新疆番茄病毒病检测及南方番茄病毒全基因组序列测定与传播特性分析

为了解新疆番茄上病毒病的发生情况,利用一步法RT-PCR技术检测了南北疆番茄上南方番茄病毒(Southern tomato virus,STV)、黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、番茄花叶病毒(Tomato mosaic virus,ToMV)以及马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)的感染情况,并利用分段克隆的方法进行全基因组测序,通过RT-PCR方法检测健康植株与携带病毒植株杂交育种的F1代植株带毒率以分析STV的种子传播特性。结果显示,新疆番茄上CMV、STV、ToMV和PVY在北疆的检出率分别为52%、37%、27%和14%;在南疆的检出率分别为79%、60%、69%和0;且以STV、CMV及ToMV的复合侵染为主。从我国加工番茄上首次获得了长3 437 nt的STV SHZ-1核苷酸序列,序列比对分析发现其与已报道STV只有1~9个核苷酸的变异,且序列变异与地域无相关性。分析杂交F1代加工番茄植株上STV的传播特性,发现其除可由种子传播外,也可通过花粉传播。表明STV是侵染新疆番茄的主要病毒之一,且该病毒可通过种子或杂交育种途径进行传播。     

新疆西瓜花叶病毒2号遗传变异的PCR-SSCP分析

新疆地域广阔,各地气候条件差异大.西瓜、甜瓜在新疆种植面积较广,其病毒病的发生和危害较重.西瓜花叶病毒2号(Watermelon mosaic virus 2,WMV-2)是致病的主要毒源之一.前人对WMV-2的研究仅限于病原鉴定以及它对瓜类氨基酸的影响,而对它的遗传变异未做研究.为了深入研究新疆不同地域WMV-2致病性的差异,有必要弄清楚新疆的WMV-2有无遗传变异的发生.PCR-SSCP是一种基于PCR的单链构象多态性(single-stranded conformation polymorphism)分析技术,主要用于DNA已知突变的检测或未知变异的分析[1].     

新疆石河子、伊宁地区黄瓜花叶病毒株系分化

为了研究新疆黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)分子变异及株系分化,对从石河子和伊宁地区采集的205个加工番茄、23个辣椒、4个番茄、2个南瓜样品进行酶联免疫检测和RT-PCR检测.在4种寄主上均检出了亚组Ⅰ型CMV,其中加工番茄的感染率高达74.15％.进一步对来自辣椒的YN-6、LJ-4、L-10,加工番茄的S1-1、S1-14,番茄的YN-2,以及南瓜的YN-9等7个样品CP、RNA3、MP核苷酸序列进行相似性和进化树分析.7个样品与CMV亚组ⅠB株系分离物的相似性较高、亲缘关系最近,均可归为CMV亚组ⅠB.而来自辣椒的LJ-4、L-10与其余5个样品的序列相似性较低,亲缘关系较远,在进化树上形成独立分支.说明在新疆加工番茄及其它蔬菜上广泛流行的CMV存在分子变异.     

新疆石河子及新湖籽用西葫芦病毒病分子检测

以新疆石河子以及新湖总场籽用西葫芦为研究对象,通过观察田间症状并采用RT-PCR方法,研究了籽用西葫芦发病情况。结果表明:籽用西葫芦病毒病田间症状主要表现有花叶型、黄化型、畸形和蕨叶型4类,其中花叶型最普遍。检测出的病毒主要有黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV)、小西葫芦黄瓜花叶病毒(zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)、西瓜花叶病毒(watermelon mosaic virus,WMV)和番木瓜环斑病毒(papaya ringspot virus,PRSV-W),4种病毒的总检出率分别为33.3%、84.8%、75.8%和21.2%;其中,样品受2种及以上病毒复合侵染检出率达66.7%,主要以ZYMV+CMV、ZYMV+WMV、ZYMV+CMV+WMV+PRSV-W复合侵染为主。     

北疆马铃薯黄矮病发生及危害情况调查

马铃薯是新疆重要的经济作物之一,在生产中马铃薯植株出现黄化矮化现象明显,严重影响了产量.为了摸清马铃薯黄矮病发生及危害情况,于2006～2007年对新疆天山以北乌鲁木齐、沙湾、奇台、玛纳斯、克拉玛依、奎屯、阿勒泰、伊犁和塔城等主要马铃薯种植区的马铃薯黄矮病进行了调查,典型症状为:植株极端矮化偶伴有顶端丛生,由新叶向老叶黄化,病薯块茎小而轻,出现龟裂,表面凹凸不平.其发病率为22;～80;,病情指数为0.19～27.56.对上述调查结果从种植地区海拔高度、马铃薯品种、栽培管理、栽培土壤的方面进行了分析.同时,通过对马铃薯黄矮病的发病情况和近3年马铃薯产量分析,初步了解马铃薯黄矮病的危害程度并做出病害损失估计.     

莫索湾垦区不同滴灌年限及不同水质灌溉棉田盐分运移规律研究

为分析莫索湾垦区不同滴灌年限及不同水质灌溉棉田膜下滴灌盐分的运移规律,从不同土壤质地、不同生育时期、水平方向不同土层、垂直方向不同土层、总盐含量与产量间关系等5个方面对膜下滴灌盐分的运移进行了分析比对,初步得出:黏土中的盐分积累最重,壤土中次之,砂土积累最少;随着生育时期的推后,各土层含盐量都有不同程度的加大;水平方向露地行中央土层盐分积累最多,滴头处盐分积累最少;垂直方向盐分的积累在0-60cm土层逐渐增加,60-100 cm土层盐分积累受膜下滴灌影响较小;总盐含量越高产量下降越严重;总体来说,井水灌处理要比河水灌各处理积盐多.分析认为,井水与河水轮灌,定期大水漫灌洗盐,恢复排碱渠功能以及合理的轮作是土壤脱盐的必要手段.     

利用PCR-SSCP对新疆甜菜坏死黄脉病毒RNA2变异的研究

应用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和单链构象多态性(SSCP)分析技术,对新疆不同地区的甜菜坏死黄脉病毒(BNYVV)RNA2的区间进行分析,12个BNYVV分离物和美国的BN-TX及我国黑龙江的He分离物通过RT-PCR扩增后都能得到一段590bp左右大小的片段;通过SSCP分析,12个分离物既不同于美国的BN-TX分离物,也不同于黑龙江的He分离物,可分为4个变异类型,S1和S2归为Ⅰ类,T3、T6、T7和T8归为Ⅱ类,K1、K2、K4和K5归为Ⅲ类,Q1和Q2归为Ⅳ类,初步明确了新疆BNYVV分离物存在着分化,而且有明显的地域分布性。     

薄荷组织培养及抗除草剂基因的遗传转化

薄荷(Mentha haplocalyx Briq.)是一类用途广泛的中药材,是世界三大香料之一,也是我国重要的经济作物。以薄荷茎段为外植体,建立高效的薄荷离体培养植株再生体系,确定草甘膦筛选的选择压,并将带除草剂标记的植物表达载体p BI121-Ubi-epsps通过农杆菌介导转化薄荷,用PCR和RT-PCR法对转化薄荷进行分子鉴定。结果表明,薄荷对除草剂草甘膦的最适筛选浓度为10 mg/L,通过分子鉴定确定转基因薄荷已获得。试验结果对后期杂种优势的利用、种质资源的保存以及植物新品种的培育奠定基础,具有重要的理论与实践意义。     

侵染新疆加工番茄的中国番茄黄化曲叶病毒 DNA-A的基因组特征

 从新疆加工番茄上分离到病毒分离物XJ26-4,对其基因组DNA-A 全序列测定表明,XJ26-4 DNA-A 全长2 737 个核苷酸(GenBank 登录号:FN985163),具有典型的双生病毒基因组特征。进一步序列比较发现,XJ26-4 DNA-A 与中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl China virus, TYLCCNV)各分离物的同源性最高,达到91. 2% ~ 99. 5% ,而与其他双生病毒的序列相似性均在79. 5% 以下,表明XJ26-4 是TYLCCNV 的一个分离物。这是首次明确新疆加工番茄受到粉虱传双生病毒的侵染。