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构建包含了7 680个克隆子的橡胶林土壤宏基因组文库,76.2%的质粒含有外源DNA,插入片段的平均大小约为4.3 kb,DNA文库的容量约为32.25 MB.随机挑取20个克隆子进行测序,NCBI的Blastx分析结果发现,3号与不能培养的微牛物(Candidatus Kuenenia)有一定的同源性.5号与Rickettsiella grylli的同源性达83%,可以初步推断其功能为吡哆醛生物合成裂解酶Pdxs.11号和16号与分类地位尚未确定的细菌(Solibacter)有同源性,随机测序的这20个序列中,部分序列除与裂解酶、蛋白酶、激酶等蛋白有一定的同源性外,有5个与功能尚不清楚的蛋白有一定的同源性,其中13号与假定蛋白pEA 28_O1的同源性达100%. 相似文献
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樱桃主栽品种的遗传多样性分析 总被引:10,自引:2,他引:8
利用24对SSR引物对30个樱桃主栽品种进行遗传多样性分析, 以了解樱桃产区的资源多样性状况, 为种质资源的开发和利用提供帮助。结果表明: 樱桃产区具有丰富的遗传变异。SSR的遗传多样性指数的分布范围为1.3647~2.9964, Simp son指数分布范围为0.6111~0.9326。30个品种的分子数据聚类结果均呈现一定的地理分布规律。根据系统聚类分析将30个樱桃品种分为两大类: 欧洲甜樱桃和中国樱桃, 与传统分类学的结果相符。同时在两大类内又将品种进行细分, 第Ⅰ类分为3组, 第Ⅱ类分为2组,其结果与地理分布有一定的相关性, 能够反映樱桃的遗传特点及区域特性。 相似文献
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铁元素是大多生物体的必需元素之一,嗜铁素是一类对Fe3 有极强吸附性的小分子化合物的螯合因子,在促进植物生长及病害防治方面都起着重要的作用,并且与赤潮的发生有一定的关系。综述了嗜铁素在促进植物生长及病害防治方面的作用,在赤潮研究方面的应用,嗜铁素产生菌的筛选,并对嗜铁素的应用进行了展望。 相似文献
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苹果苦痘病已困扰多年,但其发生机制仍不明确。本研究通过全转录组分析,比较了苹果健康果实、苹果苦痘病果、病果病斑部位和病果无病斑部位中可能与苹果苦痘病发生相关的差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),研究了苹果苦痘病的可能发生机制。经全转录组测序,GO功能注释和KEGG通路富集分析,筛选出17个可能与苹果苦痘病发生相关的差异表达基因。RT-qPCR 验证结果显示,与苹果健康果实或病果无病斑部位相比,17个DEGs中,3个涉及植物-病原互作通路的DEGs(CDPK26, WRKY26 和ADP/ATP carrier)在苹果苦痘病果和病果病斑部位中均表现上调;2个涉及细胞凋亡通路的 DEGs(TUBA和CTSF)和1个涉及类黄酮生物合成通路的 DEG(RGA4)均表现下调,表明,苹果苦痘病的发生促进了基因CDPK26、WRKY26和ADP/ATP carrier的表达,抑制了基因TUBA、CTSF和RGA4的表达,说明,涉及植物-病原互作、细胞凋亡和类黄酮生物合成相关的基因,在苹果苦痘病发生过程中发挥着重要的作用。 相似文献
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山东板栗遗传多样性分析 总被引:4,自引:0,他引:4
利用29对SSR引物对26份山东主栽板栗品种进行遗传多样性分析,以了解山东板栗的遗传多样性分布情况,为种质资源的利用和开发提供依据。结果表明,SSR的遗传多样性指数的分布范围为1.2720~2.9500,Simpson指数分布范围为0.5517~0.9409。可见,山东板栗具有丰富的遗传变异。根据系统聚类分析将26个板栗品种分为3大类。同时在3大类内又将品种进行细分,第Ⅰ类全部为胶东地区的材料,第Ⅱ类为鲁中南地区和泰沂山区的材料,分为3个亚类,第Ⅲ类只含有8019份材料,其结果说明山东的3个板栗主产区内部的品种或种质间亲缘关系较近,鲁中南地区和泰沂山区的品种或种质间可能有共同的起源。 相似文献
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土壤产嗜铁素拮抗细菌CAS15的分离鉴定 总被引:2,自引:0,他引:2
采用CAS检测平板法,从海南岛橡胶树根际土壤分离到一株产嗜铁素能力较强的菌株CAS15,并通过室内平板对峙试验研究CAS15对15个常见病害病原菌的拮抗作用.结果显示,CAS15具有较强的拮抗作用,其菌液过滤液对病原菌抑制作用较强,抑制率为19.26%~94.07%.根据菌株形态特征、培养性状、生理生化特性及16S rDNA序列分析结果,将CAS15鉴定为枯草芽孢杆菌Bacillus subtilis.质谱分析和嗜铁素分析表明,CAS15产生的嗜铁素为儿茶酚型嗜铁素(DHB-Gly-Thr)3,分子质量为881.25,且嗜铁素的产生受到铁离子的抑制,当培养基中含有50μmol/L FeCl3时,其吸光度比值(OD510/OD600)为0.001~0.01. 相似文献