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芝麻AQP家族的全基因组序列鉴定及其特征分析 总被引:1,自引:0,他引:1
【目的】从芝麻全基因组中分离鉴定水通道蛋白AQP(aquaporin)家族基因,并进行系统进化关系、连锁群定位、基因结构、跨膜结构域和亚细胞定位预测、保守性氨基酸残基以及青枯雷尔氏菌诱导表达分析,为芝麻AQP的功能研究与利用奠定基础。【方法】通过生物信息学手段,结合芝麻基因组注释信息,鉴定芝麻AQP家族成员序列信息,并用InterPro逐一进行验证。利用ClustalW2对芝麻、拟南芥和水稻的AQP以及马铃薯的XIPs进行多序列比对,用MEGA6.0构建进化树。通过MapInspect和Gene Structure Display Server 2.0进行连锁群定位和基因结构分析。采用ProtParam、WoLF PSORT和TMHMM Server v.2.0在线工具预测芝麻水通道蛋白的分子质量和等电点、亚细胞定位及跨膜结构域。通过芝麻、拟南芥和水稻AQP及马铃薯XIPs的蛋白多序列比对结果推测NPA基序、ar/R滤器及P1-P5的氨基酸残基。利用前期研究获得的转录组测序结果进行青枯雷尔氏菌诱导表达分析,并通过qRT-PCR技术对差异表达较为明显的12个芝麻AQP进行验证。【结果】系统分析鉴定了36个芝麻AQP家族基因,根据多序列比对及系统进化分析将其分为5个亚家族:13个质膜内在蛋白(PIP)、12个液胞膜内在蛋白(TIP)、8个类NOD26膜内在蛋白(NIP)、2个膜内在小分子碱性蛋白(SIP)和1个未知内在蛋白(XIP),其中有34个基因定位在12个连锁群上。同一亚家族成员在基因结构、蛋白序列、亚细胞定位预测及保守性氨基酸残基等方面都较为相似。青枯雷尔氏菌诱导表达分析显示,NIPs、SIPs和XIPs表达无明显变化,部分PIPs和TIPs能够响应青枯菌诱导。SiPIP1;2、SiPIP1;3、SiPIP2;3和SiPIP2;4受青枯菌诱导后表达上调,SiPIP1;3和SiPIP2;3为持续上调,而SiPIP1;2和SiPIP2;4的表达先下调后上调;与之相反,表达下调较为显著的有SiPIP1;4、SiPIP2;1、SiPIP2;6、SiTIP1;1、SiTIP1;3、SiTIP2;1及SiTIP2;2。上述差异表达基因的qRT-PCR验证结果与转录组测序结果一致。【结论】通过全基因组分析,在芝麻中鉴定出36个AQP家族基因,分为5个亚家族,分布于12个连锁群上,大部分基因具有1-4个内含子(除SiNIP1;2有7个内含子外)。根据ar/R滤器和P1-P5氨基酸残基组成类型,预测不同亚家族AQP可能识别的底物。青枯菌诱导表达分析表明,部分PIPs和TIPs成员的表达发生了显著变化。 相似文献
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昆山市几种药剂防治稻纵卷叶螟试验研究 总被引:1,自引:0,他引:1
为筛选杀虫单、毒死蜱及其复配剂的替代药剂及能防治高龄幼虫的补救药剂,2012年在单季机直播稻田进行了几种药剂防治五(3)代稻纵卷叶螟试验.结果表明,每667 m2用30%甲维盐·茚虫威水分散剂8 g对稻纵卷叶螟低龄幼虫具有良好防效,在施药后4h即遇较强降雨的情况下,药后12d杀虫、保叶效果仍分别达82.03%和88.22%,明显好于对照药剂30%甲维·毒死蜱.每667 m2用10%阿维·氟酰胺(稻腾)40 g对稻纵卷叶螟3~4龄高龄幼虫也有较好防效,药后7 d杀虫效果为70.59%,且施用该药后受害叶不再明显增加,白叶率稳定在70%左右. 相似文献
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吴向阳 《信阳农业高等专科学校学报》2000,10(3):45-47
目前 ,我国农村市场的低迷已成为制约国民经济持续、稳定增长的重要原因之一 ,而农民收入增长迟缓是农村市场低迷的根本原因 ,其它影响因素也是因为农民收入问题而引起。要开拓农村市场 ,应采用“单一收入规则” ,加快农民收入增长 ,解决近年来农民收入增长减缓的问题。 相似文献