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采用生物信息学方法通过比较ESTs数据和基因组数据开发了猕猴桃的双亲遗传单拷贝的EPIC标记以用于猕猴桃属植物系统发育研究。通过比较中华猕猴桃(Actinidia chinensis)和美味猕猴桃(A. deliciosa)的ESTs数据和葡萄(Vitis vinifera)基因组数据,以一致性85%为标准共检测到129个EPIC标记,并从中设计96对引物。其中21对EPIC引物在中华猕猴桃和美味猕猴桃两个商业化栽培品种中呈现稳定扩增,核酸多态性(Pi)为0.003 ~ 0.069,变异位点为0.7% ~ 14.8%,简约性信息位点为0 ~ 9.4%。用其中的EPIC-1标记重建中华猕猴桃、美味猕猴桃、毛花猕猴桃(A. eriantha)、绵毛猕猴桃(A. fulvicoma var. lanata)和金花猕猴桃(A. chrysantha)的系统发育关系,显示其跨种间扩增的实用性并获得分辨率较高的系统发育树。本研究中开发的EPIC标记可以作为通用引物用于猕猴桃属植物系统发育分析。 相似文献
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中华猕猴桃不同倍性间杂交后代倍性分离和遗传变异分析 总被引:1,自引:0,他引:1
了解不同倍性间杂交后代的倍性分离及其遗传分化规律对定向育种、多倍体种质创制及理论创新具有重要意义。利用流式细胞仪及AFLP 分子标记检测不同倍性的8 个中华猕猴桃杂交组合群体子代倍性分离及遗传分化规律。结果表明:六倍体母本‘新观2 号’与二倍体父本‘红阳’雄系和‘桂海’雄系杂交子代群体创制出新的倍性个体(3x、4x、5x、7x、8x),且杂交组合群体的遗传多样性(H:0.4166和0.4305)、Shannon 信息指数(I:0.5833 和0.6053)、多态位点百分率(P:91.18%和92.63%)均显著高于其他组合;而倍性差较小的4 个杂交组合[4x(♀)× 6x(♂)、4x(♀)× 2x(♂)、4x(♀)× 2x(♂)和2x(♀)× 4x(♂)],其基因多样性(0.3174、0.3346、0.3276 和0.3198)、Shannon 信息指数(0.4269、0.4568、0.4420 和0.4445)、多态位点百分率(71.27%、76.14%、74.72%和75.84%)水平相对较低,且创制出奇数倍性个体(5x、3x、3x)。进一步遗传分析表明,除6 号杂交组合[4x(♀)× 2x(♂)]外,绝大部分杂交组合的后代群体与母本具有更近的遗传距离。 相似文献
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