化率为3.1%。切取转化植株幼叶及幼根进行GUS检测,均为阳性;随机挑选7株幼苗进行PCR检测,均能扩增出GUS基因和HPT基因条带,说明外源基因已经整合到植株的基因组内。此研究为兰科植物育种提供了一种简单高效的途径。 相似文献
177.
178.
兜兰新品种‘文菲’是以文山兜兰(Paphiopedilum
wenshanense)优良株系为母本,菲律宾兜兰(Paph. philippinense)优良株系为父本人工授粉杂交育成,为斑叶类兜兰盆花品种。叶面浅绿色,具深绿色斑纹,叶背绿褐色,平均长16.5
cm、宽3.3
cm。花葶紫褐色,平均长9.8
cm,平均花朵数3朵;花朵平均横径7.2
cm,纵径7.6
cm。中萼片椭圆形,先端渐尖,黄色具紫褐色网状纹;花瓣长椭圆形,黄色具紫褐色纵条纹;唇瓣盔状,黄绿色。主花期4-5月,单朵花寿命25
~ 30 d。 相似文献
179.
兜兰新品种‘春韵’是以报春兜兰(Paphiopedilum
primulinum)优良株系为母本,文山兜兰(Paph. wenshanense)优良株系为父本,人工授粉杂交选育而成。叶面墨绿色,有明显的白色斑纹,叶背绿色,平均长14.6
cm、宽3.2
cm。花葶近直立,深绿色,平均长7.8
cm,平均花朵数2.5朵;花朵平均横径和纵径均为7.5
cm。萼片和花瓣黄绿色,具紫褐色小斑点;唇瓣盔状,黄绿色,具紫褐色细小斑点;退化雄蕊黄绿色,中央深绿色。花期3-8月,单朵花寿命30
~ 35 d。 相似文献
180.