基于全基因组信息鉴定中国荷斯坦牛产奶性状基因及功能注释

前期研究基于中国荷斯坦牛女儿设计资源群体,采用Illumina公司Bovine50K微珠芯片对产奶性状进行了全基因组关联分析(GWAS),利用传递不平衡(L1-TDT)和回归分析(MMRA)2种统计分析方法共同检测到35个显著SNPs位点。本研究旨在基于该GWAS结果进一步对产奶性状基因进行鉴定及功能注释。基于牛基因组序列草图(Btau4.2),采用生物信息学和比较基因组学方法进行显著SNPs位置候选基因筛查和功能预测。分析发现,12个SNPs位点位于基因内部,23个位于基因侧翼,最终鉴定到28个位置候选基因,并确定了其物理位置、基因类型及潜在功能。基因功能可归纳为6种类型:调节机体营养成分代谢和平衡、细胞骨架或基质成分、调节细胞增殖和周期及凋亡、参与细胞信号转导和盐离子通道构成、具有激酶活性、参与mRNA转录调控或翻译调控。该研究为进一步鉴定中国荷斯坦牛产奶性状主效基因及功能验证打下了基础。     

乌饭树果实中氨基酸种类及含量的地理差异分析

性状和遗传资源的地理多样性是野生种质资源利用的基础。为给乌饭树遗传资源的选优和开发利用奠定理论基础,分别于江苏宜兴、湖南浏阳、江西萍乡和赣州峰山4个地区采集成熟的乌饭树果实,对其果实中氨基酸的成分和含量进行了测定与分析。结果表明:4个地区所产乌饭树果实中含有17种氨基酸,所含氨基酸的种类齐全;氨基酸总含量为16.66～32.34 mg/g,极差值为15.68 mg/g,不同地区的果实样本中氨基酸含量的大小顺序为:湖南浏阳>江西萍乡>江苏宜兴>赣州峰山。在4个地区的果实样本中,人体必需氨基酸含量与氨基酸总量的比值以及人体必需氨基酸含量与人体非必需氨基酸含量的比值均未达到1973年FAO/WHO提出的理想蛋白质的标准,但均与之接近;其鲜味谷氨酸含量均最高,鲜味氨基酸∶甜味氨基酸∶苦味氨基酸的含量比接近1∶1∶1,表明果实风味独特;药用氨基酸含量与氨基酸总量的平均比值为0.617,说明其药用氨基酸含量较丰富;呈味类氨基酸含量与氨基酸总量的平均比值为0.95,说明其呈味类氨基酸的含量亦十分丰富;药用氨基酸与呈味氨基酸的含量均存在明显的地理差异性,其在湖南浏阳和江西萍乡地区的含量相近,且均远高于其在江苏宜兴和赣州峰山地区的含量,17种氨基酸中每种氨基酸含量的地理差异情况均与之相同。乌饭树果实中人体必需氨基酸、呈味类氨基酸的含量和氨基酸总量均远远高于苹果、蓝莓和巴旦杏果实,其果实中所含氨基酸的种类比同属植物蓝莓的多。不同产地的乌饭树果实中氨基酸的含量均丰富,并且其氨基酸总量、药用氨基酸、呈味类氨基酸、人体必需氨基酸等不同种类氨基酸含量的高低顺序均为江西萍乡≈湖南浏阳>江苏宜兴>赣州峰山,表明江西萍乡和湖南浏阳均为乌饭树果用遗传资源优选的重点区域。     

猪干扰素基因研究进展及其在抗病育种中的应用展望

<正>1前言1957年Isaacs和Lindenman在进行鸡胚细胞流感病毒感染试验中首次发现一类能干扰和抑制病毒复制的可溶性细胞分泌物,故取名为干扰素。Wheelock与Green分别于1965年和1969年相继发现免疫活性细胞经丝裂原或抗原刺激后,产生一类对     

秋子梨的果皮结构与果实的耐贮性

以贮藏性较好的花盖梨和贮藏性较差的尖把酸梨为试材, 研究其果皮表面结构和细胞壁组分变化与果实耐贮性的关系。结果表明: ( 1) 花盖梨果皮存在大量细小裂纹; 尖把酸梨果皮存在大量瘤状物, 裂纹少但有大量破损面, 破损面处胞间连接已完全破坏并出现空洞。(2) 尖把酸梨腐烂率极高, 果实硬度下降快, 乙烯释放高峰时间早且峰值高, 细胞壁中纤维素含量低且下降速度快, 原果胶含量低而水解速度快, 果实品质的劣变较快。     

全球生猪和猪肉贸易概述

由于韩国、日本、美国及墨西哥的强劲需求 ,1 999年全球猪肉出口总量增长了 1 3%。预计在2 0 0 0年 ,虽然俄罗斯对猪肉的进口需求有所下降 ,但是亚洲地区猪肉进口量逐步加大 ,因此全年猪肉出口量的降低幅度不会超过 1 %。1 999年全球主要猪肉生产国 (本文所涉及国家及地区 )的猪肉产量增幅大约为 2 %。产量增加最大的是加拿大 ,美国、巴西及欧盟略有增加。虽然美国、欧盟和东欧的生产会有所下降 ,但中国、巴西及加拿大的猪肉生产将继续保持增长的势头 ,因此 ,2 0 0 0年全球的猪肉产量将增长 1 %左右。由于供应充足 ,价格低廉 ,1 999年本文所…     

平欧杂交榛转录组中SSR信息分析和引物筛选

对平欧杂交榛的转录组数据进行了深入挖掘,以期开发其SSRs标记。在25 649条含SSR序列的Unigene中,共找到35 604条SSR序列;其中,单、二、三核苷酸重复为高频类型,其数量及所占百分比分别为：10 102（28.37%）、16 543（46.46%）、7 035（19.76%）;在单核苷酸重复中,A/T重复最多（28.13%）;二核苷酸重复中,AG/CT（35.79%）、AT/AT（7.47%）、AC/GT（3.17%）最为丰富;三、四、五、六核苷酸重复中,比例最高的重复序列分别为：AAG/CTT（7.24%）、AAAG/CTTT（0.33%）、AAAAG/CTTTT（0.38%）、AAAAAG/CTTTTT（0.15%）。依据转录组中的SSRs序列信息,随机合成了60对引物,并对含平榛（Corylus heterophylla Fisch）、平欧杂交榛（C. heterophylla × C. avellana）、欧洲榛（C. avellana）及毛榛（C. mandshurica Maxim.）的25份材料进行了PCR扩增和毛细管电泳,找到7对多态性良好的引物,其PIC（Polymorphism Information Content）值为0.35 ~ 0.70,获得多态性条带52条;UPGMA（Unweighted Pair Group Method Analysis）聚类结果显示,上述引物可将这些种质进行准确区分。以上研究初步明确了平欧杂交榛转录组中SSR的分布特征,为其遗传连锁图谱构建等研究提供了科学依据。     

周岁细毛羊羊毛长度、产毛量与体质量的全基因组关联分析

为检测影响周岁细毛羊羊毛长度、毛量及体质量性状的基因组区域,利用OvineSNP50BeadChip对365只中国美利奴(新疆型)个体基因分型,并采用single-locus回归方法进行全基因组关联分析。通过基因组水平的Permutations校正,检测到2个与羊毛长度及3个与毛量显著关联的SNPs。这些SNPs分别邻近5个已知基因(9.16~143.32kb)。其中FIBIN、HSD17B11及PIAS1 3个基因参与羊毛生长、发育相关的生物学过程,且均包含于已知羊毛性状相关QTL区域内,为所检测到的关联结果提供进一步证据。对这些目标区域的进一步研究有助于揭示细毛羊羊毛长度、产量等性状的遗传机理。     

利用植物叶绿体表达重组药用蛋白和疫苗研究进展

植物是医用药物的重要来源之一,约占整个医用药物市场的1/4以上。现代生物技术的发展进一步拓宽了植物在医药领域的应用范围,许多具有重要应用价值的重组药用蛋白在植物中获得成功表达,部分重组药用蛋白已进入商业化应用阶段。与其他重组药用蛋白生产系统相比,植物叶绿体生产系统具有独特的优势,如外源基因的高效和稳定表达、多基因表达、环境安全等。利用植物叶绿体表达系统生产的重组药用蛋白和疫苗已达40多种。本研究对近年来利用叶绿体表达重组药用蛋白和疫苗的研究进展进行了综述,并就植物叶绿体表达重组药用蛋白方面的几个问题进行了探讨。     

基于环境一号卫星数据的洞庭湖叶绿素a浓度反演

通过星地同步地面试验,建立起洞庭湖水体的叶绿素a浓度遥感反演模型,运用2011年4月~2012年4月的多期环境一号卫星CCD数据,对洞庭湖叶绿素a浓度进行动态监测和分析。结果表明:环境一号卫星CCD数据第三通道(HJ3)反射率与第二通道(HJ2)和第四通道(HJ4)反射率之和的比值与洞庭湖水体叶绿素浓度具有较高的相关性,从而构建基于环境一号卫星多光谱数据的洞庭湖叶绿素a浓度反演模型;采用多期环境一号卫星CCD数据对洞庭湖的叶绿素a浓度进行了连续监测,较好地反映了洞庭湖叶绿素a的时空分布变化。